More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0061 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0061  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 344 aa  707    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0171  LacI family transcription regulator  74.03 
 
 		 338 aa  523  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5026  LacI family transcription regulator  46.13 
 
 		 347 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2981  transcriptional regulator PtxS  46.71 
 
 		 340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35370  transcriptional regulator PtxS  45.81 
 
 		 340 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118446  normal  0.0830147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2564  LacI family transcription regulator  45.81 
 
 		 339 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1529  LacI family transcription regulator  46.15 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.98616  normal  0.839967 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1651  LacI family transcription regulator  45.83 
 
 		 347 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1250  LacI family transcription regulator  44.44 
 
 		 356 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0693  transcriptional regulator, LacI family  44.87 
 
 		 354 aa  299  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1651  LacI family transcription regulator  45.83 
 
 		 347 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2299  LacI family transcription regulator  44.94 
 
 		 347 aa  295  9e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1983  LacI family transcription regulator  45.17 
 
 		 360 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6349  LacI family transcription regulator  46.43 
 
 		 347 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1729  LacI family transcription regulator  46.43 
 
 		 347 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2275  transcriptional regulator, LacI family  43.98 
 
 		 362 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1743  LacI family transcription regulator  45.72 
 
 		 348 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79777  normal  0.50897 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0965  LacI family transcription regulator  45.24 
 
 		 347 aa  292  7e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2285  LacI family transcription regulator  45.24 
 
 		 347 aa  292  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0759  transcriptional regulator, LacI family  43.99 
 
 		 354 aa  292  7e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.153259 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2093  LacI family transcription regulator  45.24 
 
 		 347 aa  292  7e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2150  LacI family transcription regulator  45.24 
 
 		 347 aa  292  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3703  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.47 
 
 		 338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26870  transcriptional regulator PtxS  46.29 
 
 		 340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677113  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3380  transcriptional regulator PtxS  44.41 
 
 		 339 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2378  regulatory protein, LacI  44.41 
 
 		 339 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2900  LacI family transcription regulator  43.11 
 
 		 341 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2567  LacI family transcription regulator  44.11 
 
 		 340 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1738  LacI family transcription regulator  39.02 
 
 		 358 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.274916  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0275  LacI family transcription regulator  43.41 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1493  regulatory protein, LacI  40 
 
 		 376 aa  263  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3412  transcriptional regulator, LacI family  41.49 
 
 		 342 aa  262  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0114  transcriptional regulator, LacI family  34.82 
 
 		 341 aa  205  8e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  33.13 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  34.53 
 
 		 333 aa  182  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0407  LacI family transcription regulator  30.7 
 
 		 337 aa  179  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.210448  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0403  GalR family transcription regulator  30.38 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1896  sugar-binding transcriptional regulator RegR  28.4 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.150149  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.71 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  31.09 
 
 		 347 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0484  LacI family transcription regulator  32.43 
 
 		 335 aa  176  7e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  29.36 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  31.94 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  30.54 
 
 		 343 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  30.54 
 
 		 343 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  30.09 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  30.54 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  30.15 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  32.84 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1808  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  28.36 
 
 		 327 aa  170  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.379781  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  29.85 
 
 		 343 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  29.85 
 
 		 343 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  29.85 
 
 		 343 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5553  transcriptional regulator LacI family  30.03 
 
 		 356 aa  169  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539573  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  33.96 
 
 		 355 aa  169  8e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  30.5 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  30.79 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4253  LacI family transcription regulator  34.62 
 
 		 354 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  30.5 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  30.5 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  30.5 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1482  transcriptional regulator, LacI family  27.63 
 
 		 337 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  30.43 
 
 		 346 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  30.03 
 
 		 331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  31.85 
 
 		 353 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  31.12 
 
 		 340 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  30.42 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2742  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0297688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2830  transcriptional regulator, LacI family  28.87 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  30.43 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  31.12 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1186  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 358 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0882106  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  30.99 
 
 		 357 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  31.04 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  30.17 
 
 		 346 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  32.33 
 
 		 334 aa  162  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  29.13 
 
 		 329 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  29.94 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.82 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.02 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  30.3 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  30.47 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  32.53 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  29.82 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  32.38 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  30.41 
 
 		 337 aa  159  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  30.38 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3107  transcriptional regulator, LacI family  32.43 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  32.65 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  30.12 
 
 		 346 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  31.38 
 
 		 340 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  29.33 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  29.82 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.42 
 
 		 352 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  30.41 
 
 		 347 aa  159  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  30.23 
 
 		 333 aa  159  9e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  29.52 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  29.52 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  29.6 
 
 		 333 aa  159  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  30.68 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>