More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2830 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2830  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 335 aa  677    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0114  transcriptional regulator, LacI family  30.95 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0693  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 354 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1482  transcriptional regulator, LacI family  34.5 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2981  transcriptional regulator PtxS  31.91 
 
 		 340 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35370  transcriptional regulator PtxS  31.61 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118446  normal  0.0830147 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3412  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2564  LacI family transcription regulator  32.34 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0061  LacI family transcription regulator  28.87 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26870  transcriptional regulator PtxS  32.33 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677113  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2378  regulatory protein, LacI  31.33 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0759  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 		 354 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.153259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2900  LacI family transcription regulator  31.31 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.14 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3380  transcriptional regulator PtxS  31.33 
 
 		 339 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  33.14 
 
 		 338 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2567  LacI family transcription regulator  31.64 
 
 		 340 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5026  LacI family transcription regulator  32.44 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3703  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.96 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  34.04 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  33.93 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.04 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1896  sugar-binding transcriptional regulator RegR  26.87 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.150149  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  31.94 
 
 		 346 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0498  LacI family transcription regulator  29.09 
 
 		 325 aa  150  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0182598  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0171  LacI family transcription regulator  28.78 
 
 		 338 aa  150  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5883  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.03 
 
 		 356 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.92391 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6349  LacI family transcription regulator  30.95 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1729  LacI family transcription regulator  30.95 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  29.12 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1743  LacI family transcription regulator  31.86 
 
 		 348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79777  normal  0.50897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1493  regulatory protein, LacI  29.85 
 
 		 376 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  28.18 
 
 		 341 aa  145  7.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  27.65 
 
 		 347 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  28.62 
 
 		 340 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2299  LacI family transcription regulator  31.38 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1738  LacI family transcription regulator  30.15 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.274916  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1668  LacI family transcription regulator  29.38 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012495  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  30.18 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00486  transcriptional regulator LacI family  32.01 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  31.23 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5553  transcriptional regulator LacI family  27.86 
 
 		 356 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539573  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1529  LacI family transcription regulator  30.26 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.98616  normal  0.839967 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1651  LacI family transcription regulator  31.55 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  30.47 
 
 		 368 aa  143  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  30.75 
 
 		 334 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  32.42 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1651  LacI family transcription regulator  31.55 
 
 		 347 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0058  LacI family transcription regulator  33.12 
 
 		 338 aa  142  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  30.03 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  33.03 
 
 		 335 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0965  LacI family transcription regulator  30.41 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2285  LacI family transcription regulator  30.41 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2093  LacI family transcription regulator  30.41 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2150  LacI family transcription regulator  30.41 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0407  LacI family transcription regulator  25.33 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.210448  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0403  GalR family transcription regulator  25.66 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  28.89 
 
 		 344 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  35.37 
 
 		 334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.7 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1250  LacI family transcription regulator  28.61 
 
 		 356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  31.31 
 
 		 355 aa  139  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  30.19 
 
 		 343 aa  140  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  28.31 
 
 		 337 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1983  LacI family transcription regulator  28.65 
 
 		 360 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  30.91 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  27 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.36 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1808  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  24.92 
 
 		 327 aa  136  5e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.379781  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2662  LacI family transcription regulator  31.91 
 
 		 328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767927 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  31.74 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4620  transcriptional regulator, LacI family  31.33 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2511  transcriptional regulator, LacI family  32.42 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.23 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.25 
 
 		 331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2332  transcriptional regulator, LacI family  34.01 
 
 		 349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.302779  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  30.36 
 
 		 333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  30.84 
 
 		 332 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1486  transcriptional regulator, LacI family  31.21 
 
 		 334 aa  132  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.479144 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  30.84 
 
 		 332 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  30.37 
 
 		 365 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  31.04 
 
 		 337 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  30.84 
 
 		 332 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  30.84 
 
 		 332 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1413  LacI family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 341 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.492871  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2074  transcriptional regulator, LacI family  28.85 
 
 		 338 aa  132  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3070  LacI family transcription regulator  32.41 
 
 		 338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3688  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  30.84 
 
 		 331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1216  LacI family transcription regulator  32.41 
 
 		 338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129549  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0651  LacI family transcription regulator  32.41 
 
 		 338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1420  LacI family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0502  LacI family transcription regulator  32.41 
 
 		 338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  30.15 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  30.84 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5940  transcriptional regulator, LacI family  30.09 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146898  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0275  LacI family transcription regulator  32.65 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5754  transcriptional regulator, LacI family  29.64 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.597528  normal  0.0761262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>