More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_26870 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_26870  transcriptional regulator PtxS  100 
 
 		 340 aa  686    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35370  transcriptional regulator PtxS  78.24 
 
 		 340 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118446  normal  0.0830147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2981  transcriptional regulator PtxS  77.35 
 
 		 340 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2378  regulatory protein, LacI  72.59 
 
 		 339 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3380  transcriptional regulator PtxS  72.59 
 
 		 339 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2567  LacI family transcription regulator  70.78 
 
 		 340 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2564  LacI family transcription regulator  72.64 
 
 		 339 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2900  LacI family transcription regulator  67.56 
 
 		 341 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0275  LacI family transcription regulator  49.1 
 
 		 361 aa  293  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0061  LacI family transcription regulator  46.29 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0171  LacI family transcription regulator  45.24 
 
 		 338 aa  281  9e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1738  LacI family transcription regulator  42.48 
 
 		 358 aa  255  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.274916  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3412  transcriptional regulator, LacI family  43.28 
 
 		 342 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3703  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.52 
 
 		 338 aa  249  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1493  regulatory protein, LacI  40.88 
 
 		 376 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0693  transcriptional regulator, LacI family  42.98 
 
 		 354 aa  238  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1651  LacI family transcription regulator  43.31 
 
 		 347 aa  235  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1651  LacI family transcription regulator  43.31 
 
 		 347 aa  235  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5026  LacI family transcription regulator  42.44 
 
 		 347 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0965  LacI family transcription regulator  41.46 
 
 		 347 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2285  LacI family transcription regulator  41.46 
 
 		 347 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2093  LacI family transcription regulator  41.46 
 
 		 347 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2150  LacI family transcription regulator  41.46 
 
 		 347 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0759  transcriptional regulator, LacI family  42.61 
 
 		 354 aa  232  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.153259 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1250  LacI family transcription regulator  41.29 
 
 		 356 aa  232  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2299  LacI family transcription regulator  41.03 
 
 		 347 aa  229  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1529  LacI family transcription regulator  42.09 
 
 		 347 aa  229  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.98616  normal  0.839967 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6349  LacI family transcription regulator  41.19 
 
 		 347 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1729  LacI family transcription regulator  41.19 
 
 		 347 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1743  LacI family transcription regulator  41.08 
 
 		 348 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79777  normal  0.50897 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1983  LacI family transcription regulator  38.89 
 
 		 360 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2275  transcriptional regulator, LacI family  39.09 
 
 		 362 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1808  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  30.28 
 
 		 327 aa  190  4e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.379781  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0114  transcriptional regulator, LacI family  30.88 
 
 		 341 aa  186  4e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1482  transcriptional regulator, LacI family  32.24 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 338 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  36.31 
 
 		 333 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  35.63 
 
 		 348 aa  179  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.15 
 
 		 336 aa  179  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  35.84 
 
 		 335 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  31.93 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5553  transcriptional regulator LacI family  33.43 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539573  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  34.04 
 
 		 334 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  29.29 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  32.85 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 		 354 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.93 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  32.24 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  34.74 
 
 		 353 aa  166  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  30.7 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2830  transcriptional regulator, LacI family  32.33 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9131  transcriptional regulator LacI family  33.43 
 
 		 356 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 346 aa  162  8.000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  32.93 
 
 		 334 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  32.69 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  30.4 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00486  transcriptional regulator LacI family  32.84 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  35.01 
 
 		 337 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  32.54 
 
 		 340 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  33.43 
 
 		 336 aa  159  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  30.86 
 
 		 336 aa  159  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  32.24 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6552  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  32.75 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  hitchhiker  0.0000198251 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  34.74 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  32.24 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 346 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  32.62 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.04 
 
 		 356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  33.93 
 
 		 330 aa  155  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  29 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  35.52 
 
 		 357 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  29.7 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  32.14 
 
 		 339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  29.48 
 
 		 336 aa  153  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  31.9 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  31.38 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  33.01 
 
 		 346 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.08 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  31.9 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  31.38 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  31.9 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  32.69 
 
 		 346 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  31.08 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  30.93 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  31.31 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  30.93 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  31.9 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4042  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.99 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.88 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  31.6 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  31.6 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  32.84 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1186  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 		 358 aa  149  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0882106  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  32.05 
 
 		 340 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  33.33 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  31.08 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  31.23 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  31.29 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>