More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1565 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1565  maltose operon transcriptional repressor  100 
 
 
339 aa  692    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1596  maltose operon transcriptional repressor  100 
 
 
339 aa  692    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  35.21 
 
 
339 aa  212  7e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  35.67 
 
 
341 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  35.76 
 
 
343 aa  202  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  35.76 
 
 
343 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  36.05 
 
 
343 aa  202  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  35.76 
 
 
343 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  35.76 
 
 
343 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  35.76 
 
 
343 aa  202  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  35.76 
 
 
340 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  36.95 
 
 
342 aa  202  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  36.18 
 
 
343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  34.88 
 
 
340 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  34.59 
 
 
343 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  34.72 
 
 
337 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1440  maltose operon repressor MalR, putative  31.87 
 
 
342 aa  177  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0132709  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1846  LacI family transcription regulator  32.05 
 
 
324 aa  169  5e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  30.41 
 
 
342 aa  169  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0420  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 
330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0416  LacI family transcription regulator  32.63 
 
 
330 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  28.88 
 
 
340 aa  157  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  27.46 
 
 
340 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  28.79 
 
 
337 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0051  LacI family transcription regulator  30.67 
 
 
311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000223899  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2155  LacI family transcription regulator  31.53 
 
 
336 aa  143  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  28.32 
 
 
338 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  26.98 
 
 
358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  27.99 
 
 
331 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  29.71 
 
 
336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  27.35 
 
 
338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1802  LacI family transcription regulator  28.66 
 
 
332 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01297  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.66 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.111293  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2326  transcriptional regulator, LacI family  28.66 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000810119  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1435  LacI family transcription regulator  28.66 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1531  LacI family transcription regulator  28.97 
 
 
332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2305  LacI family transcription regulator  28.66 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00729932  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01308  hypothetical protein  28.66 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0638482  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  26.11 
 
 
346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  27.35 
 
 
328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  27.08 
 
 
339 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  27.14 
 
 
335 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1553  transcriptional regulator, LacI family  28.66 
 
 
332 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  25.82 
 
 
344 aa  126  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  25.6 
 
 
340 aa  125  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  25.44 
 
 
337 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  26.25 
 
 
327 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  27.1 
 
 
330 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  28.24 
 
 
334 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  27.1 
 
 
330 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  27.1 
 
 
330 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  26.81 
 
 
343 aa  125  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  26.98 
 
 
338 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  27.1 
 
 
330 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.43 
 
 
336 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  28.33 
 
 
341 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.22 
 
 
333 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  26.77 
 
 
330 aa  124  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  27.22 
 
 
333 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  26.44 
 
 
332 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  26.38 
 
 
333 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  26.47 
 
 
343 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  26.47 
 
 
343 aa  122  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  26.47 
 
 
343 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  26.47 
 
 
343 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1965  transcriptional regulator, LacI family  28.04 
 
 
332 aa  122  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  27.42 
 
 
332 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  27.42 
 
 
332 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0891  LacI family transcription regulator  27.8 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.890397  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  27.42 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  27.99 
 
 
473 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  24.56 
 
 
338 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3330  transcriptional regulator, LacI family  26.25 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  0.198785 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03639  DNA-binding transcriptional repressor of ribose metabolism  26.77 
 
 
330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13210  transcriptional regulator, LacI family  27.78 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  26.77 
 
 
330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  27.42 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  27.44 
 
 
334 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  26.7 
 
 
333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  26.3 
 
 
348 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  28.43 
 
 
333 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  27.06 
 
 
344 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  24.71 
 
 
340 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  27.1 
 
 
332 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  24.42 
 
 
340 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  25.95 
 
 
333 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4021  transcriptional regulator, LacI family  24.04 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613602  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  24.05 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  26.24 
 
 
334 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  23.51 
 
 
349 aa  116  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  25.51 
 
 
331 aa  116  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  23.82 
 
 
337 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  27.27 
 
 
333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  24.64 
 
 
343 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  24.71 
 
 
340 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  27.19 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1861  transcriptional regulator  26.61 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.453605  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.27 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  25.29 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  23.53 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>