More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1274 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1274  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 352 aa  728    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128748  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4494  transcriptional regulator, LacI family  66.19 
 
 		 352 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.393877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1700  regulatory protein LacI  54.99 
 
 		 354 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107913  normal  0.016401 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4879  transcriptional regulator, LacI family  36.92 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.77144  normal  0.328602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4111  regulatory protein LacI  36.92 
 
 		 358 aa  226  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4188  regulatory protein, LacI  36.34 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.615532  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  27.64 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  25.57 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  23.32 
 
 		 346 aa  89.7  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  23.56 
 
 		 368 aa  86.7  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  23.82 
 
 		 364 aa  85.9  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  24.51 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  34.39 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  29 
 
 		 339 aa  75.5  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  24.77 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  25.56 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  23.24 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7004  transcriptional regulator, LacI family  31.07 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000759079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5093  transcriptional regulator, LacI family  29.94 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3746  regulatory protein LacI  29.15 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  30.25 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4006  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.3 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  26.35 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0060  LacI family transcription regulator  52.17 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0425291  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  23.96 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  32.48 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  25.25 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6362  transcriptional regulator, LacI family  28.63 
 
 		 349 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1464  transcriptional regulator, LacI family  30.81 
 
 		 340 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  45.59 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  38.14 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  29.21 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3245  transcriptional regulator, LacI family  32.9 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  24.72 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  35.05 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0763  regulatory protein, LacI  26.76 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  26.55 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2112  transcriptional regulator, LacI family  29.31 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582425  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  35.05 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  27.65 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  27.87 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0416  LacI family transcription regulator  32.73 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  28.83 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0679  catabolite control protein  28.4 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.641859  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1791  catabolite control protein A  44.62 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.42313  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1826  catabolite control protein A  44.62 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000092301  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  24.76 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3761  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.68 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.193562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.25 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0420  LacI family transcription regulator  31.82 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130171  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  22.97 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0042  LacI family transcription regulator  29.05 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0930701  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  29.89 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  25.26 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1614  LacI family transcription regulator  30.26 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.702732  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1296  catabolite control protein A  29.68 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.48685  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1009  transcriptional regulator, LacI family  31.09 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285853 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  27.05 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  44.12 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.26 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1510  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  30.26 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1758  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  30.26 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000695085 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0707  RegM family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000462743  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  31.58 
 
 		 335 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00440  transcriptional regulator, LacI family  44.78 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1812  LacI family transcription regulator  28.12 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000564911  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0684  LacI family transcription regulator  37.23 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0236047  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  29.63 
 
 		 336 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  40 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  28 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  26.23 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1637  LacI family transcription regulator  39.17 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.455476 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  22.42 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  25.42 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  27.37 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0686  LacI family transcription regulator  38.37 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.04 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  40 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  40 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  40 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2268  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.42 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0455476 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  40 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  46.88 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  33.08 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1598  LacI family transcription regulator  25.26 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0971431  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  33.08 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  40 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.06 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  41.79 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  22.22 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1014  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.11 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  23.68 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1990  alanine racemase  25.58 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3654  LacI family transcription regulator  26.32 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  36.84 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  43.28 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3432  transcriptional regulator, LacI family  40 
 
 		 336 aa  59.3  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000329456  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3105  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.14 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0253563  hitchhiker  0.000776541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  27.47 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>