More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2902 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  100 
 
 		 325 aa  682    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.473326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4066  LacI family transcription regulator  81.85 
 
 		 325 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4286  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  80.62 
 
 		 325 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4113  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  80.31 
 
 		 325 aa  574  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4433  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  80.31 
 
 		 325 aa  574  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4341  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  80 
 
 		 325 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4230  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  80.31 
 
 		 325 aa  574  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4322  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  78.15 
 
 		 325 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3954  LacI family transcription regulator  80 
 
 		 325 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.647552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3965  LacI family transcription regulator  79.69 
 
 		 325 aa  570  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0911  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  77.23 
 
 		 325 aa  565  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.107654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0513  transcriptional regulator, LacI family  48 
 
 		 325 aa  338  5e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5093  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  46.77 
 
 		 325 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0252  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  47.08 
 
 		 325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0234  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  46.46 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.762891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5525  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  47.22 
 
 		 325 aa  332  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0911693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0194  LacI family transcription regulator  47.38 
 
 		 325 aa  332  6e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5195  LacI family transcription regulator  47.22 
 
 		 325 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5254  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  46.91 
 
 		 325 aa  328  9e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5652  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  46.91 
 
 		 325 aa  328  9e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0198  periplasmic-binding protein/LacI transcriptional regulator  45.85 
 
 		 325 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5497  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  46.91 
 
 		 325 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0232  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  46.15 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5581  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  46.6 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.44232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0194  periplasmic-binding protein/LacI transcriptional regulator  45.54 
 
 		 325 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0227  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  45.54 
 
 		 325 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5426  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  45.99 
 
 		 325 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0208  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  45.54 
 
 		 325 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0216  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  45.54 
 
 		 325 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5083  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  46.3 
 
 		 325 aa  324  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000690772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5531  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  46.63 
 
 		 325 aa  323  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.264023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5100  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  45.99 
 
 		 325 aa  322  6e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1003  LacI family transcription regulator  38.74 
 
 		 337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1245  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  38.41 
 
 		 337 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1186  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  38.41 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0999  LacI family transcription regulator  38.41 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1002  LacI family transcription regulator  38.41 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1086  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  38.41 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1164  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  38.41 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4188  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  38.41 
 
 		 338 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1118  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  38.41 
 
 		 337 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0837  alanine racemase  37.75 
 
 		 337 aa  209  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0962  transcriptional regulator, LacI family  33.95 
 
 		 320 aa  202  5e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3049  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  35.69 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.422318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3283  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  35.69 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.116085  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3274  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  35.69 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3082  alanine racemase  35.49 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.01 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  33.55 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  32.7 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  30.42 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  32.52 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0779  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.63 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.561354  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  31.71 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  31.71 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.51 
 
 		 337 aa  165  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.58 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.23 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1273  transcriptional regulator, LacI family  31.8 
 
 		 326 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  30.94 
 
 		 334 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  31.1 
 
 		 333 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  31.1 
 
 		 333 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  31.1 
 
 		 333 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  31.1 
 
 		 333 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0121  LacI family transcription regulator  30.65 
 
 		 335 aa  162  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0425024  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  28.79 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3061  transcriptional regulator, LacI family  31.5 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1243  LacI family transcription regulator  30.28 
 
 		 339 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  32.11 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0294  LacI family transcription regulator  31.63 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.28119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.09 
 
 		 335 aa  159  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.83 
 
 		 328 aa  159  9e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  29.61 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0276  LacI family transcription regulator  29.3 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2680  alanine racemase  29.97 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.769144  normal  0.967228 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  31.23 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.31 
 
 		 341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  29.45 
 
 		 335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  30.32 
 
 		 335 aa  156  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1014  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  35.32 
 
 		 246 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  31.31 
 
 		 352 aa  155  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.37 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  30.37 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.37 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.37 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  30.37 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.37 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.37 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.37 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.37 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  30.49 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.06 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.7 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.18 
 
 		 333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.37 
 
 		 332 aa  153  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  31.99 
 
 		 355 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  32.13 
 
 		 339 aa  152  7e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  28.18 
 
 		 333 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  28.88 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>