More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4931 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4931  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 340 aa  648    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.699714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2988  transcriptional regulator, LacI family  42.22 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1317  transcriptional regulator, LacI family  43.64 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2169  transcriptional regulator, LacI family  40.06 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6905  transcriptional regulator, LacI family  35.5 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00908765  hitchhiker  0.00367965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4934  transcriptional regulator, LacI family  36.81 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.129155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5557  transcriptional regulator, LacI family  40.8 
 
 		 327 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.634318 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13620  transcriptional regulator  35.98 
 
 		 333 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2405  LacI family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.475476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1296  LacI family transcription regulator  37.65 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4675  transcriptional regulator, LacI family  35.99 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1766  transcriptional regulator, LacI family  35.19 
 
 		 340 aa  152  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0293304  normal  0.0298236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2612  transcriptional regulator, LacI family  36.36 
 
 		 342 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1322  transcriptional regulator, LacI family  36.23 
 
 		 336 aa  152  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10110  transcriptional regulator  39.71 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.625648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3464  LacI family transcription regulator  35.47 
 
 		 340 aa  149  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3594  transcriptional regulator, LacI family  35.87 
 
 		 339 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1083  transcriptional regulator, LacI family  36.47 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0310257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01800  transcriptional regulator  34.19 
 
 		 341 aa  145  9e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0414  regulatory protein LacI  39.17 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1842  transcriptional regulator, LacI family  37.65 
 
 		 323 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1242  LacI family transcription regulator  33.69 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3601  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0229751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17790  transcriptional regulator  39.17 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255976  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  30.41 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4925  transcriptional regulator, LacI family  32.22 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1191  transcriptional regulator, LacI family  34.5 
 
 		 336 aa  122  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.218553  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  31.47 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01470  transcriptional regulator  33.45 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0183  transcriptional regulator, LacI family  31.32 
 
 		 344 aa  119  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  30.75 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0420  LacI family transcription regulator  35.26 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0416  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0384  regulatory protein LacI  35.56 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.899866  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  30.1 
 
 		 342 aa  113  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1653  HTH-type transcriptional regulator  30.82 
 
 		 354 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117705  hitchhiker  0.0000123229 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  29.97 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  29.97 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  29.97 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  29.97 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  30.31 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  29.97 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  29.97 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  29.17 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0524  alanine racemase  34.75 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  29.97 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  29.97 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  29.97 
 
 		 343 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  29.19 
 
 		 342 aa  105  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  25.81 
 
 		 333 aa  105  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  28.52 
 
 		 337 aa  105  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3308  LacI family transcription regulator  30.17 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.608255  normal  0.781204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1277  LacI family transcription regulator  35.23 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0780915  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6588  LacI family transcription regulator  32.1 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  32.38 
 
 		 340 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  27.16 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5490  transcriptional regulator, LacI family  28.08 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932078  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.43 
 
 		 336 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  31.04 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  32.03 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  27.85 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1061  LacI family response repressor  31.69 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.023904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  27.85 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  29.53 
 
 		 347 aa  99.8  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  28.32 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  28.24 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3711  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  28.74 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  31.58 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  32.55 
 
 		 374 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  25.27 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  33.94 
 
 		 331 aa  98.6  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0240  LacI family transcription regulator  28.74 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3952  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  28.74 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0224  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.8 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.770893  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2762  alanine racemase  33.69 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  28.24 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  27.66 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  27.91 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  31.32 
 
 		 340 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  27.91 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  27.91 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0544  LacI family transcription regulator  27.11 
 
 		 335 aa  96.7  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  25.37 
 
 		 340 aa  96.7  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6733  transcriptional regulator, LacI family  31.49 
 
 		 354 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  27.91 
 
 		 332 aa  96.7  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  27.91 
 
 		 332 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7146  transcriptional regulator, LacI family  30.14 
 
 		 439 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  30.71 
 
 		 346 aa  95.9  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0471  LacI family transcription regulator  30.24 
 
 		 339 aa  95.9  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0818961  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0419  transcriptional regulator, LacI family  29.63 
 
 		 334 aa  95.9  8e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  32.92 
 
 		 338 aa  95.9  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  29.64 
 
 		 339 aa  95.9  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  31.43 
 
 		 340 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0291  alanine racemase  30.39 
 
 		 367 aa  95.9  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.910588 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  27.91 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1631  LacI family transcription regulator  28.7 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213128  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  32.18 
 
 		 339 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3367  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.36 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00871192 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1565  maltose operon transcriptional repressor  26.61 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1596  maltose operon transcriptional repressor  26.61 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>