More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2296 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2296  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 333 aa  666    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.413122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2492  LacI family transcription regulator  82.58 
 
 		 333 aa  552  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.804528  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  51.93 
 
 		 346 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  35.67 
 
 		 330 aa  185  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  36.42 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  34.82 
 
 		 353 aa  175  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  34.63 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  34.98 
 
 		 354 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  34.67 
 
 		 354 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  34.67 
 
 		 354 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  35.03 
 
 		 357 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  34.4 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  34.01 
 
 		 351 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3285  LacI family transcription regulator  32.29 
 
 		 377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795711 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  34.04 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  34.53 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  32.83 
 
 		 357 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  35.91 
 
 		 351 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  32.08 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  30.7 
 
 		 349 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 336 aa  125  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  32.14 
 
 		 350 aa  123  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5753  regulatory protein LacI  33.12 
 
 		 335 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0380737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  30.19 
 
 		 342 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50220  LacI regulatory protein  32.28 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5026  transcriptional regulator, LacI family  32.69 
 
 		 348 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  33.23 
 
 		 345 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  31.2 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  30.52 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3017  transcriptional regulator, LacI family  29.61 
 
 		 350 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0238556  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  30.03 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  29.63 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  27.89 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  30.5 
 
 		 343 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  29.25 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  30.99 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  31.99 
 
 		 334 aa  103  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  29.53 
 
 		 343 aa  97.8  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2053  LacI family transcription regulator  29.07 
 
 		 345 aa  95.9  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  30.91 
 
 		 339 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  28.99 
 
 		 342 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  29.79 
 
 		 336 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  28.91 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4170  LacI family transcription regulator  28.25 
 
 		 368 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  29.18 
 
 		 336 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  31.1 
 
 		 339 aa  92.4  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  29.56 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  31.35 
 
 		 339 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  29.19 
 
 		 347 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2405  transcriptional regulator, LacI family  33.44 
 
 		 366 aa  86.3  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  31.75 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4188  regulatory protein, LacI  21.9 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.615532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  28.83 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  25.28 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3746  regulatory protein LacI  27.68 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  27.83 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.88 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3483  transcriptional regulator, LacI family  31.76 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.617656 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  31.86 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1696  transcriptional regulator, LacI family  30.95 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1559  alanine racemase  27.88 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000066632  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  22.76 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.12 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.41 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  30.65 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4879  transcriptional regulator, LacI family  22.25 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.77144  normal  0.328602 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1618  DNA-binding transcriptional repressor MalI  23.76 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.671811  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0595  LacI family transcription regulator  25 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000015362  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  23.01 
 
 		 346 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1601  alanine racemase  28.14 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.520299  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1691  transcriptional regulator, LacI family  24.93 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0314799  normal  0.084893 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2525  LacI family transcription regulator  26.97 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418226  normal  0.0803967 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0834  LacI family transcription regulator  29.15 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3236  monosaccharide-transporting ATPase  25.73 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.271334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  27.43 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  30.3 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0224  transcriptional regulator, LacI family  24.81 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  23.51 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2454  monosaccharide-transporting ATPase  25.09 
 
 		 319 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.65 
 
 		 338 aa  53.9  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0042  LacI family transcription regulator  25.99 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0930701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.83 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0285  alanine racemase  28.05 
 
 		 337 aa  53.5  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1528  transcriptional regulator, LacI family  28.89 
 
 		 356 aa  53.1  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  27.8 
 
 		 332 aa  52.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  25.98 
 
 		 330 aa  52.8  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0292  monosaccharide-transporting ATPase  26.09 
 
 		 300 aa  52.8  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5770  LacI family transcription regulator  29.06 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0694  regulatory protein LacI  25.69 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3760  LacI family transcription regulator  28.78 
 
 		 364 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0180539  normal  0.0106045 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3834  LacI family transcription regulator  29.06 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799833  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2603  twin-arginine translocation pathway signal  25.45 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.912871  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4534  LacI family transcription regulator  29.06 
 
 		 357 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.904098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3419  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.32 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2347  LacI family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3128  LacI family transcription regulator  24.39 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.77717 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29660  transcriptional regulator, LacI family  30.69 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.28 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0934818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>