More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2099 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2099  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 346 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.116566 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2338  transcriptional regulator, LacI family  95.97 
 
 		 347 aa  679    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2398  transcriptional regulator LacI family  80.62 
 
 		 349 aa  539  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1730  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  66.28 
 
 		 353 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0821566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3460  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  56.71 
 
 		 344 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.105579  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3787  transcriptional regulator, LacI family  43.69 
 
 		 350 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3492  transcriptional regulator, LacI family  42.46 
 
 		 350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3936  LacI family transcription regulator  41.57 
 
 		 357 aa  263  4e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125487  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2762  alanine racemase  28.4 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0291  alanine racemase  30.73 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.910588 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0783  transcriptional regulator repressor  29.65 
 
 		 342 aa  139  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4919  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.66 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.35548 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5490  transcriptional regulator, LacI family  29.18 
 
 		 337 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932078  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1871  raffinose repressor, putative  31.66 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2103  LacI family regulatory protein  31.09 
 
 		 336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0824  transcriptional regulator RafR, putative  31.09 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0737  transcriptional regulator RafR, putative  31.09 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3379  HTH-type transcriptional regulator RafR  30.09 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0713  putative raffinose repressor  31.09 
 
 		 338 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1009  putative raffinose repressor  31.09 
 
 		 338 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1982  putative raffinose repressor  31.09 
 
 		 338 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0467  putative raffinose repressor  31.09 
 
 		 336 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3113  HTH-type transcriptional regulator RafR  29.79 
 
 		 336 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2939  alanine racemase  28.03 
 
 		 340 aa  129  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0302  sugar-binding protein, putative  27.25 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0278  putative sugar-binding protein  27.25 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.396781  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5384  transcriptional regulator, LacI family  30.28 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6046  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 338 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234203  hitchhiker  0.00000507453 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  24.39 
 
 		 382 aa  126  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0386  transcriptional regulator, LacI family  28.96 
 
 		 341 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0354  transcriptional regulator, LacI family  28.48 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.152547 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5998  transcriptional regulator, LacI family  27.96 
 
 		 345 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7146  transcriptional regulator, LacI family  27.96 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  25.98 
 
 		 339 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1282  LacI family transcription regulator  29.53 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000725073  normal  0.939834 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3699  LacI family transcription regulator  29.28 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5394  transcriptional regulator LacI family  27.81 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00772538  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7709  LacI family transcription regulator  27.81 
 
 		 337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3246  LacI family transcription regulator  30.46 
 
 		 342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.759172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4095  LacI family transcription regulator  27.99 
 
 		 342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4271  LacI family transcription regulator  27.99 
 
 		 342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4172  LacI family transcription regulator  30.22 
 
 		 344 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0578357  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3813  alanine racemase  30.82 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2491  LacI family transcription regulator  26.13 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.934393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2393  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  26.13 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  7.93999e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  30.37 
 
 		 340 aa  116  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  23.8 
 
 		 338 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  31.45 
 
 		 473 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  30.03 
 
 		 340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6588  LacI family transcription regulator  28.01 
 
 		 342 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3308  LacI family transcription regulator  28.48 
 
 		 346 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.608255  normal  0.781204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  29.28 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  28.97 
 
 		 343 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  31.25 
 
 		 348 aa  109  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6569  transcriptional regulator, LacI family  25.53 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0434919  normal  0.571175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0224  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.13 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.770893  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  27.41 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  27.69 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2621  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.83 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59427  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.83 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1653  HTH-type transcriptional regulator  28.4 
 
 		 354 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117705  hitchhiker  0.0000123229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1248  transcriptional regulator, LacI family  27.13 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0782052 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6153  transcriptional regulator, LacI family  25.64 
 
 		 347 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.312144  hitchhiker  0.000597888 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  27.3 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2659  transcriptional regulator, LacI family  34.78 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4078  LacI family transcription regulator  26.95 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06350  transcriptional regulator  30.14 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.752661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1332  transcriptional regulator, LacI family  26.91 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1945  LacI family transcription regulator  28.19 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  27.1 
 
 		 342 aa  100  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0634  transcriptional regulator, LacI family  27.27 
 
 		 334 aa  99.4  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3504  transcriptional regulator, LacI family protein  24.21 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0875897  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  25.17 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6733  transcriptional regulator, LacI family  23.19 
 
 		 354 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0848  transcriptional regulator, LacI family  26.97 
 
 		 334 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  24.2 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0524  alanine racemase  25.9 
 
 		 339 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  28.97 
 
 		 343 aa  97.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  26.73 
 
 		 336 aa  95.9  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  25.48 
 
 		 339 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2854  LacI family transcription regulator  25.89 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  25.72 
 
 		 339 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  28.09 
 
 		 343 aa  94  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01891  putative sugar-binding protein  24.1 
 
 		 343 aa  94  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0103851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0183  transcriptional regulator, LacI family  26.57 
 
 		 344 aa  94.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1956  transcriptional regulator, LacI family  30.3 
 
 		 348 aa  93.2  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000378532 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  27.33 
 
 		 332 aa  92.8  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02412  transcriptional regulator  25 
 
 		 343 aa  92.8  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1655  LacI family transcription regulator  24.78 
 
 		 366 aa  92.8  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.677065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  26.25 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2261  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.62 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.276208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2555  transcriptional regulator, LacI family  26.41 
 
 		 369 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679604  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  26.51 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05070  putative LacI-family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.697537  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06445  LacI family transcriptional regulator  24.13 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  24.29 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1376  alanine racemase  25.38 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3381  transcriptional regulator, LacI family  26.69 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289071 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2837  transcriptional regulator, LacI family  25.24 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672578  normal  0.365252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>