98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3746 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3746  regulatory protein LacI  100 
 
 		 345 aa  669    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  49.85 
 
 		 336 aa  291  8e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  49.85 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  51.45 
 
 		 347 aa  285  5.999999999999999e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  49.12 
 
 		 343 aa  279  5e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  46.36 
 
 		 339 aa  265  8.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  44.02 
 
 		 341 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  40.64 
 
 		 340 aa  219  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  38.97 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3483  transcriptional regulator, LacI family  44.64 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.617656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  43.9 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2405  transcriptional regulator, LacI family  40.47 
 
 		 366 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  34.92 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  33.75 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  34.69 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  33.65 
 
 		 340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  33.65 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  30.81 
 
 		 345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  34.12 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  31.74 
 
 		 354 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  31.9 
 
 		 349 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  27.44 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  30.92 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  32.92 
 
 		 342 aa  97.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5753  regulatory protein LacI  31.1 
 
 		 335 aa  96.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0380737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  31.09 
 
 		 351 aa  96.3  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  30.65 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  29.34 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  30.43 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  29.85 
 
 		 351 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  34.07 
 
 		 345 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  28.77 
 
 		 357 aa  87.4  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  30.72 
 
 		 339 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50220  LacI regulatory protein  34.31 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  27.22 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  27.67 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  28.03 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3834  transcriptional regulator LacI family  32.95 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0515953  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  30.91 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  29.57 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  25.75 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2296  transcriptional regulator, LacI family  28.11 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.413122  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3017  transcriptional regulator, LacI family  28.7 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0238556  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1274  transcriptional regulator, LacI family  29.15 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128748  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3285  LacI family transcription regulator  29.47 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2492  LacI family transcription regulator  30.16 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.804528  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4170  LacI family transcription regulator  27.59 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  23.4 
 
 		 352 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  22.58 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  29.53 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  26.01 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  31.02 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1700  regulatory protein LacI  23.76 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107913  normal  0.016401 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.39 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.39 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  26.77 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  31.84 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  24.39 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  23.37 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4111  regulatory protein LacI  18.51 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.23 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2053  LacI family transcription regulator  25.09 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5026  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  31.2 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0973  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.72 
 
 		 343 aa  53.5  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000623082  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  29.28 
 
 		 354 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.66 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3687  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  26.92 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.743219  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3422  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.92 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.544688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  29.28 
 
 		 354 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  27.15 
 
 		 334 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  31.09 
 
 		 354 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3158  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.53 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3233  trehalose repressor  29.44 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0123799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19860  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.55 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.04 
 
 		 349 aa  47  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1965  LacI family transcription regulator  26.17 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1855  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  26.17 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4494  transcriptional regulator, LacI family  21.82 
 
 		 352 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.393877 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  30.77 
 
 		 333 aa  46.6  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2582  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.94 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0686  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.38 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3045  monosaccharide-transporting ATPase  27.83 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1874  ribose ABC transporter periplasmic ribose-binding protein  27.83 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433268 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2973  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  27.83 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2264  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.08 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000366985  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1984  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.18 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  25.7 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3324  LacI family transcription regulator  30.09 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370251  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1618  DNA-binding transcriptional repressor MalI  21.34 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.671811  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07780  transcriptional regulator  50 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4006  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.78 
 
 		 327 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3000  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.43 
 
 		 312 aa  43.1  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1668  ABC transporter sugar-binding protein  25 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4704  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  22.84 
 
 		 382 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7473  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  23.65 
 
 		 319 aa  43.1  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0461677  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.98 
 
 		 317 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221092 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3927  LacI family transcription regulator  35.35 
 
 		 334 aa  42.7  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>