More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0891 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0891  LacI family transcription regulator  100 
 
 
328 aa  677    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.890397  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0051  LacI family transcription regulator  36.93 
 
 
311 aa  207  2e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000223899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  31.85 
 
 
343 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  31.14 
 
 
343 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  31.85 
 
 
342 aa  149  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  31.14 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  31.14 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  31.14 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  31.14 
 
 
343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  31.14 
 
 
343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  31.14 
 
 
343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  31.14 
 
 
343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  30.84 
 
 
343 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  29.52 
 
 
339 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  30.45 
 
 
341 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1440  maltose operon repressor MalR, putative  31.21 
 
 
342 aa  122  7e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0132709  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1565  maltose operon transcriptional repressor  27.8 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1596  maltose operon transcriptional repressor  27.8 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  27.88 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0419  transcriptional regulator, LacI family  27.52 
 
 
334 aa  114  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1846  LacI family transcription regulator  31.04 
 
 
324 aa  114  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0420  LacI family transcription regulator  27.07 
 
 
330 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130171  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  30.42 
 
 
340 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  26.93 
 
 
342 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0416  LacI family transcription regulator  26.11 
 
 
330 aa  96.3  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  27.41 
 
 
337 aa  95.9  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  29.52 
 
 
336 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.19 
 
 
336 aa  93.2  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  25.65 
 
 
339 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1730  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.77 
 
 
353 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0821566  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  30.29 
 
 
343 aa  86.3  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3492  transcriptional regulator, LacI family  31.18 
 
 
350 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  25.45 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1780  sucrose operon repressor  26.1 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000248781 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  26.17 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3787  transcriptional regulator, LacI family  30.11 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2398  transcriptional regulator LacI family  27.64 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2338  transcriptional regulator, LacI family  25.51 
 
 
347 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342005  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  25.8 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2621  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.82 
 
 
342 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59427  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  25.39 
 
 
346 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2405  LacI family transcriptional regulator  28.48 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.475476 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1481  transcriptional regulator, LacI family  25.74 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0224  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.7 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.770893  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2099  transcriptional regulator, LacI family  25.1 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.116566 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0198  LacI family response repressor  27.35 
 
 
368 aa  79.3  0.00000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.258556  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3245  transcriptional regulator, LacI family  23.39 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  29.38 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0392  LacI family transcription regulator  28.12 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0318668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2407  LacI family transcription regulator  27.25 
 
 
341 aa  77  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0634  transcriptional regulator, LacI family  27.93 
 
 
334 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1332  transcriptional regulator, LacI family  27.12 
 
 
341 aa  77  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  23.64 
 
 
338 aa  75.9  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  25.15 
 
 
473 aa  75.9  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0848  transcriptional regulator, LacI family  28.98 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2659  transcriptional regulator, LacI family  27.93 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0989  transcriptional regulator, LacI family  24.19 
 
 
342 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  26.38 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  24 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.49 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4172  LacI family transcription regulator  26.14 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0578357  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.45 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.33 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.945809  hitchhiker  0.0011577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  53.85 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  23.64 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  24.45 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3699  LacI family transcription regulator  26.14 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3656  transcriptional regulator, LacI family  24.71 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1282  LacI family transcription regulator  28.25 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000725073  normal  0.939834 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  25.12 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1521  transcriptional regulator, LacI family  24.19 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  24.3 
 
 
361 aa  72.8  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3513  LacI family transcriptional regulator  29.55 
 
 
337 aa  72.4  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5384  transcriptional regulator, LacI family  26.67 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  22.96 
 
 
331 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  23.51 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  27.2 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  23.96 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1296  LacI family transcription regulator  27.81 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  24.3 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  29.44 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3491  transcriptional regulator, LacI family  24.71 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.201292  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5334  transcriptional regulator, LacI family  26.52 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.431046 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5075  transcriptional regulator, LacI family  30.81 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  26.97 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3460  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.3 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.105579  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  25.08 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2141  LacI family transcription regulator  30.39 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0418584  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0376  transcriptional regulator, LacI family  26.94 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3379  HTH-type transcriptional regulator RafR  25.99 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0967  LacI family transcription regulator  26.99 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3221  transcriptional regulator, LacI family  27.23 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  31.84 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1071  regulatory protein, LacI  27.23 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3113  HTH-type transcriptional regulator RafR  25.99 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0783  transcriptional regulator repressor  26.4 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1170  LacI family transcription regulator  27.23 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4919  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.83 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.35548 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1135  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.23 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3313  transcriptional regulator, LacI family  37.89 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0187548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>