More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3787 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3787  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 350 aa  709    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3492  transcriptional regulator, LacI family  94.29 
 
 		 350 aa  677    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3936  LacI family transcription regulator  47.08 
 
 		 357 aa  319  5e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125487  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3460  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  44.67 
 
 		 344 aa  305  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.105579  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2099  transcriptional regulator, LacI family  43.69 
 
 		 346 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.116566 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2338  transcriptional regulator, LacI family  42.77 
 
 		 347 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2398  transcriptional regulator LacI family  42.33 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1730  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.9 
 
 		 353 aa  265  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0821566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2762  alanine racemase  30.72 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  24.7 
 
 		 382 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2939  alanine racemase  29.27 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4095  LacI family transcription regulator  36.45 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4271  LacI family transcription regulator  36.45 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3246  LacI family transcription regulator  30.86 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.759172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 339 aa  132  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0737  transcriptional regulator RafR, putative  30.65 
 
 		 338 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0824  transcriptional regulator RafR, putative  30.65 
 
 		 338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2103  LacI family regulatory protein  30.54 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1871  raffinose repressor, putative  30.86 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0713  putative raffinose repressor  30.36 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1009  putative raffinose repressor  30.36 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1982  putative raffinose repressor  30.36 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4172  LacI family transcription regulator  36.28 
 
 		 344 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0578357  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0467  putative raffinose repressor  30.24 
 
 		 336 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3699  LacI family transcription regulator  36.28 
 
 		 344 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  27.16 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6046  LacI family transcription regulator  37.38 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234203  hitchhiker  0.00000507453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  28.27 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5490  transcriptional regulator, LacI family  29.82 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932078  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5384  transcriptional regulator, LacI family  27.74 
 
 		 336 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0291  alanine racemase  29.23 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.910588 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0302  sugar-binding protein, putative  26.52 
 
 		 338 aa  123  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0278  putative sugar-binding protein  26.52 
 
 		 338 aa  123  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.396781  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2491  LacI family transcription regulator  26.88 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.934393  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  28.91 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2393  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  26.88 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  7.93999e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3813  alanine racemase  29.57 
 
 		 340 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  25.23 
 
 		 339 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0783  transcriptional regulator repressor  28.88 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.95 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  26.3 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4078  LacI family transcription regulator  27.03 
 
 		 331 aa  116  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0386  transcriptional regulator, LacI family  28.18 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7709  LacI family transcription regulator  31.25 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  28.4 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5394  transcriptional regulator LacI family  26.71 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00772538  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  27.3 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0354  transcriptional regulator, LacI family  27.33 
 
 		 342 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.152547 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  28.7 
 
 		 473 aa  113  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  24.7 
 
 		 341 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  28.53 
 
 		 343 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.84 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  26.84 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6569  transcriptional regulator, LacI family  25.48 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0434919  normal  0.571175 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7146  transcriptional regulator, LacI family  28.3 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5998  transcriptional regulator, LacI family  27.74 
 
 		 345 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0591  LacI family transcription regulator  27.94 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01891  putative sugar-binding protein  27.17 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0103851  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0224  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.65 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.770893  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  21.23 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4021  transcriptional regulator, LacI family  26.74 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613602  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  22.22 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  27.61 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  27.19 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  26.27 
 
 		 368 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0403  transcriptional regulator, LacI family  28.48 
 
 		 350 aa  106  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1653  HTH-type transcriptional regulator  26.27 
 
 		 354 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117705  hitchhiker  0.0000123229 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0634  transcriptional regulator, LacI family  27.76 
 
 		 334 aa  105  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  26.13 
 
 		 338 aa  105  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3504  transcriptional regulator, LacI family protein  24.11 
 
 		 340 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0875897  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0524  alanine racemase  25.41 
 
 		 339 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4919  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.47 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.35548 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  22.49 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6153  transcriptional regulator, LacI family  24.52 
 
 		 347 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.312144  hitchhiker  0.000597888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  26.32 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1332  transcriptional regulator, LacI family  32.86 
 
 		 341 aa  103  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  26.21 
 
 		 338 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3308  LacI family transcription regulator  24.49 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.608255  normal  0.781204 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  23.56 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  25.07 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1896  sugar-binding transcriptional regulator RegR  26.11 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.150149  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  26.98 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2621  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.51 
 
 		 342 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59427  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1282  LacI family transcription regulator  26.67 
 
 		 352 aa  99.8  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000725073  normal  0.939834 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0419  transcriptional regulator, LacI family  26.79 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  25.08 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6650  transcriptional regulator, LacI family  27.47 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  27.73 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0420  LacI family transcription regulator  26.75 
 
 		 330 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130171  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2841  transcriptional regulator, LacI family  32.63 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  25.22 
 
 		 333 aa  97.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  25.15 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3379  HTH-type transcriptional regulator RafR  30.14 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  21.88 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2659  transcriptional regulator, LacI family  34.41 
 
 		 340 aa  97.4  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  21.88 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  23.19 
 
 		 340 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.56 
 
 		 335 aa  97.1  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  21.88 
 
 		 332 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3113  HTH-type transcriptional regulator RafR  29.67 
 
 		 336 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.021598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>