239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6011 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 354 aa  703    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  95.2 
 
 		 354 aa  656    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  95.48 
 
 		 354 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  90.62 
 
 		 363 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  95.48 
 
 		 354 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  87.29 
 
 		 353 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3285  LacI family transcription regulator  51.1 
 
 		 377 aa  336  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795711 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  40.17 
 
 		 357 aa  252  6e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2296  transcriptional regulator, LacI family  34.63 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.413122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2492  LacI family transcription regulator  35.67 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.804528  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  32.23 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  38.51 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  32.91 
 
 		 343 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  33.44 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5753  regulatory protein LacI  35.4 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0380737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  31.43 
 
 		 357 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  32.49 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  35.09 
 
 		 356 aa  133  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  30.26 
 
 		 351 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  33.97 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  30.21 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  31.02 
 
 		 340 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  31.04 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  30.7 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  36.22 
 
 		 345 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  32.79 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3834  transcriptional regulator LacI family  35.51 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0515953  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  31.51 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  28.66 
 
 		 339 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  29.55 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  28.23 
 
 		 340 aa  94.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  28.7 
 
 		 339 aa  93.6  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  30.38 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  26.36 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  29.47 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  32.28 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  29.39 
 
 		 342 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  28.52 
 
 		 342 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2053  LacI family transcription regulator  28.76 
 
 		 345 aa  86.3  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3017  transcriptional regulator, LacI family  30.07 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0238556  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  27.24 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2405  transcriptional regulator, LacI family  31.8 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  27.17 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  28.25 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  29.24 
 
 		 336 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  30.58 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50220  LacI regulatory protein  27.1 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  24.19 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  23.33 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  28.24 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  25.08 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4170  LacI family transcription regulator  23.9 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  28.27 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5026  transcriptional regulator, LacI family  26.41 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.96 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0604  LacI family transcription regulator  25.91 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00243454  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  28.3 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0595  LacI family transcription regulator  23.85 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000015362  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  25.12 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4879  transcriptional regulator, LacI family  23.12 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.77144  normal  0.328602 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5744  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  24.59 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1663  LacI family transcription regulator  29.07 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3294  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.78 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0296  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.07 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2582  alanine racemase  29.07 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000528226 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0767  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  22.47 
 
 		 312 aa  55.8  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000173406  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2264  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.12 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000366985  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  37.36 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1164  LacI family transcription regulator  31.06 
 
 		 344 aa  53.5  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  26.85 
 
 		 337 aa  53.5  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  29.44 
 
 		 330 aa  53.5  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  27.49 
 
 		 328 aa  53.1  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4111  regulatory protein LacI  22 
 
 		 358 aa  53.1  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3128  LacI family transcription regulator  31.63 
 
 		 341 aa  52.8  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.77717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3320  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  21.67 
 
 		 348 aa  52.8  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3173  transcriptional regulator, LacI family  29.26 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.82 
 
 		 323 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.82 
 
 		 323 aa  52.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2083  LacI family transcription regulator  31.34 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.02 
 
 		 328 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6141  transcriptional regulator, LacI family  28.06 
 
 		 343 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1691  transcriptional regulator, LacI family  29 
 
 		 341 aa  50.4  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0314799  normal  0.084893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3343  LacI family transcription regulator  37.17 
 
 		 349 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716413  normal  0.0750883 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11580  transcriptional regulator, LacI family  36.36 
 
 		 345 aa  50.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3324  LacI family transcription regulator  32.24 
 
 		 347 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370251  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0393  sugar ABC transporter (sugar-binding protein)  28.48 
 
 		 321 aa  50.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0047  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.46 
 
 		 356 aa  49.7  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.108972 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 337 aa  49.7  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5857  transcriptional regulator, LacI family  35.4 
 
 		 338 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.55822 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  25.69 
 
 		 346 aa  49.7  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2906  Monosaccharide-transporting ATPase  25.31 
 
 		 308 aa  49.7  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0655902 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.1 
 
 		 336 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  23.44 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.62 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.33 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2644  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.91 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>