More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0198 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0198  LacI family response repressor  100 
 
 		 368 aa  752    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.258556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1344  transcriptional regulator, LacI family  34.88 
 
 		 365 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0909  LacI family transcription regulator  34.3 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3659  transcriptional regulator, LacI family  35.19 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5001  LacI family transcription regulator  35.88 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282758  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2012  transcriptional regulator, LacI family  35.88 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0794313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1186  regulatory protein, LacI  35.47 
 
 		 339 aa  202  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1119  LacI family transcription regulator  35 
 
 		 347 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14780  transcriptional regulator  34.66 
 
 		 355 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.111834 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3513  LacI family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 337 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2253  transcriptional regulator, LacI family  34.88 
 
 		 343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862042 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1079  LacI family transcription regulator  34.88 
 
 		 347 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3723  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543452  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5637  LacI family transcription regulator  32.72 
 
 		 338 aa  175  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339737  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16820  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 385 aa  172  7.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0968844  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3896  LacI family transcription regulator  30.61 
 
 		 339 aa  168  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3330  transcriptional regulator, LacI family  31.59 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  0.198785 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5075  transcriptional regulator, LacI family  30.86 
 
 		 350 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4130  transcriptional regulator, LacI family  31.09 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04940  transcriptional regulator  30.68 
 
 		 363 aa  139  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  30.48 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1895  transcriptional regulator, LacI family  29.33 
 
 		 364 aa  136  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6179  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.85 
 
 		 284 aa  136  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4828  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.45 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1755  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.23 
 
 		 295 aa  134  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0701785 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1277  LacI family transcription regulator  31.1 
 
 		 344 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0780915  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4608  transcriptional regulator, LacI family  32.58 
 
 		 344 aa  132  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0524  alanine racemase  29.77 
 
 		 339 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1161  transcriptional regulator, LacI family  32.16 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  30.51 
 
 		 355 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 339 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  28.45 
 
 		 344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  27.78 
 
 		 338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.11 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  27.25 
 
 		 332 aa  126  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  27.62 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  26.22 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  29.15 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  28.07 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  27.43 
 
 		 335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1653  HTH-type transcriptional regulator  32.58 
 
 		 354 aa  119  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117705  hitchhiker  0.0000123229 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5490  transcriptional regulator, LacI family  28.24 
 
 		 337 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932078  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  29.03 
 
 		 342 aa  119  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0036  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.79 
 
 		 284 aa  119  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.020454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  27.75 
 
 		 353 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2275  transcriptional regulator, LacI family  28.7 
 
 		 342 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1434  transcriptional regulator, LacI family  25.95 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  28.99 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2854  LacI family transcription regulator  29.81 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  29.45 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  28.16 
 
 		 339 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3813  alanine racemase  28.09 
 
 		 340 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  27.76 
 
 		 341 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  25.71 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  28.45 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1282  LacI family transcription regulator  28.12 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000725073  normal  0.939834 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1111  LacI family transcription regulator  26.7 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0736  transcriptional regulator, LacI family  26.93 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  0.948547 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1207  alanine racemase  28.69 
 
 		 339 aa  113  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  26.53 
 
 		 382 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2939  alanine racemase  26.82 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3025  LacI family transcription regulator  28.97 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4438  transcriptional regulator, LacI family  26.8 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1019  LacI family transcription regulator  25.5 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0302  sugar-binding protein, putative  27.11 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  27.64 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0937  LacI family transcription regulator  27.45 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.266523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0278  putative sugar-binding protein  27.11 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.396781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  25 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2943  LacI family transcription regulator  28.69 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  24.86 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1073  regulatory protein, LacI  27.93 
 
 		 338 aa  111  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  30.03 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3122  LacI family transcription regulator  28.69 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  30.03 
 
 		 352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  26.65 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  28.41 
 
 		 331 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  26.3 
 
 		 335 aa  109  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  25.71 
 
 		 332 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  25.71 
 
 		 332 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1304  LacI family transcription regulator  26.82 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3516  LacI family transcription regulator  28.61 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  25.72 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  29.21 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2709  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.49 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6733  transcriptional regulator, LacI family  26.97 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  25.43 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  25.43 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  27.41 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  28.41 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0291  alanine racemase  30.45 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.910588 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3221  transcriptional regulator, LacI family  28.13 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  25.43 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  25.43 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  25.43 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  25.43 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  25.43 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  25.43 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  25.43 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1096  LacI family transcription regulator  27.81 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>