More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1384 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1384  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 367 aa  753    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.934353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4267  LacI family transcription regulator  32.34 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4310  LacI family transcription regulator  31.16 
 
 		 369 aa  181  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4277  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 		 343 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4311  LacI family transcription regulator  30.88 
 
 		 370 aa  170  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3203  LacI family transcription regulator  29.83 
 
 		 375 aa  166  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0127391  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1357  LacI family transcription regulator  30.62 
 
 		 357 aa  159  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4343  LacI family transcription regulator  32.76 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.905515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4284  LacI family transcription regulator  31.01 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3374  LacI family transcription regulator  30.38 
 
 		 414 aa  155  8e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1018  LacI family transcription regulator  30.73 
 
 		 365 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1990  LacI family transcription regulator  28.99 
 
 		 341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0741894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3108  transcriptional regulators-like protein  32.31 
 
 		 323 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737433 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0520  LacI family transcription regulator  28.86 
 
 		 357 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0521  LacI family transcription regulator  30.09 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4286  LacI family transcription regulator  30.54 
 
 		 347 aa  113  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.38 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1687  LacI family transcription regulator  26.93 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.142395 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  27.89 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.89 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  26.97 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  30.65 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  25 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  25.51 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  27.61 
 
 		 361 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  24.26 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  25.6 
 
 		 473 aa  66.2  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  26.14 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  25.59 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3896  LacI family transcription regulator  39.05 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1079  LacI family transcription regulator  29.29 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000248753 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  26.99 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1186  regulatory protein, LacI  26.77 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  21.86 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  24.48 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4611  transcriptional regulator, LacI family  28.11 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  25.51 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1481  transcriptional regulator, LacI family  23.62 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  24.33 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  24.17 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  24.17 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  24.04 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  28.53 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  24.17 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  24.17 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  24.17 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  24.17 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1317  transcriptional regulator, LacI family  26.37 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01800  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  25.07 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5512  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0234887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1686  LacI family transcription regulator  22.96 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.155219 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  24.55 
 
 		 343 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1423  transcriptional regulator, LacI family  23.94 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.189138 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0407  LacI family transcription regulator  21.75 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.210448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6898  LacI family transcription regulator  24.69 
 
 		 326 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  24.04 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3846  transcriptional regulator, LacI family  27.68 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00500845  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10110  transcriptional regulator  26.47 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.625648 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3632  transcriptional regulator, LacI family  23.73 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0403  GalR family transcription regulator  21.75 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  23.87 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5410  LacI family transcription regulator  25.99 
 
 		 340 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  22.87 
 
 		 341 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4618  regulatory protein LacI  28.35 
 
 		 332 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784708  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02412  transcriptional regulator  24.93 
 
 		 343 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1482  transcriptional regulator, LacI family  21.23 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  27.93 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4066  LacI family transcription regulator  20.55 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21.36 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27370  transcriptional regulator, LacI family  24.1 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0316556  normal  0.625648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6854  transcriptional regulator, LacI family  45.59 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000835434  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0129  transcriptional regulator, LacI family  30.61 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  24.25 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4527  LacI family transcription regulator  26.27 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.705673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  24.25 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  24.25 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0116  transcriptional regulator, LacI family  26.43 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  21.34 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2253  transcriptional regulator, LacI family  27.27 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862042 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0679  catabolite control protein  21.26 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.641859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  22.71 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1063  LacI family transcription regulator  24.62 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4931  transcriptional regulator, LacI family  25.82 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.699714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  26.92 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4130  transcriptional regulator, LacI family  30.69 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  24.18 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3918  LacI family transcription regulator  28.76 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5702  transcriptional regulator, LacI family  25.66 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2290  transcriptional regulator, LacI family  25.38 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.950174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01470  transcriptional regulator  27.32 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1322  transcriptional regulator, LacI family  24.7 
 
 		 336 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3562  transcriptional regulator, LacI family  25.76 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3579  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.67 
 
 		 344 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  20.73 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  21.88 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  23.88 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.22 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>