More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0051 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0051  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 311 aa  648    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000223899  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0891  LacI family transcription regulator  36.93 
 
 		 328 aa  207  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.890397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  31.79 
 
 		 339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  31.66 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1596  maltose operon transcriptional repressor  30.67 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1565  maltose operon transcriptional repressor  30.67 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  31.55 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  31.25 
 
 		 340 aa  145  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  29.43 
 
 		 342 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  31.13 
 
 		 343 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  31.23 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  31.23 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  31.23 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  31.23 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  31.23 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  31.23 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  30.16 
 
 		 340 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1440  maltose operon repressor MalR, putative  31.75 
 
 		 342 aa  142  5e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0132709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  29.84 
 
 		 343 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  29.47 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0420  LacI family transcription regulator  28.7 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130171  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0416  LacI family transcription regulator  28.4 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1846  LacI family transcription regulator  28.16 
 
 		 324 aa  136  5e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0419  transcriptional regulator, LacI family  27.42 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  25.48 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1965  transcriptional regulator, LacI family  27.71 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.39 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1531  LacI family transcription regulator  27.71 
 
 		 332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1553  transcriptional regulator, LacI family  27.71 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  28.94 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.94 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01297  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.71 
 
 		 332 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.111293  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2326  transcriptional regulator, LacI family  27.71 
 
 		 332 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000810119  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1435  LacI family transcription regulator  27.71 
 
 		 332 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2305  LacI family transcription regulator  27.71 
 
 		 332 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00729932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01308  hypothetical protein  27.71 
 
 		 332 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0638482  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  26.65 
 
 		 342 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1802  LacI family transcription regulator  27.07 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  26.71 
 
 		 336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  26.12 
 
 		 338 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  26.53 
 
 		 351 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  25.72 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5384  transcriptional regulator, LacI family  26.59 
 
 		 336 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  27.17 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.06 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  27.04 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7709  LacI family transcription regulator  29.65 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  24.27 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0224  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.15 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.770893  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01891  putative sugar-binding protein  28.62 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0103851  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  26.05 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 339 aa  99.4  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0892  LacI family transcription regulator  25.32 
 
 		 346 aa  99  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00803151  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0634  transcriptional regulator, LacI family  30.73 
 
 		 334 aa  99  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  25 
 
 		 346 aa  98.6  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0848  transcriptional regulator, LacI family  30.28 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3896  LacI family transcription regulator  25.81 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  25.71 
 
 		 343 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2155  LacI family transcription regulator  26.84 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2185  LacI family transcription regulator  29.63 
 
 		 339 aa  96.3  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1618  DNA-binding transcriptional repressor MalI  30.04 
 
 		 340 aa  96.7  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.671811  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  28.64 
 
 		 336 aa  96.3  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  24.15 
 
 		 338 aa  96.3  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1640  LacI family transcription regulator  26.04 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2621  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.62 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59427  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  23.74 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1521  transcriptional regulator, LacI family  24.61 
 
 		 342 aa  93.6  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1878  transcriptional regulator, LacI family  25.48 
 
 		 351 aa  93.2  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0941149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1847  LacI family transcription regulator  29.63 
 
 		 346 aa  92.8  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  31.31 
 
 		 336 aa  92.4  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  24.91 
 
 		 346 aa  92.4  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0974  putative sugar-binding protein  30.55 
 
 		 340 aa  91.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2345  alanine racemase  30.26 
 
 		 351 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1282  LacI family transcription regulator  27.88 
 
 		 352 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000725073  normal  0.939834 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0686  LacI family transcription regulator  28.31 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2461  LacI family transcription regulator  30.26 
 
 		 351 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1769  LacI family transcription regulator  29.26 
 
 		 346 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  25.08 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1484  transcriptional regulator, LacI family  25.08 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2002  transcriptional regulator, LacI family  30.26 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000460258 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  24.7 
 
 		 323 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2196  LacI family transcription regulator  30.04 
 
 		 340 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0908748  hitchhiker  0.000488625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2356  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.26 
 
 		 348 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  24.7 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  24.7 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  24.15 
 
 		 340 aa  90.5  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  24.7 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08380  transcriptional regulator  26.69 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.689367  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  25.3 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1655  LacI family transcription regulator  30.07 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.677065  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  24.7 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  24.05 
 
 		 324 aa  90.1  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  23.57 
 
 		 342 aa  90.1  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  24.85 
 
 		 323 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  24.85 
 
 		 323 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1653  HTH-type transcriptional regulator  29.11 
 
 		 354 aa  89.7  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117705  hitchhiker  0.0000123229 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  25 
 
 		 347 aa  89.7  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  23.57 
 
 		 337 aa  89.7  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1870  LacI family transcription regulator  29.71 
 
 		 342 aa  89.4  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>