More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0614 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  100 
 
 
353 aa  701    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  89.24 
 
 
363 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  87.29 
 
 
354 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  88.98 
 
 
354 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  88.98 
 
 
354 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  88.14 
 
 
354 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3285  LacI family transcription regulator  52.34 
 
 
377 aa  349  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795711 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  42.09 
 
 
357 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2296  transcriptional regulator, LacI family  34.82 
 
 
333 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.413122  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2492  LacI family transcription regulator  35.08 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.804528  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  34.44 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  34.94 
 
 
346 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  37.54 
 
 
345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  34.81 
 
 
349 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  33.01 
 
 
343 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  33.74 
 
 
354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  36.2 
 
 
356 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  31.79 
 
 
357 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  33.85 
 
 
351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  31.21 
 
 
351 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5753  regulatory protein LacI  35.24 
 
 
335 aa  139  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0380737  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  31.18 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  32.33 
 
 
340 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  34.31 
 
 
340 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  32.34 
 
 
343 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  34.52 
 
 
340 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  32.91 
 
 
342 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  31.14 
 
 
343 aa  126  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  35.28 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  29.08 
 
 
342 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3834  transcriptional regulator LacI family  32.69 
 
 
346 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0515953  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  30.72 
 
 
339 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  29.14 
 
 
336 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  28.14 
 
 
339 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3017  transcriptional regulator, LacI family  30.91 
 
 
350 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0238556  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  25.29 
 
 
343 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50220  LacI regulatory protein  29 
 
 
379 aa  90.1  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  27.41 
 
 
340 aa  89.7  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  27.36 
 
 
342 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  25.6 
 
 
342 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  31.09 
 
 
343 aa  86.7  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  29.14 
 
 
350 aa  86.3  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  28.67 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  28.91 
 
 
373 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2053  LacI family transcription regulator  27.61 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2405  transcriptional regulator, LacI family  30.38 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  31.18 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  24.1 
 
 
364 aa  80.5  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  28.34 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  26.81 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  27.98 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  21.69 
 
 
352 aa  77  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  25.95 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4170  LacI family transcription regulator  23.62 
 
 
368 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  29.14 
 
 
339 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  29.1 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  23.55 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  29.08 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0767  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  22.14 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000173406  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5026  transcriptional regulator, LacI family  26.3 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5744  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  26 
 
 
323 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  21.04 
 
 
346 aa  62.8  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4879  transcriptional regulator, LacI family  22.66 
 
 
354 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.77144  normal  0.328602 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  38.46 
 
 
333 aa  60.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0604  LacI family transcription regulator  26.32 
 
 
325 aa  59.7  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00243454  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3746  regulatory protein LacI  31.23 
 
 
345 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.07 
 
 
323 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.07 
 
 
323 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  23.33 
 
 
368 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2264  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.54 
 
 
345 aa  56.6  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000366985  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3970  LacI family transcription regulator  30.56 
 
 
348 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11580  transcriptional regulator, LacI family  38.2 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2582  alanine racemase  28.08 
 
 
345 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000528226 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2582  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.91 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2906  Monosaccharide-transporting ATPase  25.09 
 
 
308 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0655902 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  31.61 
 
 
330 aa  54.3  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0119  ribose operon repressor RbsR  32.03 
 
 
328 aa  53.9  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0121  LacI family transcription regulator  26.21 
 
 
335 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0425024  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1623  transcriptional regulator, LacI family  31.2 
 
 
333 aa  53.9  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  28.04 
 
 
352 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.04 
 
 
337 aa  53.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4657  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.37 
 
 
334 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144561  normal  0.739038 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3049  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  23.89 
 
 
329 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.422318  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3343  LacI family transcription regulator  40.96 
 
 
349 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716413  normal  0.0750883 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3283  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  23.89 
 
 
329 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.116085  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  25.24 
 
 
332 aa  53.1  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5857  transcriptional regulator, LacI family  35.4 
 
 
338 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.55822 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3274  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  23.89 
 
 
329 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3324  LacI family transcription regulator  29.82 
 
 
347 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370251  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4596  transcriptional regulator, LacI family  36 
 
 
340 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0502076 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  22.98 
 
 
331 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1663  LacI family transcription regulator  28.37 
 
 
345 aa  52.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0296  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.37 
 
 
345 aa  52.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1601  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.02 
 
 
345 aa  52.8  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3511  transcriptional regulator, LacI family  44.44 
 
 
341 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0677107  normal  0.351268 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1852  LacI family transcription regulator  38.1 
 
 
314 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0463476  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4111  regulatory protein LacI  21.2 
 
 
358 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.75 
 
 
339 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3128  LacI family transcription regulator  28.17 
 
 
341 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.77717 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5192  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.37 
 
 
334 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164335  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>