More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0036 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 354 aa  720    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  77.4 
 
 		 351 aa  554  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  61.58 
 
 		 351 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  61.29 
 
 		 351 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  43.15 
 
 		 345 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5753  regulatory protein LacI  46.65 
 
 		 335 aa  252  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0380737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  39.88 
 
 		 342 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  40.12 
 
 		 349 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  37.97 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  37.72 
 
 		 340 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  37.94 
 
 		 343 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  35.14 
 
 		 357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  36.55 
 
 		 340 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  38.89 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  35.99 
 
 		 343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  35.99 
 
 		 343 aa  186  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  35.69 
 
 		 340 aa  182  6e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  35 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  34.29 
 
 		 343 aa  165  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  36.54 
 
 		 339 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  36.36 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  37.34 
 
 		 373 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  34.01 
 
 		 342 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  32.24 
 
 		 340 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50220  LacI regulatory protein  34.22 
 
 		 379 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  31.91 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  32.96 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2053  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5026  transcriptional regulator, LacI family  35.28 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  34.59 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3834  transcriptional regulator LacI family  38.19 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0515953  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2296  transcriptional regulator, LacI family  34.53 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.413122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  33.74 
 
 		 353 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3017  transcriptional regulator, LacI family  34.68 
 
 		 350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0238556  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2405  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  34.55 
 
 		 336 aa  139  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2492  LacI family transcription regulator  33.66 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.804528  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  33.11 
 
 		 334 aa  137  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  35.17 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  32.49 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  30.94 
 
 		 339 aa  133  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  31.9 
 
 		 336 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  32.81 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  32.81 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  33.88 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3483  transcriptional regulator, LacI family  34.72 
 
 		 342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.617656 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  31.71 
 
 		 357 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4170  LacI family transcription regulator  32.97 
 
 		 368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  32.18 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  29.81 
 
 		 342 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3285  LacI family transcription regulator  33.84 
 
 		 377 aa  126  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  30.17 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  33.09 
 
 		 337 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  26.77 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  29.23 
 
 		 339 aa  109  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  28.12 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3746  regulatory protein LacI  31.74 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  29.03 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.76 
 
 		 337 aa  96.3  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5744  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  25.25 
 
 		 323 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  26.3 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  23.56 
 
 		 344 aa  87.8  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  26.29 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3158  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.89 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5320  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.95 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4879  transcriptional regulator, LacI family  23.03 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.77144  normal  0.328602 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  24.22 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0438  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.82 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.681459  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.82 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.47 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.47 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1336  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.18 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2264  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.06 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000366985  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4657  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.42 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144561  normal  0.739038 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1270  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.81 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.127436 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0413  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.49 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000162891  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5192  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.42 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4111  regulatory protein LacI  21.49 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1403  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.81 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0529049  normal  0.248573 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4371  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.54 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.5 
 
 		 349 aa  67  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4328  putative ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  25.58 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7473  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  25.76 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0461677  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1600  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3102  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.95 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5247  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.949354 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0626  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  33.33 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.833097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3330  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.740967  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5037  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3601  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0339388  normal  0.918722 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.72 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4327  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.08 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4445  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.48 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000956374 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3821  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.19 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4965  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.48 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.111268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1274  transcriptional regulator, LacI family  24.76 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128748  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.46 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221092 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0923  monosaccharide-transporting ATPase  27.23 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>