More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1808 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1808  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 327 aa  674    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.379781  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26870  transcriptional regulator PtxS  30.28 
 
 		 340 aa  190  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677113  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3380  transcriptional regulator PtxS  31.1 
 
 		 339 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2378  regulatory protein, LacI  31.1 
 
 		 339 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2564  LacI family transcription regulator  30.79 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2567  LacI family transcription regulator  31.82 
 
 		 340 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0061  LacI family transcription regulator  28.36 
 
 		 344 aa  170  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35370  transcriptional regulator PtxS  29.05 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118446  normal  0.0830147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2900  LacI family transcription regulator  28.88 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2981  transcriptional regulator PtxS  29.05 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3412  transcriptional regulator, LacI family  29.94 
 
 		 342 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.24 
 
 		 336 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1738  LacI family transcription regulator  28.87 
 
 		 358 aa  159  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.274916  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0794  LacI family transcription regulator  32.15 
 
 		 339 aa  159  9e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0417873  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1482  transcriptional regulator, LacI family  32.15 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0498  LacI family transcription regulator  31.5 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0182598  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1493  regulatory protein, LacI  30.68 
 
 		 376 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0114  transcriptional regulator, LacI family  31.02 
 
 		 341 aa  152  5e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0275  LacI family transcription regulator  26.59 
 
 		 361 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  30.1 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0484  LacI family transcription regulator  30.93 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1668  LacI family transcription regulator  30.24 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012495  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  27.84 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5553  transcriptional regulator LacI family  29.07 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539573  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0965  LacI family transcription regulator  27.13 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2285  LacI family transcription regulator  27.13 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2093  LacI family transcription regulator  27.13 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2150  LacI family transcription regulator  27.13 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0171  LacI family transcription regulator  28.12 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1250  LacI family transcription regulator  28.44 
 
 		 356 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  28.18 
 
 		 330 aa  149  9e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0759  transcriptional regulator, LacI family  26.98 
 
 		 354 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.153259 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  28.27 
 
 		 346 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.48 
 
 		 352 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  28.49 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  28.14 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2299  LacI family transcription regulator  26.18 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  28.14 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  27.98 
 
 		 346 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5026  LacI family transcription regulator  27.07 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  28.44 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  27.6 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  27.36 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0693  transcriptional regulator, LacI family  26.03 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  28.14 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  28.44 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  28.44 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  28.44 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  28.14 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  29.29 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  28.14 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  28.14 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  28.14 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1983  LacI family transcription regulator  26.61 
 
 		 360 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104986 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  27.16 
 
 		 340 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  29.79 
 
 		 334 aa  143  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  26.07 
 
 		 365 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5883  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.62 
 
 		 356 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.92391 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0407  LacI family transcription regulator  30.77 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.210448  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1896  sugar-binding transcriptional regulator RegR  32.48 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.150149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0403  GalR family transcription regulator  30.77 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0292  LacI family transcription regulator  30.35 
 
 		 341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00151755  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3367  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.75 
 
 		 330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00871192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  27.83 
 
 		 347 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3703  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.79 
 
 		 338 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  29.04 
 
 		 344 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  26.81 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5347  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.993623  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1984  LacI family transcription regulator  30.12 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  27.58 
 
 		 348 aa  136  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1651  LacI family transcription regulator  25.8 
 
 		 347 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2830  transcriptional regulator, LacI family  24.92 
 
 		 335 aa  136  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  28.45 
 
 		 368 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.11 
 
 		 356 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1651  LacI family transcription regulator  25.8 
 
 		 347 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  25.16 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2275  transcriptional regulator, LacI family  25.14 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  26.05 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  28.24 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  26.28 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  26.57 
 
 		 337 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  25.75 
 
 		 340 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  28.76 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  29.41 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  26.06 
 
 		 335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3620  transcriptional regulator, LacI family  28.66 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  26.83 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  28.76 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  30.36 
 
 		 342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  28.76 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  26.87 
 
 		 337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  28.76 
 
 		 323 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  28.43 
 
 		 323 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  28.76 
 
 		 323 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5122  transcriptional regulator, LacI family  27.59 
 
 		 356 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.135885 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  28.43 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6349  LacI family transcription regulator  26.03 
 
 		 347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  28.43 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  26.05 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1729  LacI family transcription regulator  26.03 
 
 		 347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>