More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3703 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3703  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  100 
 
 		 338 aa  702    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0061  LacI family transcription regulator  43.47 
 
 		 344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0171  LacI family transcription regulator  40.91 
 
 		 338 aa  266  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26870  transcriptional regulator PtxS  39.52 
 
 		 340 aa  249  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677113  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2981  transcriptional regulator PtxS  38.62 
 
 		 340 aa  248  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2564  LacI family transcription regulator  39.51 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35370  transcriptional regulator PtxS  38.62 
 
 		 340 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118446  normal  0.0830147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2378  regulatory protein, LacI  39.7 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3380  transcriptional regulator PtxS  39.7 
 
 		 339 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2567  LacI family transcription regulator  38.82 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2900  LacI family transcription regulator  38.21 
 
 		 341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1250  LacI family transcription regulator  39.48 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1983  LacI family transcription regulator  39.94 
 
 		 360 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104986 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0275  LacI family transcription regulator  37.61 
 
 		 361 aa  227  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5026  LacI family transcription regulator  40.12 
 
 		 347 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0693  transcriptional regulator, LacI family  39.58 
 
 		 354 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2299  LacI family transcription regulator  39.53 
 
 		 347 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2275  transcriptional regulator, LacI family  37.68 
 
 		 362 aa  219  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0759  transcriptional regulator, LacI family  39.17 
 
 		 354 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.153259 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0965  LacI family transcription regulator  38.46 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2285  LacI family transcription regulator  38.46 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2093  LacI family transcription regulator  38.46 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2150  LacI family transcription regulator  38.46 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1651  LacI family transcription regulator  38.76 
 
 		 347 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1651  LacI family transcription regulator  38.76 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1529  LacI family transcription regulator  38.46 
 
 		 347 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.98616  normal  0.839967 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6349  LacI family transcription regulator  38.46 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1729  LacI family transcription regulator  38.46 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1743  LacI family transcription regulator  38.35 
 
 		 348 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79777  normal  0.50897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1738  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 358 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.274916  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3412  transcriptional regulator, LacI family  34.22 
 
 		 342 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1493  regulatory protein, LacI  32.44 
 
 		 376 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0114  transcriptional regulator, LacI family  34.53 
 
 		 341 aa  187  3e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  30.82 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  30.93 
 
 		 347 aa  169  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  31.4 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  31.67 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.91 
 
 		 352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1482  transcriptional regulator, LacI family  29.52 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  30.47 
 
 		 335 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00486  transcriptional regulator LacI family  30.21 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5553  transcriptional regulator LacI family  28.78 
 
 		 356 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539573  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1668  LacI family transcription regulator  32.54 
 
 		 335 aa  160  4e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012495  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1973  LacI family transcription regulator  29.61 
 
 		 341 aa  159  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.768247  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  30.42 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2830  transcriptional regulator, LacI family  28.96 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0794  LacI family transcription regulator  30.52 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0417873  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  29.25 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  29.09 
 
 		 333 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.93 
 
 		 336 aa  156  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0407  LacI family transcription regulator  29.71 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.210448  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0403  GalR family transcription regulator  28.7 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  29.61 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  29 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  28.22 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  28.01 
 
 		 331 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  28.4 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3984  transcriptional regulator, LacI family  29.85 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1186  transcriptional regulator, LacI family  28.92 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0882106  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0802  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.22 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3107  transcriptional regulator, LacI family  31.66 
 
 		 331 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  30.79 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  30.12 
 
 		 338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  32.16 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.57 
 
 		 330 aa  146  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  27.11 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  27.93 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0498  LacI family transcription regulator  28.35 
 
 		 325 aa  144  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0182598  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0609  alanine racemase  28.96 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1785  LacI family transcription regulator  28.35 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2742  transcriptional regulator, LacI family  31.35 
 
 		 331 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0297688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0432  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.35 
 
 		 334 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0484  LacI family transcription regulator  29.31 
 
 		 335 aa  142  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4247  alanine racemase  28.7 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.645123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  29.67 
 
 		 343 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  29.67 
 
 		 343 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  29.67 
 
 		 343 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  27.46 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  29.22 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1696  transcriptional regulator, LacI family  28.15 
 
 		 342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  29.67 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  28.89 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1009  transcriptional regulator, LacI family  27.33 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285853 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  28.78 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  28.02 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.88 
 
 		 356 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0710  transcriptional regulator, LacI family  32.02 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0832389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  28.78 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3944  transcriptional regulator, LacI family  29.28 
 
 		 346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  28.78 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  28.78 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2662  LacI family transcription regulator  27.49 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767927 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1808  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  28.79 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.379781  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4388  LacI family transcription regulator  29.56 
 
 		 329 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  27.03 
 
 		 349 aa  140  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4475  LacI family transcription regulator  29.56 
 
 		 329 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4769  LacI family transcription regulator  29.56 
 
 		 329 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  29.38 
 
 		 343 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>