More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1870 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1870  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 344 aa  688    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  33.96 
 
 		 346 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  33.15 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  30.63 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.77 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  25.2 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4879  transcriptional regulator, LacI family  25.24 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.77144  normal  0.328602 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  23.62 
 
 		 352 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  36.72 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  35.16 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  35.25 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  35.25 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1615  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.72 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.820009  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5512  transcriptional regulator, LacI family  37.8 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0234887 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1014  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  27.75 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3585  LacI family transcription regulator  26.04 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000546261  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  45.45 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1164  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  27.75 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1186  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  27.75 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0999  LacI family transcription regulator  27.75 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1002  LacI family transcription regulator  27.75 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1118  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  27.75 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1086  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  27.75 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  32.37 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1003  LacI family transcription regulator  27.27 
 
 		 337 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  31.78 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1245  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  27.27 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0684  LacI family transcription regulator  24.22 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0236047  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1713  transcriptional regulator, LacI family  27.2 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  29.22 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0707  RegM family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000462743  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4188  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  27.75 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0837  alanine racemase  27.27 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.5 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  32.28 
 
 		 342 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5093  transcriptional regulator, LacI family  31.54 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  26.81 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  29.76 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1791  catabolite control protein A  31.2 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.42313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3723  transcriptional regulator, LacI family  27.5 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543452  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1826  catabolite control protein A  31.2 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000092301  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1296  catabolite control protein A  29.6 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.48685  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0163  transcriptional regulator, LacI family  35 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000297035  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3245  transcriptional regulator, LacI family  35.43 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  32.37 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0513  transcriptional regulator, LacI family  33.06 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1984  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.68 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5195  LacI family transcription regulator  34.68 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0544  LacI family transcription regulator  28.79 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  28.65 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0679  catabolite control protein  25.4 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.641859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  28.57 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0550  LacI family transcription regulator  30.47 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  28.57 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  28.57 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  28.57 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  28.57 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  28.57 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03609  transcriptional regulator LacI family  26.19 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.34339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  28.57 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  28.57 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5531  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  33.87 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.264023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  28.57 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  28.57 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2854  LacI family transcription regulator  26.83 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  28.57 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5426  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  33.87 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5581  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  33.87 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.44232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5525  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  33.87 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0911693  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  33.7 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  26.58 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0595  LacI family transcription regulator  32.09 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000015362  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0114  transcriptional regulator, LacI family  31.45 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0779  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.561354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  29.37 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2601  transcriptional regulator, LacI family  34.04 
 
 		 388 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3964  transcriptional regulator, LacI family  23.65 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147565  normal  0.0529978 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  34.52 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  31.54 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  28 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  31.17 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5078  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.46 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0397942  normal  0.741474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0558  transcriptional regulator, LacI family  30.6 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0784  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  28.97 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.515938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5254  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  33.87 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6854  transcriptional regulator, LacI family  28.33 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000835434  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  33.07 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7709  LacI family transcription regulator  26.77 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5652  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  33.87 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5497  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  33.87 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1812  LacI family transcription regulator  28.93 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000564911  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4844  transcriptional regulator, LacI family  30.83 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0280353  hitchhiker  0.000467686 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5083  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  33.06 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000690772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5100  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  33.06 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4111  regulatory protein LacI  20.89 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1024  LacI family transcription regulator  25.69 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  26.15 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.1 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>