More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2736 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  90.62 
 
 		 354 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 363 aa  730    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  89.52 
 
 		 354 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  89.52 
 
 		 354 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  89.24 
 
 		 354 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  89.24 
 
 		 353 aa  609  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3285  LacI family transcription regulator  52.53 
 
 		 377 aa  342  5e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795711 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  41.81 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2296  transcriptional regulator, LacI family  36.42 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.413122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2492  LacI family transcription regulator  35.87 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.804528  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  34.04 
 
 		 330 aa  173  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  37.74 
 
 		 345 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  33.44 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  33.76 
 
 		 343 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 349 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  34.67 
 
 		 351 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  35.26 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  34.06 
 
 		 356 aa  133  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  32.13 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5753  regulatory protein LacI  35.21 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0380737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  31.85 
 
 		 343 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  32.14 
 
 		 343 aa  129  8.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  29.39 
 
 		 351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  29.33 
 
 		 351 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  33.77 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  34.29 
 
 		 340 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  31.19 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  35.03 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  30.7 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  28.36 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  29.14 
 
 		 336 aa  102  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  27.93 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3834  transcriptional regulator LacI family  35.03 
 
 		 346 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0515953  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  27 
 
 		 343 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  28.87 
 
 		 342 aa  95.9  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  28.13 
 
 		 340 aa  94.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  28.52 
 
 		 342 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  31.49 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  30.42 
 
 		 339 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50220  LacI regulatory protein  28.19 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  28.65 
 
 		 350 aa  87.8  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  27.75 
 
 		 373 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3017  transcriptional regulator, LacI family  28.71 
 
 		 350 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0238556  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  32.86 
 
 		 337 aa  86.3  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2405  transcriptional regulator, LacI family  31.97 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  26.93 
 
 		 334 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2053  LacI family transcription regulator  28.21 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  29.47 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4170  LacI family transcription regulator  26.09 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  23.94 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  27.42 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  25.51 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  23.91 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  27.13 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0767  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.45 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000173406  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5026  transcriptional regulator, LacI family  26.76 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  28.94 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0604  LacI family transcription regulator  24.44 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00243454  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4879  transcriptional regulator, LacI family  23.84 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.77144  normal  0.328602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2906  Monosaccharide-transporting ATPase  27.1 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0655902 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3294  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.25 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.05 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  28.83 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  38.46 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5744  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.15 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  28.77 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.33 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  24.17 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2582  alanine racemase  31.86 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000528226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5857  transcriptional regulator, LacI family  37.17 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.55822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3343  LacI family transcription regulator  38.05 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716413  normal  0.0750883 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  26.19 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3511  transcriptional regulator, LacI family  45.68 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0677107  normal  0.351268 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.62 
 
 		 337 aa  54.7  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1691  transcriptional regulator, LacI family  29.15 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0314799  normal  0.084893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11580  transcriptional regulator, LacI family  37.08 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  24.35 
 
 		 352 aa  53.5  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3173  transcriptional regulator, LacI family  30.04 
 
 		 328 aa  53.5  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  24.19 
 
 		 368 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  28.34 
 
 		 330 aa  53.1  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4657  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.58 
 
 		 334 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144561  normal  0.739038 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0612  LacI family transcription regulator  24.65 
 
 		 343 aa  53.1  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.67 
 
 		 338 aa  52.8  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02556  hypothetical protein  26.92 
 
 		 318 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0119  ribose operon repressor RbsR  37.63 
 
 		 328 aa  52.8  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3322  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1623  transcriptional regulator, LacI family  31.2 
 
 		 333 aa  52.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  23.56 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3128  LacI family transcription regulator  30.3 
 
 		 341 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.77717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3483  transcriptional regulator, LacI family  33.66 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.617656 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2264  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.75 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000366985  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  24.47 
 
 		 341 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3746  regulatory protein LacI  30.26 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1663  LacI family transcription regulator  29 
 
 		 345 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3283  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  23.89 
 
 		 329 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.116085  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1767  LacI family transcription regulator  28.4 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2316  alanine racemase  31.79 
 
 		 334 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.356237  normal  0.365484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>