More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0513 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0513  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 325 aa  674    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4066  LacI family transcription regulator  51.38 
 
 		 325 aa  361  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3954  LacI family transcription regulator  50.77 
 
 		 325 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.647552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4341  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  50.77 
 
 		 325 aa  354  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4230  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  50.77 
 
 		 325 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4113  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  50.77 
 
 		 325 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4433  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  50.77 
 
 		 325 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3965  LacI family transcription regulator  50.77 
 
 		 325 aa  353  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4286  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  50.15 
 
 		 325 aa  352  5e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4322  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  50.15 
 
 		 325 aa  351  8e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0911  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  49.54 
 
 		 325 aa  346  4e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.107654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0194  LacI family transcription regulator  50.46 
 
 		 325 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  48 
 
 		 325 aa  338  5e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.473326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0252  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  49.54 
 
 		 325 aa  334  9e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5497  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  48.31 
 
 		 325 aa  334  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5254  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  48.31 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5652  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  48.31 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0234  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  48.92 
 
 		 325 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.762891  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5083  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  47.69 
 
 		 325 aa  331  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000690772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0198  periplasmic-binding protein/LacI transcriptional regulator  48.92 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5525  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  47.35 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0911693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0208  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  48.92 
 
 		 325 aa  329  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5100  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  47.69 
 
 		 325 aa  329  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5093  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  48.62 
 
 		 325 aa  330  3e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0216  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  48.92 
 
 		 325 aa  329  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5581  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  47.38 
 
 		 325 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.44232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0227  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  48.92 
 
 		 325 aa  328  6e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0194  periplasmic-binding protein/LacI transcriptional regulator  48.92 
 
 		 325 aa  328  6e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5531  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  48.26 
 
 		 325 aa  328  7e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.264023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5426  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  47.04 
 
 		 325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5195  LacI family transcription regulator  48.58 
 
 		 325 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0232  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  48.31 
 
 		 325 aa  324  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3049  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  35.76 
 
 		 329 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.422318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3283  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  35.76 
 
 		 329 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.116085  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3274  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  35.76 
 
 		 329 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1118  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  37.42 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1186  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  37.11 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0999  LacI family transcription regulator  37.11 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1002  LacI family transcription regulator  37.11 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1086  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  37.11 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1164  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  37.11 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1245  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  37.11 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1003  LacI family transcription regulator  35.56 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4188  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  36.79 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0837  alanine racemase  35.56 
 
 		 337 aa  206  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0962  transcriptional regulator, LacI family  33.64 
 
 		 320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3082  alanine racemase  31.19 
 
 		 363 aa  192  7e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  34.76 
 
 		 337 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.57 
 
 		 330 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.46 
 
 		 331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  34.15 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  34.15 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  34.15 
 
 		 332 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  34.15 
 
 		 332 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.54 
 
 		 332 aa  179  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  33.84 
 
 		 332 aa  179  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  33.54 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  33.84 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.88 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.03 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.93 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  33.54 
 
 		 332 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  33.54 
 
 		 332 aa  176  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  33.54 
 
 		 349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1812  LacI family transcription regulator  33.55 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000564911  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  30.28 
 
 		 331 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  32.82 
 
 		 341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  27.61 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0343  transcriptional regulator, LacI family  33.85 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  35.14 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  29.27 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  30.82 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  32.53 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  33.73 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  30.18 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  29.05 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.13 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  30.5 
 
 		 339 aa  156  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1014  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  36.64 
 
 		 246 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  29.14 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3061  transcriptional regulator, LacI family  30.21 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  29.7 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  31.36 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  31.36 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.36 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.36 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  31.36 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.36 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.36 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.36 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.36 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  30.49 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0249  LacI family transcription regulator  30.79 
 
 		 345 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1481  transcriptional regulator, LacI family  31.03 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 333 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  29.7 
 
 		 333 aa  152  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 333 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  29.7 
 
 		 333 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  30.06 
 
 		 359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29 
 
 		 341 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>