More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2285 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0965  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 347 aa  702    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2285  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 347 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2299  LacI family transcription regulator  94.24 
 
 		 347 aa  663    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2093  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 347 aa  702    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2150  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 347 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5026  LacI family transcription regulator  77.81 
 
 		 347 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1651  LacI family transcription regulator  77.52 
 
 		 347 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1651  LacI family transcription regulator  77.23 
 
 		 347 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0693  transcriptional regulator, LacI family  72.54 
 
 		 354 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0759  transcriptional regulator, LacI family  72.83 
 
 		 354 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.153259 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1529  LacI family transcription regulator  78.67 
 
 		 347 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.98616  normal  0.839967 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6349  LacI family transcription regulator  76.37 
 
 		 347 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1729  LacI family transcription regulator  76.37 
 
 		 347 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1743  LacI family transcription regulator  76.44 
 
 		 348 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79777  normal  0.50897 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1983  LacI family transcription regulator  66.95 
 
 		 360 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104986 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1250  LacI family transcription regulator  64.69 
 
 		 356 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2275  transcriptional regulator, LacI family  66.02 
 
 		 362 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0061  LacI family transcription regulator  45.24 
 
 		 344 aa  292  7e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0171  LacI family transcription regulator  45.29 
 
 		 338 aa  289  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26870  transcriptional regulator PtxS  41.46 
 
 		 340 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677113  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2567  LacI family transcription regulator  40.28 
 
 		 340 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2900  LacI family transcription regulator  41.74 
 
 		 341 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1738  LacI family transcription regulator  39.77 
 
 		 358 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.274916  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2564  LacI family transcription regulator  41.67 
 
 		 339 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0275  LacI family transcription regulator  42.54 
 
 		 361 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2981  transcriptional regulator PtxS  40.76 
 
 		 340 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3703  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.46 
 
 		 338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3380  transcriptional regulator PtxS  39.49 
 
 		 339 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3412  transcriptional regulator, LacI family  41.52 
 
 		 342 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2378  regulatory protein, LacI  39.49 
 
 		 339 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35370  transcriptional regulator PtxS  40.18 
 
 		 340 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118446  normal  0.0830147 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1493  regulatory protein, LacI  39.82 
 
 		 376 aa  209  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0114  transcriptional regulator, LacI family  30.9 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1482  transcriptional regulator, LacI family  32.59 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  31.19 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1808  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  27.13 
 
 		 327 aa  150  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.379781  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1696  transcriptional regulator, LacI family  32.58 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1631  LacI family transcription regulator  34.46 
 
 		 381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213128  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  29.43 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  34.1 
 
 		 353 aa  146  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  30.52 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  32.16 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  28.03 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  29.17 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  32.06 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  32.06 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  31.27 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2830  transcriptional regulator, LacI family  30.41 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  31.86 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.61 
 
 		 352 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  33.92 
 
 		 357 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  29.97 
 
 		 349 aa  139  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  32.92 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  32.92 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  35.59 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  32.92 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  32.92 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  30.27 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.26 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  32.6 
 
 		 343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  32.6 
 
 		 343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0407  LacI family transcription regulator  26.93 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.210448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  31.85 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.24 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  30.29 
 
 		 337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0403  GalR family transcription regulator  26.63 
 
 		 337 aa  133  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  32.08 
 
 		 343 aa  132  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.95 
 
 		 337 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  30.79 
 
 		 340 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  29.94 
 
 		 339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  31.76 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  31.76 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  31.76 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  30.52 
 
 		 365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  30.19 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  30.91 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.61 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  29.88 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  32.75 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4253  LacI family transcription regulator  33.04 
 
 		 354 aa  129  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  29.87 
 
 		 346 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  30.35 
 
 		 347 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  31.25 
 
 		 338 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  31.45 
 
 		 333 aa  129  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  30.5 
 
 		 348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  31.25 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.03 
 
 		 338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  29.97 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3107  transcriptional regulator, LacI family  33.02 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  29.29 
 
 		 337 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1896  sugar-binding transcriptional regulator RegR  22.81 
 
 		 333 aa  126  6e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.150149  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  30.09 
 
 		 336 aa  126  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  30.57 
 
 		 333 aa  126  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  27.9 
 
 		 334 aa  126  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  30.38 
 
 		 334 aa  126  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  29.88 
 
 		 339 aa  125  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4042  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.32 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>