More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1780 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1780  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 345 aa  684    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1528  transcriptional regulator, LacI family  65.48 
 
 		 356 aa  425  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2175  transcriptional regulator, LacI family  64.81 
 
 		 349 aa  422  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.408939  normal  0.717598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13850  transcriptional regulator, LacI family  61.83 
 
 		 356 aa  410  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1882  LacI family transcriptional regulator  60.54 
 
 		 343 aa  388  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.711539 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2163  transcriptional regulator, LacI family  60.12 
 
 		 355 aa  385  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.130175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3351  LacI family transcription regulator  58.73 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  decreased coverage  0.0034898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3343  LacI family transcription regulator  57.66 
 
 		 349 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716413  normal  0.0750883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0696  transcriptional regulator, LacI family  59.64 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.477401 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0834  LacI family transcription regulator  60.79 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0746  LacI family transcription regulator  59.34 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2112  transcriptional regulator, LacI family  57.49 
 
 		 350 aa  356  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1131  transcriptional regulator, LacI family  59.45 
 
 		 332 aa  354  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3766  LacI family transcription regulator  53.39 
 
 		 361 aa  348  6e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11580  transcriptional regulator, LacI family  56.46 
 
 		 345 aa  347  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0802  alanine racemase  59.04 
 
 		 368 aa  344  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5892  transcriptional regulator, LacI family  57.4 
 
 		 332 aa  341  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.369057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3324  LacI family transcription regulator  57.32 
 
 		 347 aa  332  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370251  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5410  LacI family transcription regulator  50.45 
 
 		 340 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5857  transcriptional regulator, LacI family  52.25 
 
 		 338 aa  312  5.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.55822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8463  transcriptional regulator, LacI family  50.6 
 
 		 350 aa  309  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0061  transcriptional regulator, LacI family  49.55 
 
 		 341 aa  309  5e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408611  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27370  transcriptional regulator, LacI family  51.51 
 
 		 339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0316556  normal  0.625648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3704  transcriptional regulator, LacI family  49.85 
 
 		 353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00247071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6898  LacI family transcription regulator  52.1 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03820  transcriptional regulator, LacI family  50.15 
 
 		 333 aa  301  1e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.048726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3511  transcriptional regulator, LacI family  45.62 
 
 		 341 aa  279  5e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0677107  normal  0.351268 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3510  transcriptional regulator, LacI family  48.52 
 
 		 340 aa  271  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0130099  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3705  transcriptional regulator, LacI family  45.7 
 
 		 340 aa  251  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0259788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12300  transcriptional regulator  44.84 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.194881  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0347  transcriptional regulator, LacI family  43.4 
 
 		 347 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0937  ribose operon repressor RbsR  41.99 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.24 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 		 335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5848  LacI family transcription regulator  35.16 
 
 		 365 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  37.91 
 
 		 343 aa  179  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  36.94 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2659  transcriptional regulator, LacI family  37.43 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.34431  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1905  LacI family transcription regulator  36.28 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  32.25 
 
 		 347 aa  176  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  33.03 
 
 		 329 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  35.14 
 
 		 344 aa  172  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  34.94 
 
 		 326 aa  172  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  31.04 
 
 		 342 aa  172  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.03 
 
 		 330 aa  172  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  35.45 
 
 		 354 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  36.75 
 
 		 353 aa  169  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.23 
 
 		 333 aa  169  6e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  32.16 
 
 		 331 aa  169  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  36.34 
 
 		 337 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00440  transcriptional regulator, LacI family  32.34 
 
 		 338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  31.79 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  34.42 
 
 		 348 aa  163  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2344  transcriptional regulator, LacI family  36.8 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.06 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  34.6 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  34.42 
 
 		 342 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  34.33 
 
 		 334 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.55 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  32.44 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  31.56 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3319  transcriptional regulator, LacI family  35.78 
 
 		 337 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419074  normal  0.0675752 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  33.52 
 
 		 340 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  28.94 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  35.01 
 
 		 340 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1754  transcriptional regulator, LacI family  38.74 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000321603 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.34 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.64 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.64 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 343 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 346 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  29.59 
 
 		 338 aa  156  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3173  transcriptional regulator, LacI family  38.74 
 
 		 342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.579609 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  33.73 
 
 		 340 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  30.42 
 
 		 334 aa  155  7e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 		 346 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  31.74 
 
 		 335 aa  155  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6389  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.1 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0329  LacI family transcription regulator  33.04 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16025  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  35.14 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  31.25 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.66 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4596  transcriptional regulator, LacI family  34 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0502076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0975  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2719  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  34.33 
 
 		 337 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  34.52 
 
 		 343 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  33.05 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 		 346 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1598  LacI family transcription regulator  28.27 
 
 		 333 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0971431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  34.52 
 
 		 343 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>