More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2981 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2981  transcriptional regulator PtxS  100 
 
 		 340 aa  686    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35370  transcriptional regulator PtxS  97.65 
 
 		 340 aa  674    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118446  normal  0.0830147 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26870  transcriptional regulator PtxS  77.35 
 
 		 340 aa  531  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677113  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2564  LacI family transcription regulator  73.64 
 
 		 339 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3380  transcriptional regulator PtxS  72.89 
 
 		 339 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2378  regulatory protein, LacI  72.89 
 
 		 339 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2567  LacI family transcription regulator  72.59 
 
 		 340 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2900  LacI family transcription regulator  66.67 
 
 		 341 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0061  LacI family transcription regulator  46.71 
 
 		 344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0171  LacI family transcription regulator  46.53 
 
 		 338 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0275  LacI family transcription regulator  48.8 
 
 		 361 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1738  LacI family transcription regulator  43.62 
 
 		 358 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.274916  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3703  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.62 
 
 		 338 aa  248  8e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3412  transcriptional regulator, LacI family  42.69 
 
 		 342 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1651  LacI family transcription regulator  42.61 
 
 		 347 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1651  LacI family transcription regulator  42.61 
 
 		 347 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1493  regulatory protein, LacI  40.59 
 
 		 376 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0693  transcriptional regulator, LacI family  43.62 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5026  LacI family transcription regulator  43.15 
 
 		 347 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1250  LacI family transcription regulator  42.49 
 
 		 356 aa  231  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1529  LacI family transcription regulator  42.33 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.98616  normal  0.839967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0759  transcriptional regulator, LacI family  42.14 
 
 		 354 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.153259 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6349  LacI family transcription regulator  41.81 
 
 		 347 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1729  LacI family transcription regulator  41.81 
 
 		 347 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1743  LacI family transcription regulator  41.69 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79777  normal  0.50897 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2299  LacI family transcription regulator  40.76 
 
 		 347 aa  219  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2275  transcriptional regulator, LacI family  40.62 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0965  LacI family transcription regulator  40.76 
 
 		 347 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2285  LacI family transcription regulator  40.76 
 
 		 347 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2093  LacI family transcription regulator  40.76 
 
 		 347 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2150  LacI family transcription regulator  40.76 
 
 		 347 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1983  LacI family transcription regulator  41.67 
 
 		 360 aa  215  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104986 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1482  transcriptional regulator, LacI family  31.47 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  31.85 
 
 		 342 aa  179  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0114  transcriptional regulator, LacI family  30.29 
 
 		 341 aa  179  8e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  35.8 
 
 		 333 aa  172  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  29.79 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2830  transcriptional regulator, LacI family  31.91 
 
 		 335 aa  169  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  33.73 
 
 		 348 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  30.18 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1808  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  29.05 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.379781  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  35.71 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  31.35 
 
 		 368 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  32.83 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  32.64 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  32.83 
 
 		 332 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  32.63 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  32.83 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  33.23 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00486  transcriptional regulator LacI family  33.73 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1896  sugar-binding transcriptional regulator RegR  28.4 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.150149  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  31.82 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  30.12 
 
 		 333 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  27.6 
 
 		 340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  32.53 
 
 		 332 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  30.27 
 
 		 333 aa  155  7e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.46 
 
 		 336 aa  155  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  32.53 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  32.53 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.82 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  35.05 
 
 		 346 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.03 
 
 		 352 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1186  transcriptional regulator, LacI family  34.35 
 
 		 358 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0882106  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5553  transcriptional regulator LacI family  31.14 
 
 		 356 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539573  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9131  transcriptional regulator LacI family  31.79 
 
 		 356 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  31.52 
 
 		 354 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0498  LacI family transcription regulator  27.91 
 
 		 325 aa  149  6e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0182598  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.83 
 
 		 330 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  32.14 
 
 		 328 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 346 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  30.75 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  33.53 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  31.02 
 
 		 338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  30.03 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  30.45 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  31.14 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  31.14 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4042  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.08 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  32 
 
 		 326 aa  146  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  31.93 
 
 		 353 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  31.64 
 
 		 331 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  31.95 
 
 		 346 aa  145  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  30.21 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  31.14 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 357 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  31.95 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  30.24 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  30.75 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  29.91 
 
 		 330 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  29.91 
 
 		 330 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  30.84 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  30.84 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  29.91 
 
 		 330 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  30 
 
 		 330 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  30.84 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  30.84 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>