More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0471 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0471  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 339 aa  674    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0818961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6733  transcriptional regulator, LacI family  46.55 
 
 		 354 aa  284  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06350  transcriptional regulator  43.87 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.752661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3762  LacI family transcription regulator  44.58 
 
 		 417 aa  246  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  39.88 
 
 		 339 aa  239  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1956  transcriptional regulator, LacI family  42.57 
 
 		 348 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000378532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6588  LacI family transcription regulator  35.74 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  32.38 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 349 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  31.97 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  33.84 
 
 		 339 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1637  LacI family transcription regulator  34.32 
 
 		 337 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.455476 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  31.56 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  31.16 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  32.57 
 
 		 355 aa  143  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  26.51 
 
 		 333 aa  143  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  30.03 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  37.12 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  33.89 
 
 		 337 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 		 340 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  32.04 
 
 		 382 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  36.67 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  36.33 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  33.64 
 
 		 355 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  27.65 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  33.99 
 
 		 336 aa  135  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  31.13 
 
 		 348 aa  135  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  29.17 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0224  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.8 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.770893  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1277  LacI family transcription regulator  37.71 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0780915  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0881  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.19 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188257  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  35.35 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  30.23 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  29.56 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.44 
 
 		 335 aa  133  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  36.36 
 
 		 328 aa  133  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  31.44 
 
 		 335 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  28.23 
 
 		 334 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  29.25 
 
 		 332 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.65 
 
 		 337 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.17 
 
 		 335 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  33.04 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  28.23 
 
 		 333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  32.34 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  29.75 
 
 		 338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  35.91 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6153  transcriptional regulator, LacI family  30.32 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.312144  hitchhiker  0.000597888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.52 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  30.95 
 
 		 335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.4 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  34.47 
 
 		 348 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  28.23 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  29.13 
 
 		 386 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  28.23 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  28.23 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  30.75 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  28.23 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0196  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.53 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0524  alanine racemase  36.12 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  35.42 
 
 		 339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  33.13 
 
 		 359 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  33.23 
 
 		 338 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  32.95 
 
 		 358 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0881  transcriptional regulator, LacI family  29.94 
 
 		 336 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00312464  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  31.72 
 
 		 334 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4583  transcriptional regulator, LacI family  34.78 
 
 		 343 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0718425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1878  transcriptional regulator, LacI family  33.44 
 
 		 351 aa  129  8.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0941149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6713  transcriptional regulator, LacI family  35.08 
 
 		 342 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.781502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.66 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2841  transcriptional regulator, LacI family  35.31 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  30.45 
 
 		 343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0120  LacI family transcription regulator  30.37 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5394  transcriptional regulator LacI family  30.62 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00772538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  31.76 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  31.76 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  33.65 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  30.45 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  30.45 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  31.76 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.87 
 
 		 336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2238  transcriptional regulator, LacI family  32.41 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  32.21 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6569  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0434919  normal  0.571175 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  26.43 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4021  transcriptional regulator, LacI family  35.09 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613602  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  33.92 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  30.18 
 
 		 331 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 361 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  34.2 
 
 		 352 aa  126  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1243  LacI family transcription regulator  34.78 
 
 		 339 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  31.21 
 
 		 346 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.22 
 
 		 335 aa  126  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.85 
 
 		 342 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0291  alanine racemase  31.27 
 
 		 367 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.910588 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  32.64 
 
 		 331 aa  126  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 		 473 aa  126  6e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2219  transcriptional regulator, LacI family  33.77 
 
 		 343 aa  126  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000733875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>