More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1700 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1700  regulatory protein LacI  100 
 
 		 354 aa  729    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107913  normal  0.016401 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4494  transcriptional regulator, LacI family  57.83 
 
 		 352 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.393877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1274  transcriptional regulator, LacI family  54.99 
 
 		 352 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128748  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4111  regulatory protein LacI  39.6 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4879  transcriptional regulator, LacI family  38.75 
 
 		 354 aa  250  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.77144  normal  0.328602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4188  regulatory protein, LacI  38.14 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.615532  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  24.14 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  27.22 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  24.93 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  23.78 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  26.56 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  24.13 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0060  LacI family transcription regulator  28.67 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0425291  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  23.36 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  22.51 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  24.65 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  24.43 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  27.14 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  22.16 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.91 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  21.7 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  29.89 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  25.71 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  22.9 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3158  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.6 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3312  LacI family transcription regulator  25.5 
 
 		 336 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  24 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0550  LacI family transcription regulator  30.49 
 
 		 336 aa  72  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  31.45 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  27.18 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.53 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.53 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0763  regulatory protein, LacI  28.37 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0420  LacI family transcription regulator  22.07 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  21.79 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0416  LacI family transcription regulator  22.22 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  27.1 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  25.76 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  25.52 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  22.98 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  24.5 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  25.96 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2994  DNA-binding transcriptional regulator GalS  28.89 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1791  catabolite control protein A  46.38 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.42313  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1826  catabolite control protein A  46.38 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000092301  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1464  transcriptional regulator, LacI family  28.87 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  21.69 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2376  LacI family transcription regulator  24.5 
 
 		 339 aa  67  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0719999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  29.63 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  23.71 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0343  transcriptional regulator, LacI family  27.93 
 
 		 327 aa  67  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0177  transcriptional regulator, LacI family  29.46 
 
 		 343 aa  67  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.32 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3432  transcriptional regulator, LacI family  24.57 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000329456  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7004  transcriptional regulator, LacI family  24.3 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000759079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  29.78 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  25.81 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  26.99 
 
 		 340 aa  65.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1769  lac repressor  27.74 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.044739  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  25.71 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1296  catabolite control protein A  43.48 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.48685  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.89 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  25.27 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  25.27 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  25.27 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  25.27 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  25.27 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  22.49 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  25.27 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0372  transcriptional regulator, LacI family  30.38 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  25.27 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1012  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.03718  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  25.76 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  33.57 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  33.57 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  33.57 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  33.57 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  33.57 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  33.57 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  27.61 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  33.57 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0577  LacI family transcription regulator  30.3 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.868296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  33.57 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2401  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  30.43 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3280  lac repressor  29.81 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3261  transcriptional regulator, LacI family  29.81 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  31.37 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  22.9 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  29.5 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  31.37 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.37 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0409  lac repressor  29.81 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.9973e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  25.15 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.5 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0782  regulatory protein, LacI  27.36 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>