More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0275 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0275  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 361 aa  724    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2567  LacI family transcription regulator  50.9 
 
 		 340 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2564  LacI family transcription regulator  50.3 
 
 		 339 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2900  LacI family transcription regulator  48.96 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2378  regulatory protein, LacI  50.3 
 
 		 339 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3380  transcriptional regulator PtxS  50.3 
 
 		 339 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26870  transcriptional regulator PtxS  49.1 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677113  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2981  transcriptional regulator PtxS  48.8 
 
 		 340 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35370  transcriptional regulator PtxS  48.8 
 
 		 340 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118446  normal  0.0830147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0061  LacI family transcription regulator  43.41 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0171  LacI family transcription regulator  43.11 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1738  LacI family transcription regulator  42.44 
 
 		 358 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.274916  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3703  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.61 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1250  LacI family transcription regulator  42.33 
 
 		 356 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2299  LacI family transcription regulator  44.13 
 
 		 347 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1493  regulatory protein, LacI  40.9 
 
 		 376 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0965  LacI family transcription regulator  42.54 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2285  LacI family transcription regulator  42.54 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5026  LacI family transcription regulator  42.73 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0693  transcriptional regulator, LacI family  41.88 
 
 		 354 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2093  LacI family transcription regulator  42.54 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2150  LacI family transcription regulator  42.54 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1651  LacI family transcription regulator  41.84 
 
 		 347 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1651  LacI family transcription regulator  41.84 
 
 		 347 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0759  transcriptional regulator, LacI family  41.6 
 
 		 354 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.153259 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1983  LacI family transcription regulator  41.76 
 
 		 360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3412  transcriptional regulator, LacI family  39.77 
 
 		 342 aa  212  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2275  transcriptional regulator, LacI family  40.85 
 
 		 362 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6349  LacI family transcription regulator  42.43 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1729  LacI family transcription regulator  42.43 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1529  LacI family transcription regulator  42.18 
 
 		 347 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.98616  normal  0.839967 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1743  LacI family transcription regulator  40.83 
 
 		 348 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79777  normal  0.50897 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0114  transcriptional regulator, LacI family  31.96 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1482  transcriptional regulator, LacI family  29.67 
 
 		 337 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  31.56 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  34.94 
 
 		 349 aa  162  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  28.53 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  34.38 
 
 		 334 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00486  transcriptional regulator LacI family  35.12 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  36.65 
 
 		 348 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.32 
 
 		 352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0609  alanine racemase  34.72 
 
 		 347 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  34.71 
 
 		 335 aa  153  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  35.53 
 
 		 346 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  35 
 
 		 368 aa  152  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1785  LacI family transcription regulator  34.51 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1808  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  26.59 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.379781  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0432  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.51 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  34.03 
 
 		 337 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  28.17 
 
 		 347 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  31.78 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1186  transcriptional regulator, LacI family  35.99 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0882106  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  31.07 
 
 		 330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  31.99 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0484  LacI family transcription regulator  28.31 
 
 		 335 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.5 
 
 		 356 aa  143  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9131  transcriptional regulator LacI family  32.59 
 
 		 356 aa  143  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  27.93 
 
 		 335 aa  143  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0407  LacI family transcription regulator  28.76 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.210448  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1973  LacI family transcription regulator  32.58 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.768247  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  27.01 
 
 		 342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  35.53 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  31.34 
 
 		 353 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  28.74 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  34.34 
 
 		 326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0403  GalR family transcription regulator  28.43 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  29.58 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2860  putative transcription regulation repressor transcription regulator protein  34.07 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  24.7 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  29.29 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  29.58 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  29.29 
 
 		 330 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3091  LacI family transcription regulator  32.15 
 
 		 328 aa  137  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  29.29 
 
 		 330 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  34.8 
 
 		 365 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  31.79 
 
 		 357 aa  136  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  29.45 
 
 		 332 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  28.99 
 
 		 330 aa  135  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03639  DNA-binding transcriptional repressor of ribose metabolism  29.29 
 
 		 330 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  32.04 
 
 		 337 aa  135  8e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  29.29 
 
 		 330 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  29.45 
 
 		 332 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  29.29 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2742  transcriptional regulator, LacI family  34.71 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0297688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4253  LacI family transcription regulator  34.99 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  30.55 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  30.23 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  30.34 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  29.19 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4388  LacI family transcription regulator  33.75 
 
 		 329 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  29.15 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4475  LacI family transcription regulator  33.75 
 
 		 329 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4769  LacI family transcription regulator  33.75 
 
 		 329 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  29.15 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  30.98 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  29.15 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  26.57 
 
 		 347 aa  133  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1005  transcriptional regulator, LacI family  27.78 
 
 		 336 aa  133  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  31.32 
 
 		 353 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>