More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05070 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05070  putative LacI-family transcriptional regulator  100 
 
 		 339 aa  689    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.697537  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1404  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  63.45 
 
 		 343 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00377783  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1615  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  52.35 
 
 		 341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.820009  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01255  putative LacI-family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 341 aa  245  6e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06445  LacI family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5512  transcriptional regulator, LacI family  36.69 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0234887 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1259  alanine racemase  37.65 
 
 		 341 aa  219  6e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2837  transcriptional regulator, LacI family  35.86 
 
 		 344 aa  217  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672578  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1481  transcriptional regulator, LacI family  31.4 
 
 		 342 aa  213  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0779  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.39 
 
 		 342 aa  212  7e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.561354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5093  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 343 aa  212  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5702  transcriptional regulator, LacI family  32.45 
 
 		 343 aa  209  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  34.62 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4008  transcriptional regulator, LacI family  34.02 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000985107  hitchhiker  0.00000124933 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3654  LacI family transcription regulator  32.34 
 
 		 354 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3537  transcriptional regulator, LacI family  32.85 
 
 		 354 aa  202  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.234016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2261  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.48 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.276208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1248  transcriptional regulator, LacI family  34.08 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0782052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  32.44 
 
 		 343 aa  199  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0352  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4844  transcriptional regulator, LacI family  34.22 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0280353  hitchhiker  0.000467686 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1148  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.04 
 
 		 336 aa  193  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.907007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1464  transcriptional regulator, LacI family  33.86 
 
 		 340 aa  192  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4307  transcriptional regulator, LacI family  32.46 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.19442  normal  0.853045 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.41 
 
 		 336 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6639  transcriptional regulator, LacI family  30.47 
 
 		 337 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1526  transcriptional regulator, LacI family  34.81 
 
 		 353 aa  186  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.291045  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  32.05 
 
 		 349 aa  186  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2601  transcriptional regulator, LacI family  32.84 
 
 		 388 aa  185  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  33.63 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  33.63 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  33.92 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1990  alanine racemase  31.71 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  33.33 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  33.33 
 
 		 323 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  33.33 
 
 		 323 aa  176  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  33.33 
 
 		 323 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  33.04 
 
 		 323 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  32.74 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  30.54 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  34.41 
 
 		 338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  32.74 
 
 		 323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  32.74 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.59 
 
 		 356 aa  172  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4257  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6824  transcriptional regulator, LacI family  31.1 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.667333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3266  transcriptional regulator, LacI family  32.45 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.030441 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  31.96 
 
 		 340 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  30.47 
 
 		 332 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  32.06 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  34.07 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  32.1 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  32.75 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  32.65 
 
 		 346 aa  168  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.26 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.43 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  32.25 
 
 		 342 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3245  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1151  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.47 
 
 		 344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.848461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.66 
 
 		 333 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  31.66 
 
 		 333 aa  165  8e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  34.3 
 
 		 339 aa  165  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  33.83 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1423  transcriptional regulator, LacI family  30.79 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.189138 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00440  transcriptional regulator, LacI family  31.19 
 
 		 338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  33.55 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.94 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  29.94 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  29.62 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.17 
 
 		 352 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  30.06 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.65 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  30.36 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  30.38 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  28.02 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 346 aa  160  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  30.29 
 
 		 344 aa  159  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 342 aa  159  8e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  29.07 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  31.07 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  29.25 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  27.92 
 
 		 365 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  28.91 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  30.38 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  29.07 
 
 		 346 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  28.28 
 
 		 339 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1482  transcriptional regulator, LacI family  30.7 
 
 		 337 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7004  transcriptional regulator, LacI family  29.12 
 
 		 337 aa  155  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000759079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  28.32 
 
 		 358 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  29.67 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  28.02 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1821  LacI family transcription regulator  31.69 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  28.65 
 
 		 347 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  27.73 
 
 		 331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  26.1 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  28.02 
 
 		 353 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1559  alanine racemase  31.07 
 
 		 333 aa  153  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000066632  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  28.86 
 
 		 338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1713  transcriptional regulator, LacI family  30.06 
 
 		 326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>