More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3464 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3464  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 340 aa  677    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0384  regulatory protein LacI  43.6 
 
 		 339 aa  248  8e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.899866  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10110  transcriptional regulator  43.73 
 
 		 342 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.625648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2988  transcriptional regulator, LacI family  44.18 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1083  transcriptional regulator, LacI family  40.72 
 
 		 335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0310257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5557  transcriptional regulator, LacI family  41.39 
 
 		 327 aa  219  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.634318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2169  transcriptional regulator, LacI family  39.04 
 
 		 337 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1296  LacI family transcription regulator  41.37 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4934  transcriptional regulator, LacI family  38.46 
 
 		 336 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.129155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2405  LacI family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 333 aa  209  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.475476 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1191  transcriptional regulator, LacI family  41.47 
 
 		 336 aa  210  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.218553  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1322  transcriptional regulator, LacI family  39.52 
 
 		 336 aa  206  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0414  regulatory protein LacI  42.95 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4675  transcriptional regulator, LacI family  39.83 
 
 		 335 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1766  transcriptional regulator, LacI family  38.1 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0293304  normal  0.0298236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1317  transcriptional regulator, LacI family  37.36 
 
 		 353 aa  186  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01800  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 341 aa  182  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17790  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255976  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1842  transcriptional regulator, LacI family  37.28 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1061  LacI family response repressor  34.93 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.023904  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2612  transcriptional regulator, LacI family  32.02 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13620  transcriptional regulator  32.74 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4931  transcriptional regulator, LacI family  35.47 
 
 		 340 aa  149  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.699714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1242  LacI family transcription regulator  32.27 
 
 		 340 aa  139  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6905  transcriptional regulator, LacI family  32.73 
 
 		 334 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00908765  hitchhiker  0.00367965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3594  transcriptional regulator, LacI family  32.2 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4925  transcriptional regulator, LacI family  31.44 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3601  transcriptional regulator, LacI family  31.31 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0229751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0183  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  27.13 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  30.06 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  32.52 
 
 		 362 aa  105  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  28.15 
 
 		 332 aa  105  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1846  LacI family transcription regulator  30.21 
 
 		 324 aa  105  9e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01470  transcriptional regulator  34.24 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  28.57 
 
 		 343 aa  102  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  28.57 
 
 		 343 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0420  LacI family transcription regulator  26.99 
 
 		 330 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  28.28 
 
 		 343 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  28.28 
 
 		 343 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  28.28 
 
 		 343 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  28.28 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  25.77 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  28.28 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  28.62 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  27.99 
 
 		 343 aa  99.8  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0416  LacI family transcription regulator  27.22 
 
 		 330 aa  99.4  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  27.99 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  27.46 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0544  LacI family transcription regulator  34.24 
 
 		 335 aa  98.6  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  32.02 
 
 		 355 aa  97.1  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  27.7 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  25.29 
 
 		 340 aa  96.7  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  28.35 
 
 		 342 aa  96.7  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  28.09 
 
 		 338 aa  96.3  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0679  catabolite control protein  35.87 
 
 		 333 aa  95.9  8e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.641859  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2354  LacI family transcription regulator  28.79 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0756754  normal  0.112701 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  34.9 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13210  transcriptional regulator, LacI family  26.51 
 
 		 345 aa  95.9  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1440  maltose operon repressor MalR, putative  26.82 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0132709  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3513  LacI family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 337 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  26.67 
 
 		 339 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2275  transcriptional regulator, LacI family  32.14 
 
 		 342 aa  93.6  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  27.83 
 
 		 340 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0419  transcriptional regulator, LacI family  25.88 
 
 		 334 aa  92.8  7e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  27.35 
 
 		 339 aa  92.8  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 		 339 aa  92.8  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1812  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 331 aa  92.8  8e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000564911  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 340 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5637  LacI family transcription regulator  27.64 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339737  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0226  LacI family transcription regulator  25.58 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0081  transcriptional regulator, LacI family  27.54 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  28.65 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  29.86 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2238  transcriptional regulator  28.02 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4919  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.09 
 
 		 349 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.35548 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38350  transcriptional regulator  27.43 
 
 		 343 aa  90.1  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  27.54 
 
 		 340 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0909  LacI family transcription regulator  32.07 
 
 		 338 aa  89.4  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  25.73 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  37.77 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  25.68 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1119  LacI family transcription regulator  30.24 
 
 		 347 aa  87.8  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140598 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3379  HTH-type transcriptional regulator RafR  35.33 
 
 		 336 aa  87  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3113  HTH-type transcriptional regulator RafR  34.16 
 
 		 336 aa  87  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05320  transcriptional regulator  30.72 
 
 		 371 aa  87  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0634  transcriptional regulator, LacI family  27.41 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0116  transcriptional regulator, LacI family  28.9 
 
 		 346 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0593  transcriptional regulator, LacI family  32.46 
 
 		 328 aa  87  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  33.17 
 
 		 332 aa  86.7  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.25 
 
 		 330 aa  86.3  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4583  transcriptional regulator, LacI family  28.18 
 
 		 343 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0718425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0436  catabolite control protein A  29.19 
 
 		 346 aa  86.3  8e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000109706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3659  transcriptional regulator, LacI family  35.42 
 
 		 343 aa  85.9  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.52 
 
 		 331 aa  85.9  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1434  transcriptional regulator, LacI family  27.41 
 
 		 338 aa  85.9  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0848  transcriptional regulator, LacI family  29.29 
 
 		 334 aa  85.9  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0684  LacI family transcription regulator  34.46 
 
 		 328 aa  85.9  9e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0236047  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03798  galactose operon repressor  32.8 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  26.48 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>