More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1668 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1668  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 335 aa  686    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012495  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0498  LacI family transcription regulator  38.32 
 
 		 325 aa  241  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0182598  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0794  LacI family transcription regulator  35.52 
 
 		 339 aa  216  5.9999999999999996e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0417873  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0407  LacI family transcription regulator  33.55 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.210448  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0403  GalR family transcription regulator  33.23 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3703  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.54 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0061  LacI family transcription regulator  29.76 
 
 		 344 aa  156  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0114  transcriptional regulator, LacI family  29.91 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1808  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  30.24 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.379781  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2830  transcriptional regulator, LacI family  29.38 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26870  transcriptional regulator PtxS  29.17 
 
 		 340 aa  142  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677113  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  28.25 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0171  LacI family transcription regulator  29.15 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1896  sugar-binding transcriptional regulator RegR  28.57 
 
 		 333 aa  139  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.150149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1482  transcriptional regulator, LacI family  29.15 
 
 		 337 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3412  transcriptional regulator, LacI family  27.76 
 
 		 342 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0484  LacI family transcription regulator  28.06 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  27.92 
 
 		 368 aa  136  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2981  transcriptional regulator PtxS  28.11 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  29.02 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1738  LacI family transcription regulator  28.53 
 
 		 358 aa  132  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.274916  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35370  transcriptional regulator PtxS  27.81 
 
 		 340 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118446  normal  0.0830147 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  26.33 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.25 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2564  LacI family transcription regulator  27.93 
 
 		 339 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  27.13 
 
 		 348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  28.75 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  30.77 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1493  regulatory protein, LacI  28.93 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3542  transcriptional regulator, LacI family  27.71 
 
 		 335 aa  126  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4042  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29 
 
 		 338 aa  126  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3380  transcriptional regulator PtxS  27.25 
 
 		 339 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0275  LacI family transcription regulator  26.71 
 
 		 361 aa  125  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2378  regulatory protein, LacI  27.25 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  26.81 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  26.81 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2567  LacI family transcription regulator  26.81 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  27.85 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1250  LacI family transcription regulator  26.95 
 
 		 356 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  28.84 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  27.38 
 
 		 337 aa  122  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0292  LacI family transcription regulator  26.88 
 
 		 341 aa  122  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00151755  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  26.5 
 
 		 343 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  27.06 
 
 		 327 aa  121  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0012  transcriptional regulator, LacI family  29.32 
 
 		 332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.294496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.51 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  26.67 
 
 		 343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  27.55 
 
 		 346 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5553  transcriptional regulator LacI family  27.7 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539573  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 346 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2900  LacI family transcription regulator  25.99 
 
 		 341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1005  transcriptional regulator, LacI family  25.23 
 
 		 336 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  26.77 
 
 		 343 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  26.77 
 
 		 343 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  26.77 
 
 		 343 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  27.44 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  28.06 
 
 		 332 aa  119  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0125  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 253 aa  119  7e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  26.25 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5883  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.82 
 
 		 356 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.92391 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  27.07 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  26.85 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  27.64 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.25 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5122  transcriptional regulator, LacI family  26.36 
 
 		 356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.135885 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  26.81 
 
 		 346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  27.27 
 
 		 331 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  27.78 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2074  transcriptional regulator, LacI family  24.4 
 
 		 338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  26.15 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1983  LacI family transcription regulator  25.94 
 
 		 360 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104986 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  24.92 
 
 		 386 aa  116  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  26.52 
 
 		 347 aa  116  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  26.88 
 
 		 346 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  28.49 
 
 		 353 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4610  transcriptional regulator, LacI family  29.71 
 
 		 351 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  26.81 
 
 		 343 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  26.81 
 
 		 343 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  26.81 
 
 		 343 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  26.81 
 
 		 343 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  25.97 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2275  transcriptional regulator, LacI family  25.79 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  29.68 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  29.68 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  26.45 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  28.05 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  28.91 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  28.4 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  28.8 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  28.8 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  28.8 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  28.8 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  29.35 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  29.35 
 
 		 323 aa  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  27.87 
 
 		 337 aa  112  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0058  LacI family transcription regulator  25.15 
 
 		 338 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.05 
 
 		 333 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0811  sucrose operon repressor  27.78 
 
 		 328 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1984  LacI family transcription regulator  27.99 
 
 		 360 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  26.05 
 
 		 333 aa  112  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>