280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5026 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5026  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 348 aa  707    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  79.54 
 
 		 373 aa  549  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4170  LacI family transcription regulator  69.12 
 
 		 368 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  49.69 
 
 		 350 aa  282  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  42.4 
 
 		 343 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  40.99 
 
 		 342 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  40.75 
 
 		 342 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50220  LacI regulatory protein  43.73 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3017  transcriptional regulator, LacI family  41.23 
 
 		 350 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0238556  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  38.73 
 
 		 342 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  40 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  39.02 
 
 		 336 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2053  LacI family transcription regulator  32.3 
 
 		 345 aa  176  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  33.76 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  33.44 
 
 		 351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  35.28 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  33.66 
 
 		 351 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  32.46 
 
 		 356 aa  132  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  34.85 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5753  regulatory protein LacI  30.15 
 
 		 335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0380737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  34.2 
 
 		 340 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  31.63 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  30.69 
 
 		 345 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2296  transcriptional regulator, LacI family  32.69 
 
 		 333 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.413122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  32.68 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  30.67 
 
 		 357 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  30.63 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  29.8 
 
 		 342 aa  109  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  29.97 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  30.92 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  29.51 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  26.99 
 
 		 340 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  32.45 
 
 		 339 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  28.66 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  25.85 
 
 		 352 aa  96.7  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2492  LacI family transcription regulator  29.39 
 
 		 333 aa  95.9  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.804528  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3834  transcriptional regulator LacI family  33.12 
 
 		 346 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0515953  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  31.25 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  31.41 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  27.38 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  30.4 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  27.6 
 
 		 357 aa  86.7  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  30.87 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  25.08 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  27.48 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  26.42 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3285  LacI family transcription regulator  27.3 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795711 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  28.19 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  26.1 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  26.76 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  31.02 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  22.73 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  25.8 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5744  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  25.57 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2405  transcriptional regulator, LacI family  24.92 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  22.29 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  24.52 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  26.41 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  25.56 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  23.66 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  26.41 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  26.41 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  26.06 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3483  transcriptional regulator, LacI family  28.38 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.617656 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  22.92 
 
 		 346 aa  57  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  25.32 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  22.34 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3746  regulatory protein LacI  33.33 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0673  regulatory protein, LacI  26.09 
 
 		 341 aa  53.5  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.371597  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  23.53 
 
 		 386 aa  53.1  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6093  LacI family transcription regulator  25.81 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  23.66 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0060  LacI family transcription regulator  25.14 
 
 		 355 aa  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0425291  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  24.19 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  22.65 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  24.19 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  23.41 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  23.66 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0376  transcriptional regulator, LacI family  27.2 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2434  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.89 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4733  transcriptional regulator, LacI family  26.85 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  23.55 
 
 		 323 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  23.63 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3102  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.62 
 
 		 326 aa  50.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1384  LacI family transcription regulator  38.46 
 
 		 367 aa  50.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.934353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  24.52 
 
 		 323 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5940  transcriptional regulator, LacI family  34.12 
 
 		 347 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146898  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  23.41 
 
 		 323 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  23.57 
 
 		 338 aa  50.1  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01589  DNA-binding transcriptional repressor  31.61 
 
 		 342 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.784776  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01579  hypothetical protein  31.61 
 
 		 342 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  29.85 
 
 		 336 aa  49.3  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0752  LacI family transcription regulator  47.22 
 
 		 331 aa  49.7  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.477484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0362  transcriptional regulator, LacI family  32.85 
 
 		 337 aa  49.3  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  24.52 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  23.87 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  22.58 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  24.52 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1242  LacI family transcription regulator  26.84 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  37.93 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>