More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0114 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0114  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 341 aa  692    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0061  LacI family transcription regulator  34.82 
 
 		 344 aa  205  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2564  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 		 339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3380  transcriptional regulator PtxS  33.83 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2378  regulatory protein, LacI  33.83 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2567  LacI family transcription regulator  31.86 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0275  LacI family transcription regulator  31.96 
 
 		 361 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0171  LacI family transcription regulator  34.42 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3703  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.53 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1738  LacI family transcription regulator  32.06 
 
 		 358 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.274916  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26870  transcriptional regulator PtxS  30.88 
 
 		 340 aa  186  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677113  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0693  transcriptional regulator, LacI family  31.03 
 
 		 354 aa  185  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0403  GalR family transcription regulator  37.97 
 
 		 337 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0759  transcriptional regulator, LacI family  30.75 
 
 		 354 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.153259 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0407  LacI family transcription regulator  37.97 
 
 		 337 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.210448  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1493  regulatory protein, LacI  31.76 
 
 		 376 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1651  LacI family transcription regulator  31.2 
 
 		 347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1651  LacI family transcription regulator  31.2 
 
 		 347 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2981  transcriptional regulator PtxS  30.29 
 
 		 340 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35370  transcriptional regulator PtxS  30.29 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118446  normal  0.0830147 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0484  LacI family transcription regulator  35.59 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0965  LacI family transcription regulator  30.9 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2285  LacI family transcription regulator  30.9 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2830  transcriptional regulator, LacI family  30.95 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2299  LacI family transcription regulator  30.92 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2093  LacI family transcription regulator  30.9 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2150  LacI family transcription regulator  30.9 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5026  LacI family transcription regulator  30.03 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1250  LacI family transcription regulator  32.19 
 
 		 356 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2900  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3412  transcriptional regulator, LacI family  30.77 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1482  transcriptional regulator, LacI family  32.01 
 
 		 337 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1743  LacI family transcription regulator  29.45 
 
 		 348 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79777  normal  0.50897 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6349  LacI family transcription regulator  29.24 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1729  LacI family transcription regulator  29.24 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1983  LacI family transcription regulator  31.55 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104986 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1529  LacI family transcription regulator  29.24 
 
 		 347 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.98616  normal  0.839967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2275  transcriptional regulator, LacI family  31.09 
 
 		 362 aa  165  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0794  LacI family transcription regulator  29.55 
 
 		 339 aa  162  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0417873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  32.08 
 
 		 338 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0498  LacI family transcription regulator  32.53 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0182598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  28.41 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  27.37 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1984  LacI family transcription regulator  29.15 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  28.4 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1668  LacI family transcription regulator  29.91 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012495  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1808  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  31.02 
 
 		 327 aa  152  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.379781  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  30.4 
 
 		 347 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.86 
 
 		 352 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  30.59 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0292  LacI family transcription regulator  30.52 
 
 		 341 aa  150  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00151755  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5553  transcriptional regulator LacI family  28.24 
 
 		 356 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539573  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  29.52 
 
 		 349 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  32.44 
 
 		 386 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  30.36 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1896  sugar-binding transcriptional regulator RegR  31.01 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.150149  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  29.12 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.16 
 
 		 336 aa  146  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  30.33 
 
 		 346 aa  146  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  25.83 
 
 		 353 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  25.53 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5418  transcriptional regulator, LacI family  25.94 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263593 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1599  LacI family transcription regulator  30.84 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  26.84 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  26.95 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  28.06 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  28.06 
 
 		 337 aa  136  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7934  putative LacI-family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 335 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  31.86 
 
 		 335 aa  136  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  28.61 
 
 		 348 aa  136  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  29.74 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5122  transcriptional regulator, LacI family  26.88 
 
 		 356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.135885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  27.76 
 
 		 334 aa  135  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00486  transcriptional regulator LacI family  27.81 
 
 		 331 aa  135  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1984  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.27 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2601  transcriptional regulator, LacI family  26.11 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  32.65 
 
 		 335 aa  133  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1460  transcriptional regulator, LacI family  26.04 
 
 		 356 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0141269 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  29.85 
 
 		 333 aa  132  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1419  transcriptional regulator, LacI family  26.04 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.933801  normal  0.184887 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1790  transcription regulator protein  24.85 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.678671  normal  0.041815 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.35 
 
 		 335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  27.6 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3620  transcriptional regulator, LacI family  25.15 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1598  LacI family transcription regulator  30.65 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0971431  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  25 
 
 		 354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3654  LacI family transcription regulator  27.71 
 
 		 354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1973  LacI family transcription regulator  26.79 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.768247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  29.13 
 
 		 368 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  25.52 
 
 		 339 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5883  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.36 
 
 		 356 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.92391 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.04 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  28.53 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4573  LacI family transcription regulator  25.9 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0936264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  27.35 
 
 		 329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0159  transcriptional regulator, LacI family  27.38 
 
 		 337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.169284 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0168  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.42 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  22.98 
 
 		 334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3400  transcriptional regulator, LacI family  25.52 
 
 		 338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.125574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>