More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1896 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1896  sugar-binding transcriptional regulator RegR  100 
 
 		 333 aa  691    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.150149  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0407  LacI family transcription regulator  46.53 
 
 		 337 aa  301  8.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.210448  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0403  GalR family transcription regulator  46.53 
 
 		 337 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0012  transcriptional regulator, LacI family  41.09 
 
 		 332 aa  269  5e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.294496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0061  LacI family transcription regulator  28.4 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  31.95 
 
 		 338 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  30.18 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.29 
 
 		 336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1482  transcriptional regulator, LacI family  31.75 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35370  transcriptional regulator PtxS  28.4 
 
 		 340 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118446  normal  0.0830147 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  31.82 
 
 		 348 aa  159  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1493  regulatory protein, LacI  28.49 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2981  transcriptional regulator PtxS  28.4 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 335 aa  155  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0171  LacI family transcription regulator  26.41 
 
 		 338 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  27.71 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  28.78 
 
 		 346 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2830  transcriptional regulator, LacI family  26.87 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  30.09 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6362  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 		 349 aa  152  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  30.18 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2900  LacI family transcription regulator  27.07 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2564  LacI family transcription regulator  27.3 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  30.51 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  28.78 
 
 		 346 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  28.16 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0794  LacI family transcription regulator  28.02 
 
 		 339 aa  150  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0417873  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.74 
 
 		 333 aa  149  8e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  29 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  31.74 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0114  transcriptional regulator, LacI family  31.01 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  27.78 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2710  regulatory protein, LacI  29.62 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91732  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1738  LacI family transcription regulator  27.14 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.274916  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.66 
 
 		 352 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2261  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.25 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.276208 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3412  transcriptional regulator, LacI family  26.27 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  28.19 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26870  transcriptional regulator PtxS  24.24 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677113  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 346 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.06 
 
 		 342 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0292  LacI family transcription regulator  28.06 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00151755  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.06 
 
 		 342 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2567  LacI family transcription regulator  25.08 
 
 		 340 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  26.87 
 
 		 346 aa  142  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  27.27 
 
 		 341 aa  142  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3380  transcriptional regulator PtxS  26.35 
 
 		 339 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.96 
 
 		 330 aa  142  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.09 
 
 		 332 aa  142  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2378  regulatory protein, LacI  26.35 
 
 		 339 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  29.7 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  29.39 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1248  transcriptional regulator, LacI family  29.65 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0782052 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  31.86 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  29.39 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  29.7 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  29.7 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  29.7 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.7 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1808  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  32.48 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.379781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  29.39 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  29.39 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  30.7 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  29.39 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  26.73 
 
 		 334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  28.06 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.42 
 
 		 339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  24.26 
 
 		 354 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  30.79 
 
 		 336 aa  139  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  27.44 
 
 		 339 aa  139  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1668  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 335 aa  139  7e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012495  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0498  LacI family transcription regulator  27.45 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0182598  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  26.67 
 
 		 337 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1148  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.73 
 
 		 336 aa  139  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.907007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3761  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.94 
 
 		 338 aa  139  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.193562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  29.61 
 
 		 337 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9131  transcriptional regulator LacI family  26.59 
 
 		 356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1009  transcriptional regulator, LacI family  27.14 
 
 		 345 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285853 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  26.86 
 
 		 337 aa  137  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  27.49 
 
 		 340 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  27.79 
 
 		 340 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5512  transcriptional regulator, LacI family  27.7 
 
 		 340 aa  135  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0234887 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.43 
 
 		 337 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  27.58 
 
 		 353 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  27.54 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  29.97 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0693  transcriptional regulator, LacI family  26.93 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1984  LacI family transcription regulator  25.62 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.05 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  27.33 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1598  LacI family transcription regulator  30.65 
 
 		 333 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0971431  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  27.36 
 
 		 340 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0058  LacI family transcription regulator  24.6 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.96 
 
 		 341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5553  transcriptional regulator LacI family  25.22 
 
 		 356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539573  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0759  transcriptional regulator, LacI family  25.66 
 
 		 354 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.153259 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.63 
 
 		 337 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  25.68 
 
 		 348 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  24.53 
 
 		 353 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2299  LacI family transcription regulator  23.68 
 
 		 347 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>