More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4078 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_4078  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 331 aa  679    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1332  transcriptional regulator, LacI family  66.97 
 
 		 341 aa  444  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3113  HTH-type transcriptional regulator RafR  65.45 
 
 		 336 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3379  HTH-type transcriptional regulator RafR  65.45 
 
 		 336 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2659  transcriptional regulator, LacI family  65.96 
 
 		 340 aa  420  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0634  transcriptional regulator, LacI family  57.96 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0848  transcriptional regulator, LacI family  57.36 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2393  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  55.12 
 
 		 338 aa  358  9e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  7.93999e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2491  LacI family transcription regulator  55.12 
 
 		 338 aa  358  9e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.934393  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0224  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.34 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.770893  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3699  LacI family transcription regulator  43.67 
 
 		 344 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4172  LacI family transcription regulator  43.67 
 
 		 344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0578357  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4095  LacI family transcription regulator  43.37 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3246  LacI family transcription regulator  43.67 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.759172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4271  LacI family transcription regulator  43.37 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1871  raffinose repressor, putative  42.17 
 
 		 336 aa  236  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0467  putative raffinose repressor  42.51 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0737  transcriptional regulator RafR, putative  42.51 
 
 		 338 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0824  transcriptional regulator RafR, putative  42.51 
 
 		 338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2103  LacI family regulatory protein  42.51 
 
 		 336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0713  putative raffinose repressor  42.22 
 
 		 338 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1009  putative raffinose repressor  42.22 
 
 		 338 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1982  putative raffinose repressor  42.22 
 
 		 338 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6046  LacI family transcription regulator  41.99 
 
 		 338 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234203  hitchhiker  0.00000507453 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7709  LacI family transcription regulator  38.55 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5490  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 337 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932078  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0291  alanine racemase  34.23 
 
 		 367 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.910588 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  32.72 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0386  transcriptional regulator, LacI family  35.56 
 
 		 341 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0354  transcriptional regulator, LacI family  36.82 
 
 		 342 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.152547 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1945  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2939  alanine racemase  33.24 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5384  transcriptional regulator, LacI family  31.69 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3813  alanine racemase  33.53 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3308  LacI family transcription regulator  36.3 
 
 		 346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.608255  normal  0.781204 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1653  HTH-type transcriptional regulator  32.07 
 
 		 354 aa  153  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117705  hitchhiker  0.0000123229 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0302  sugar-binding protein, putative  32.36 
 
 		 338 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0278  putative sugar-binding protein  32.36 
 
 		 338 aa  152  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.396781  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0783  transcriptional regulator repressor  32.64 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2854  LacI family transcription regulator  31.47 
 
 		 391 aa  150  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7146  transcriptional regulator, LacI family  32.34 
 
 		 439 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5998  transcriptional regulator, LacI family  32.8 
 
 		 345 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  32.62 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  28.75 
 
 		 338 aa  137  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6569  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 347 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0434919  normal  0.571175 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6153  transcriptional regulator, LacI family  29.71 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.312144  hitchhiker  0.000597888 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5394  transcriptional regulator LacI family  33.14 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00772538  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4919  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.71 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.35548 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.16 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  30.52 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  27.05 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  31.01 
 
 		 343 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  27.54 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  31.6 
 
 		 362 aa  120  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  28.76 
 
 		 337 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  31.38 
 
 		 354 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3787  transcriptional regulator, LacI family  27.76 
 
 		 350 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  26.11 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  24.77 
 
 		 341 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  28.74 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  27.86 
 
 		 342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  32.21 
 
 		 353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1730  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0821566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  30.77 
 
 		 337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3659  transcriptional regulator, LacI family  36.59 
 
 		 343 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3492  transcriptional regulator, LacI family  27.89 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  31.9 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  28.92 
 
 		 338 aa  116  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2762  alanine racemase  27.27 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  26.27 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2621  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.93 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59427  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  27.24 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  31.47 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  30.89 
 
 		 346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1277  LacI family transcription regulator  32.04 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0780915  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  32.09 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0524  alanine racemase  30.38 
 
 		 339 aa  112  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  28.84 
 
 		 343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1376  alanine racemase  28.88 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  28.8 
 
 		 346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0419  transcriptional regulator, LacI family  27.76 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  30.59 
 
 		 353 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  28.78 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  29.97 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1282  LacI family transcription regulator  27.05 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000725073  normal  0.939834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4925  transcriptional regulator, LacI family  36.1 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.38 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  31.51 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  29.29 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  28.78 
 
 		 343 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  28.78 
 
 		 343 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  30.35 
 
 		 326 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  28.41 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  28.41 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3173  transcriptional regulator, LacI family  30.7 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.579609 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  28.41 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  24.13 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  28.41 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>