More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1880 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1880  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 335 aa  660    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.25 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  33.72 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  34.53 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  31.14 
 
 		 342 aa  159  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.34 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0880  transcriptional regulator, LacI family  34.63 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  32.55 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  35.01 
 
 		 333 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  31.76 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  30.23 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  32.46 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  29.17 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  27.51 
 
 		 339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  34.12 
 
 		 348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  31.34 
 
 		 386 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3608  transcriptional regulator, LacI family  34.51 
 
 		 339 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.024376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0802  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.72 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4417  transcriptional regulator, LacI family  32.74 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  28.19 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  32.79 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  31.64 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1756  transcriptional regulator, LacI family  34.33 
 
 		 357 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.82 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1713  transcriptional regulator, LacI family  31.18 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  31.07 
 
 		 337 aa  143  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.04 
 
 		 335 aa  143  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  32.64 
 
 		 334 aa  142  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  31.43 
 
 		 361 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  32.15 
 
 		 336 aa  142  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  35.71 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  32.04 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  34.31 
 
 		 349 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3308  LacI family transcription regulator  31.44 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0163  transcriptional regulator, LacI family  30.87 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000297035  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  30.35 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.35 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  31.39 
 
 		 330 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05790  transcriptional regulator  31.47 
 
 		 347 aa  139  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6552  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  32.55 
 
 		 376 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  hitchhiker  0.0000198251 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  32.63 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  29.3 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5553  transcriptional regulator LacI family  31.52 
 
 		 356 aa  136  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  32.91 
 
 		 337 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  34.64 
 
 		 326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  33.03 
 
 		 391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  31.01 
 
 		 336 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0686  LacI family transcription regulator  31.07 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0975  transcriptional regulator, LacI family  33.72 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3944  transcriptional regulator, LacI family  29.66 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  30.45 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0693  transcriptional regulator, LacI family  30.75 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  29.39 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3109  transcriptional regulator, LacI family  30.79 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2305  transcriptional regulator, LacI family  35.01 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1984  LacI family transcription regulator  32.66 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  29.91 
 
 		 333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2497  Alanine racemase  33.75 
 
 		 338 aa  133  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1250  LacI family transcription regulator  30.95 
 
 		 356 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5418  transcriptional regulator, LacI family  32.1 
 
 		 356 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263593 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1009  transcriptional regulator, LacI family  28.7 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4409  transcriptional regulator, LacI family  34.02 
 
 		 338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  31.31 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1493  regulatory protein, LacI  32.37 
 
 		 376 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  28.19 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  32.43 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.61 
 
 		 330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2954  DNA-binding transcriptional regulator GalR  31.23 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1482  transcriptional regulator, LacI family  27.99 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3401  LacI family transcription regulator  31.61 
 
 		 367 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0061  LacI family transcription regulator  27.16 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1324  DNA-binding transcriptional regulator GalR  30.12 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  29.08 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1738  LacI family transcription regulator  32.81 
 
 		 358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.274916  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.49 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  28.21 
 
 		 341 aa  129  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5235  LacI family transcription regulator  31.31 
 
 		 330 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7934  putative LacI-family transcriptional regulator  35.01 
 
 		 335 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2456  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0759  transcriptional regulator, LacI family  30.86 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.153259 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  28.89 
 
 		 355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5122  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.135885 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2681  LacI family transcription regulator  28.99 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  27.89 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  29.67 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  27.89 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  27.89 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  26.1 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  27.89 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.84 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  31.4 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3698  transcriptional regulator, LacI family  32.56 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375251  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2994  DNA-binding transcriptional regulator GalS  31.75 
 
 		 332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0058  LacI family transcription regulator  34.95 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  31.09 
 
 		 353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>