More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1250 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1250  LacI family transcription regulator  100 
 
 
356 aa  720    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101547  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2275  transcriptional regulator, LacI family  75.41 
 
 
362 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1983  LacI family transcription regulator  71.58 
 
 
360 aa  508  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0759  transcriptional regulator, LacI family  64.79 
 
 
354 aa  461  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.153259 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0693  transcriptional regulator, LacI family  65.63 
 
 
354 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5026  LacI family transcription regulator  68.12 
 
 
347 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0965  LacI family transcription regulator  64.69 
 
 
347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2285  LacI family transcription regulator  64.69 
 
 
347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2093  LacI family transcription regulator  64.69 
 
 
347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2150  LacI family transcription regulator  64.69 
 
 
347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2299  LacI family transcription regulator  64.69 
 
 
347 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1651  LacI family transcription regulator  64.97 
 
 
347 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1529  LacI family transcription regulator  67.99 
 
 
347 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.98616  normal  0.839967 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1651  LacI family transcription regulator  64.97 
 
 
347 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6349  LacI family transcription regulator  66.38 
 
 
347 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1729  LacI family transcription regulator  66.38 
 
 
347 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1743  LacI family transcription regulator  66.2 
 
 
348 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79777  normal  0.50897 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0171  LacI family transcription regulator  47.41 
 
 
338 aa  308  8e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0061  LacI family transcription regulator  44.44 
 
 
344 aa  300  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2900  LacI family transcription regulator  42.41 
 
 
341 aa  239  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26870  transcriptional regulator PtxS  41.29 
 
 
340 aa  232  9e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677113  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3703  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.48 
 
 
338 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2981  transcriptional regulator PtxS  42.49 
 
 
340 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35370  transcriptional regulator PtxS  42.49 
 
 
340 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118446  normal  0.0830147 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0275  LacI family transcription regulator  42.33 
 
 
361 aa  226  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3412  transcriptional regulator, LacI family  40.92 
 
 
342 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2564  LacI family transcription regulator  41.74 
 
 
339 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3380  transcriptional regulator PtxS  42.65 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2378  regulatory protein, LacI  42.65 
 
 
339 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1493  regulatory protein, LacI  39.94 
 
 
376 aa  219  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1738  LacI family transcription regulator  38.75 
 
 
358 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.274916  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2567  LacI family transcription regulator  40.17 
 
 
340 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335258  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0114  transcriptional regulator, LacI family  32.19 
 
 
341 aa  177  4e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1482  transcriptional regulator, LacI family  31.05 
 
 
337 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  31.05 
 
 
338 aa  165  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  33.62 
 
 
349 aa  156  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  28.65 
 
 
340 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  32.95 
 
 
346 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1808  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  28.44 
 
 
327 aa  149  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.379781  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  34.49 
 
 
333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0292  LacI family transcription regulator  28.29 
 
 
341 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00151755  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0407  LacI family transcription regulator  26.92 
 
 
337 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.210448  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.38 
 
 
336 aa  143  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  31.12 
 
 
347 aa  143  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.82 
 
 
330 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  31.27 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  26.61 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0403  GalR family transcription regulator  27.38 
 
 
337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2830  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 
335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.81 
 
 
352 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  38.54 
 
 
347 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  27.3 
 
 
324 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 
353 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  31.49 
 
 
333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  26.82 
 
 
336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  28.83 
 
 
334 aa  135  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  30.79 
 
 
340 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1696  transcriptional regulator, LacI family  30.99 
 
 
342 aa  135  9e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  30.46 
 
 
330 aa  135  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  31.21 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  30.65 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  36.1 
 
 
346 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  30.11 
 
 
346 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  30.49 
 
 
340 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  31.62 
 
 
331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  29.51 
 
 
333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  31.91 
 
 
326 aa  133  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1880  LacI family transcription regulator  30.95 
 
 
335 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  26.3 
 
 
336 aa  132  9e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  31.31 
 
 
348 aa  132  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  30.09 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  28.49 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  37.07 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  30.86 
 
 
339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  28.92 
 
 
333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  28.2 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  29.85 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  28.83 
 
 
334 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  30.61 
 
 
343 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4253  LacI family transcription regulator  32.28 
 
 
354 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  29.68 
 
 
343 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5940  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 
347 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146898  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.53 
 
 
338 aa  129  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  29.89 
 
 
335 aa  129  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  31.69 
 
 
342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4042  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.88 
 
 
338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  29.97 
 
 
343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2742  transcriptional regulator, LacI family  32.52 
 
 
331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0297688  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  29.97 
 
 
343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  29.97 
 
 
343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  27.95 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  29.91 
 
 
343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  29.97 
 
 
343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  29.91 
 
 
343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3107  transcriptional regulator, LacI family  32.83 
 
 
331 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  27.76 
 
 
332 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  27.59 
 
 
323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.87 
 
 
323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  27.22 
 
 
331 aa  126  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0300  transcriptional regulator, LacI family  29.8 
 
 
339 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>