147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3591 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  100 
 
 		 339 aa  676    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  56.08 
 
 		 336 aa  364  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  54.44 
 
 		 336 aa  352  7e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  53.27 
 
 		 343 aa  335  9e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  54.12 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  49.11 
 
 		 341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  43.79 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  49.4 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3746  regulatory protein LacI  46.36 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  42.9 
 
 		 339 aa  246  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3483  transcriptional regulator, LacI family  49.71 
 
 		 342 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.617656 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2405  transcriptional regulator, LacI family  44.54 
 
 		 366 aa  238  9e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  36.12 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  34.97 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  30.72 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  35.09 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  32.89 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  32.55 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  30.94 
 
 		 354 aa  133  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  34.6 
 
 		 343 aa  132  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  34.38 
 
 		 343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  33.96 
 
 		 340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5753  regulatory protein LacI  33.63 
 
 		 335 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0380737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  30.52 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  30.63 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  31.59 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  33.7 
 
 		 342 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  30.9 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  32.29 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  29.85 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  32.5 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3834  transcriptional regulator LacI family  33.33 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0515953  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  29.15 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  29.34 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2296  transcriptional regulator, LacI family  30.91 
 
 		 333 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.413122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2492  LacI family transcription regulator  29.7 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.804528  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  27.99 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  27.81 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  29.9 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3285  LacI family transcription regulator  27.1 
 
 		 377 aa  86.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50220  LacI regulatory protein  29.87 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2053  LacI family transcription regulator  28.34 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4170  LacI family transcription regulator  27.41 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  30.66 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  27.6 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  29.47 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  26.71 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5026  transcriptional regulator, LacI family  25.08 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  26.73 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3017  transcriptional regulator, LacI family  26.18 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0238556  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  28.24 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4494  transcriptional regulator, LacI family  28.14 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.393877 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  28.24 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  28.24 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  24.43 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  28.31 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  28.13 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  27.91 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  25.24 
 
 		 346 aa  67  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1274  transcriptional regulator, LacI family  27.65 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128748  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3158  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.53 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.07 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.59 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1700  regulatory protein LacI  25.12 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107913  normal  0.016401 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2264  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.44 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000366985  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.05 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.47 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.47 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.58 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3423  transcriptional regulator, LacI family  28.47 
 
 		 366 aa  53.1  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0558625 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  26.78 
 
 		 344 aa  51.2  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0120  LacI family transcription regulator  32.09 
 
 		 351 aa  50.4  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1983  LacI family transcription regulator  29.36 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104986 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4879  transcriptional regulator, LacI family  22.01 
 
 		 354 aa  49.3  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.77144  normal  0.328602 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  25 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.73 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  27.98 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1668  ABC transporter sugar-binding protein  24.74 
 
 		 331 aa  49.3  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4006  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.58 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1111  LacI family transcription regulator  37.68 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  26.63 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  22.18 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  22.69 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0042  LacI family transcription regulator  25.84 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0930701  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4922  sugar ABC transporter substrate-binding protein  26.67 
 
 		 350 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27300  Transcriptional regulator, LacI family  26.88 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2709  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.19 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1780  transcriptional regulator, LacI family  46.67 
 
 		 345 aa  47.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3688  LacI family transcription regulator  30.63 
 
 		 332 aa  47  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2275  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 362 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1537  LacI family response repressor  35.24 
 
 		 385 aa  46.6  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0513  transcriptional regulator, LacI family  25.12 
 
 		 325 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  26.11 
 
 		 348 aa  46.2  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1071  regulatory protein, LacI  23.96 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1135  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.96 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  29.14 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1170  LacI family transcription regulator  23.96 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3221  transcriptional regulator, LacI family  23.96 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>