More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0908 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 357 aa  729    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  59.71 
 
 		 368 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  27.95 
 
 		 352 aa  135  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1700  regulatory protein LacI  24.14 
 
 		 354 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107913  normal  0.016401 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  27.7 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  28.49 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  28.96 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4111  regulatory protein LacI  25.14 
 
 		 358 aa  109  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  27.13 
 
 		 346 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  28.61 
 
 		 356 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  28.03 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4879  transcriptional regulator, LacI family  24.86 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.77144  normal  0.328602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4494  transcriptional regulator, LacI family  24.15 
 
 		 352 aa  99.4  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.393877 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  25.15 
 
 		 364 aa  99.4  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1274  transcriptional regulator, LacI family  25.57 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128748  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  28.7 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  26.3 
 
 		 343 aa  93.2  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3158  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.01 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.07 
 
 		 337 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.1 
 
 		 323 aa  89.7  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.1 
 
 		 323 aa  89.7  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  23.71 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4188  regulatory protein, LacI  22.87 
 
 		 332 aa  86.7  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.615532  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.13 
 
 		 338 aa  85.9  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  26.29 
 
 		 354 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  26.3 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  24.63 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  26.64 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  27.01 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  25.43 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  24.93 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  26.83 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3432  transcriptional regulator, LacI family  25.1 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000329456  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  26.13 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  24.19 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  24.3 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  24.5 
 
 		 340 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  36.72 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.72 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  25.09 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.7 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  25.87 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2264  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.26 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000366985  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  27.17 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  34.96 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0438  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.32 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.681459  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1537  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.2 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.89 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1640  LacI family transcription regulator  27.19 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  24.22 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  25 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  25 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4597  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.53 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0491755 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  24.9 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0026  regulatory protein LacI  46.67 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  24.81 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0291  alanine racemase  29.79 
 
 		 367 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.910588 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  23.91 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  38.89 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  24.69 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1997  ABC ribose transporter, periplasmic ligand binding protein  26.05 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3723  transcriptional regulator, LacI family  37.5 
 
 		 346 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543452  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3266  transcriptional regulator, LacI family  23.24 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.030441 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1237  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0190495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2854  putative secreted solute-binding lipoprotein  26.76 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  26.09 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4363  LacI family transcription regulator  31.69 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000162438  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  37.4 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  26.47 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0544  LacI family transcription regulator  28.83 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4257  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.81 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  26.35 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1929  LacI family transcription regulator  27.94 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959619  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  23.53 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  23.85 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4599  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  24.56 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.841849 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1587  regulatory protein LacI  27.59 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000010083  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2475  binding protein component precursor of ABC ribose transporter  25.12 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5531  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  43.02 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.264023  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.75 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5497  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  43.02 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5254  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  43.02 
 
 		 325 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5083  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  43.02 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000690772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5100  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  43.02 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2151  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.12 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.144836  normal  0.707296 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  25.08 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0782  regulatory protein, LacI  27.82 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5652  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  43.02 
 
 		 325 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5426  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  43.02 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  44.3 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1631  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.88 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.817449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4334  Monosaccharide-transporting ATPase  23.4 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.731249 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5525  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  43.02 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0911693  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0581  Alanine racemase  44.16 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0953116  normal  0.13709 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5581  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  43.02 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.44232  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3632  transcriptional regulator, LacI family  24.44 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  28.23 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3199  LacI family transcription regulator  27.31 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.13351 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  23.55 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>