More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4925 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3601  transcriptional regulator, LacI family  90.5 
 
 		 358 aa  636    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0229751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4925  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 358 aa  704    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3594  transcriptional regulator, LacI family  58.51 
 
 		 339 aa  345  8.999999999999999e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1296  LacI family transcription regulator  40.48 
 
 		 334 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1242  LacI family transcription regulator  35.44 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1766  transcriptional regulator, LacI family  37.16 
 
 		 340 aa  192  9e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0293304  normal  0.0298236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2405  LacI family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 333 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.475476 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1083  transcriptional regulator, LacI family  40.79 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0310257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1322  transcriptional regulator, LacI family  39.58 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2169  transcriptional regulator, LacI family  36.81 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01470  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 351 aa  177  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10110  transcriptional regulator  37.13 
 
 		 342 aa  176  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.625648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4934  transcriptional regulator, LacI family  35.44 
 
 		 336 aa  176  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.129155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5557  transcriptional regulator, LacI family  37.8 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.634318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1842  transcriptional regulator, LacI family  36.97 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2612  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4675  transcriptional regulator, LacI family  36.12 
 
 		 335 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0183  transcriptional regulator, LacI family  34.09 
 
 		 344 aa  170  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1191  transcriptional regulator, LacI family  35.26 
 
 		 336 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.218553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2988  transcriptional regulator, LacI family  37.17 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 333 aa  152  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0414  regulatory protein LacI  38.62 
 
 		 333 aa  152  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13620  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  32.65 
 
 		 342 aa  143  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6905  transcriptional regulator, LacI family  31.85 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00908765  hitchhiker  0.00367965 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  30.56 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1317  transcriptional regulator, LacI family  36.36 
 
 		 353 aa  132  7.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01800  transcriptional regulator  32.85 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  30.79 
 
 		 332 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  30.18 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2854  LacI family transcription regulator  31.01 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7709  LacI family transcription regulator  30.29 
 
 		 337 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5490  transcriptional regulator, LacI family  32.19 
 
 		 337 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932078  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6588  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 342 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  27.22 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3464  LacI family transcription regulator  31.44 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  26.92 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4931  transcriptional regulator, LacI family  32.22 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.699714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0848  transcriptional regulator, LacI family  29.21 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  28.95 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  26.92 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  26.92 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  26.92 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  29.15 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  26.92 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  26.92 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3113  HTH-type transcriptional regulator RafR  33.58 
 
 		 336 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3379  HTH-type transcriptional regulator RafR  33.58 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1277  LacI family transcription regulator  32.65 
 
 		 344 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0780915  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3308  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 346 aa  123  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.608255  normal  0.781204 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  26.92 
 
 		 340 aa  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  26.79 
 
 		 343 aa  122  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  28.06 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  26.63 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  33.04 
 
 		 342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  26.67 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  28.49 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2659  transcriptional regulator, LacI family  38.04 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3847  transcriptional regulator, LacI family  32.65 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  29.77 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1653  HTH-type transcriptional regulator  30.14 
 
 		 354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117705  hitchhiker  0.0000123229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  30.09 
 
 		 353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0524  alanine racemase  32.65 
 
 		 339 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  30.23 
 
 		 340 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.65 
 
 		 336 aa  119  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0634  transcriptional regulator, LacI family  28.25 
 
 		 334 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  29.15 
 
 		 334 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  29.15 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  26.63 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.82 
 
 		 336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1945  LacI family transcription regulator  30.17 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  30.31 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5394  transcriptional regulator LacI family  29.31 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00772538  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  30.59 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.93 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  30.23 
 
 		 338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  28.86 
 
 		 346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 		 339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  29.88 
 
 		 339 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  30.68 
 
 		 338 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5078  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.03 
 
 		 337 aa  116  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0397942  normal  0.741474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  30.75 
 
 		 340 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  32.74 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  27.84 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  30.17 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  26.35 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.8 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  29.65 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1332  transcriptional regulator, LacI family  36.02 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  30.2 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  28 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  28.29 
 
 		 346 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  25.6 
 
 		 337 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  28.41 
 
 		 333 aa  113  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  28.49 
 
 		 335 aa  113  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  29.91 
 
 		 332 aa  113  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4888  LacI family transcription regulator  33.71 
 
 		 336 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.630665  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1063  LacI family transcription regulator  27.9 
 
 		 325 aa  112  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  27.08 
 
 		 332 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.65 
 
 		 335 aa  112  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>