More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4618 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4618  regulatory protein LacI  100 
 
 		 332 aa  650    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784708  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2762  transcriptional regulator, LacI family  51.96 
 
 		 339 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0663  transcriptional regulator, LacI family  47.22 
 
 		 326 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2760  transcriptional regulator, LacI family  49.09 
 
 		 333 aa  246  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3611  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.86 
 
 		 345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0385  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.17 
 
 		 354 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2472  transcriptional regulator, LacI family  45.35 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1847  transcriptional regulator, LacI family  42.25 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.257211  normal  0.180061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6854  transcriptional regulator, LacI family  42.55 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000835434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  40.18 
 
 		 361 aa  195  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0292  transcriptional regulator, LacI family  41.21 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3350  LacI family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4155  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.03 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.814015  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0116  transcriptional regulator, LacI family  37.5 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0032  Alanine racemase  38.91 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19154  normal  0.0639211 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0956  transcriptional regulator, LacI family  34.86 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  35.65 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0436  LacI family transcription regulator  34.12 
 
 		 341 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  34.33 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4888  LacI family transcription regulator  35.63 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.630665  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2764  alanine racemase  34.52 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  34.84 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.84 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  36.5 
 
 		 340 aa  153  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3792  transcriptional regulator LacI family  33.43 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4417  transcriptional regulator, LacI family  36.9 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2751  transcriptional regulator, LacI family  36.59 
 
 		 335 aa  149  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.360192  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1376  alanine racemase  32.45 
 
 		 339 aa  149  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5761  transcriptional regulator, LacI family  34.23 
 
 		 363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.079116 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3599  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.94 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  35.17 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  36.18 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3381  transcriptional regulator, LacI family  31.82 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289071 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  34.73 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0129  transcriptional regulator, LacI family  36.39 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3679  transcriptional regulator, LacI family  31.52 
 
 		 340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.196909 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2846  LacI family transcription regulator  34.76 
 
 		 326 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0984  transcriptional regulator, putative  32.15 
 
 		 339 aa  145  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.879842  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0074  LacI family transcription regulator  34.51 
 
 		 351 aa  145  9e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.840414  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  33.93 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  34.53 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0926  putative transcriptional regulator  31.86 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0128  transcriptional regulator, LacI family  34.12 
 
 		 340 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.531775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2876  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 		 342 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.900808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.52 
 
 		 337 aa  143  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  31.14 
 
 		 348 aa  142  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  32.83 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  33.73 
 
 		 352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  29.55 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1971  LacI family transcription regulator  33.73 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137395  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5848  LacI family transcription regulator  32.54 
 
 		 365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  29.17 
 
 		 339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.93 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  32.22 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  28.79 
 
 		 337 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  31.91 
 
 		 340 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01228  transcriptional regulator  33.88 
 
 		 354 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00348706  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 		 333 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.18 
 
 		 337 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.23 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1905  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1093  LacI family transcription regulator  35 
 
 		 351 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137161  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  28.48 
 
 		 335 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  32.23 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0229  LacI family transcription regulator  35.28 
 
 		 358 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.720422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  32.13 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0870  alanine racemase  34.03 
 
 		 351 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3896  LacI family transcription regulator  32.73 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  34.15 
 
 		 326 aa  136  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0081  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  28.1 
 
 		 333 aa  136  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  31.66 
 
 		 341 aa  136  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  29.79 
 
 		 333 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  33.93 
 
 		 337 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  32.93 
 
 		 338 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  34.02 
 
 		 333 aa  135  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3091  LacI family transcription regulator  35.47 
 
 		 328 aa  135  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  29.79 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0425  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.888688  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  29.79 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  29.79 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  29.79 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  27.71 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0168  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.84 
 
 		 347 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  32.83 
 
 		 333 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.04 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6389  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1984  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.42 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.016252  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3367  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.16 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00871192 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1780  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 		 345 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1438  transcriptional regulator, LacI family  32.48 
 
 		 337 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.63 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.63 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  29.97 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  33.43 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0696  transcriptional regulator, LacI family  34.34 
 
 		 357 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.477401 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  32.73 
 
 		 344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.93 
 
 		 335 aa  133  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>