More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1322 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1322  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 336 aa  660    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1083  transcriptional regulator, LacI family  69.97 
 
 		 335 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0310257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10110  transcriptional regulator  66.77 
 
 		 342 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.625648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1766  transcriptional regulator, LacI family  59.4 
 
 		 340 aa  385  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0293304  normal  0.0298236 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1191  transcriptional regulator, LacI family  59.4 
 
 		 336 aa  368  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.218553  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0414  regulatory protein LacI  59.35 
 
 		 333 aa  340  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2988  transcriptional regulator, LacI family  54.49 
 
 		 328 aa  309  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2405  LacI family transcriptional regulator  52.87 
 
 		 333 aa  309  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.475476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1296  LacI family transcription regulator  52.87 
 
 		 334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1317  transcriptional regulator, LacI family  54.94 
 
 		 353 aa  296  4e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2169  transcriptional regulator, LacI family  50.75 
 
 		 337 aa  292  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4934  transcriptional regulator, LacI family  51.64 
 
 		 336 aa  290  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.129155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5557  transcriptional regulator, LacI family  51.52 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.634318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4675  transcriptional regulator, LacI family  48.5 
 
 		 335 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1842  transcriptional regulator, LacI family  46.87 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13620  transcriptional regulator  43.54 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2612  transcriptional regulator, LacI family  42.51 
 
 		 342 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3464  LacI family transcription regulator  39.52 
 
 		 340 aa  210  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01800  transcriptional regulator  40.06 
 
 		 341 aa  208  9e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3601  transcriptional regulator, LacI family  39.58 
 
 		 358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0229751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4925  transcriptional regulator, LacI family  39.58 
 
 		 358 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6905  transcriptional regulator, LacI family  36.93 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00908765  hitchhiker  0.00367965 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0384  regulatory protein LacI  38.62 
 
 		 339 aa  186  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.899866  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1242  LacI family transcription regulator  34.33 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0183  transcriptional regulator, LacI family  34.62 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3594  transcriptional regulator, LacI family  37.25 
 
 		 339 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4931  transcriptional regulator, LacI family  36.23 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.699714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  30.97 
 
 		 333 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17790  transcriptional regulator  46.99 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255976  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  34.16 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  33.62 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01470  transcriptional regulator  34.14 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1061  LacI family response repressor  37.5 
 
 		 328 aa  133  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.023904  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  35.55 
 
 		 353 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0544  LacI family transcription regulator  33.04 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  31.79 
 
 		 339 aa  126  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4583  transcriptional regulator, LacI family  32.05 
 
 		 343 aa  126  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0718425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2354  LacI family transcription regulator  32.27 
 
 		 344 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0756754  normal  0.112701 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  33.52 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  32.1 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  32.66 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  33.43 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  32.2 
 
 		 341 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4929  LacI family transcription regulator  33.99 
 
 		 346 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33528  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 357 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  32.84 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  30.72 
 
 		 337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  31.4 
 
 		 347 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0467  putative raffinose repressor  30.67 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0713  putative raffinose repressor  30.67 
 
 		 338 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1009  putative raffinose repressor  30.67 
 
 		 338 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1982  putative raffinose repressor  30.67 
 
 		 338 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7709  LacI family transcription regulator  29.5 
 
 		 337 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0824  transcriptional regulator RafR, putative  30.37 
 
 		 338 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0737  transcriptional regulator RafR, putative  30.37 
 
 		 338 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.58 
 
 		 335 aa  119  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0967  LacI family transcription regulator  30.59 
 
 		 352 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5484  LacI family transcription regulator  33.71 
 
 		 345 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238485 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3246  LacI family transcription regulator  32.12 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.759172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  30.72 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  32.16 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4095  LacI family transcription regulator  31.21 
 
 		 342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3896  LacI family transcription regulator  31.86 
 
 		 339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4271  LacI family transcription regulator  31.21 
 
 		 342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  30.22 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  32.75 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2103  LacI family regulatory protein  30.37 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  29.71 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2275  transcriptional regulator, LacI family  34.07 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4580  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 351 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821982 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  29.28 
 
 		 340 aa  116  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  31.36 
 
 		 340 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  27.01 
 
 		 341 aa  116  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1871  raffinose repressor, putative  29.75 
 
 		 336 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  30.95 
 
 		 343 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4172  LacI family transcription regulator  31.77 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0578357  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5637  LacI family transcription regulator  34.11 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339737  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  29.02 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2083  LacI family transcription regulator  30.84 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0686  LacI family transcription regulator  30.47 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5204  LacI family transcription regulator  33.05 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210784  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2982  transcriptional regulator, LacI family  30.48 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000384304  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5655  LacI family transcription regulator  33.05 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  normal  0.330046 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3199  LacI family transcription regulator  32.5 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.13351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1631  LacI family transcription regulator  28.1 
 
 		 381 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213128  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  31.99 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3699  LacI family transcription regulator  30.61 
 
 		 344 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3709  galactose operon repressor  26.39 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1846  LacI family transcription regulator  29.5 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  30.95 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3513  LacI family transcriptional regulator  35 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  28.99 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  28.99 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  28.99 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  30.66 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  30.95 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  30.79 
 
 		 334 aa  109  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  29.65 
 
 		 355 aa  110  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  30.92 
 
 		 348 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  28.65 
 
 		 343 aa  109  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>