More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1344 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1344  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 365 aa  719    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2012  transcriptional regulator, LacI family  64.48 
 
 		 342 aa  428  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0794313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5001  LacI family transcription regulator  68.75 
 
 		 343 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282758  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1186  regulatory protein, LacI  63.77 
 
 		 339 aa  418  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2253  transcriptional regulator, LacI family  67.26 
 
 		 343 aa  411  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862042 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1079  LacI family transcription regulator  64.97 
 
 		 347 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000248753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3513  LacI family transcriptional regulator  56.68 
 
 		 337 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1119  LacI family transcription regulator  54.14 
 
 		 347 aa  331  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5637  LacI family transcription regulator  53.87 
 
 		 338 aa  326  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339737  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3659  transcriptional regulator, LacI family  54.4 
 
 		 343 aa  316  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0909  LacI family transcription regulator  49.68 
 
 		 338 aa  293  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14780  transcriptional regulator  48.08 
 
 		 355 aa  292  6e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.111834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3723  transcriptional regulator, LacI family  47.98 
 
 		 346 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543452  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16820  transcriptional regulator  45.72 
 
 		 385 aa  255  7e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0968844  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0198  LacI family response repressor  35.77 
 
 		 368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.258556  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0036  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.96 
 
 		 284 aa  216  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.020454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3896  LacI family transcription regulator  39.88 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3330  transcriptional regulator, LacI family  37.28 
 
 		 343 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  0.198785 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5075  transcriptional regulator, LacI family  40.25 
 
 		 350 aa  206  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1895  transcriptional regulator, LacI family  42.14 
 
 		 364 aa  203  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6179  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.88 
 
 		 284 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04940  transcriptional regulator  37.95 
 
 		 363 aa  199  6e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4130  transcriptional regulator, LacI family  40.77 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4828  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.41 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2275  transcriptional regulator, LacI family  38.31 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1755  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.59 
 
 		 295 aa  182  7e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0701785 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1161  transcriptional regulator, LacI family  38.01 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4608  transcriptional regulator, LacI family  39.41 
 
 		 344 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  35.4 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  32.74 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.97 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  27.6 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0736  transcriptional regulator, LacI family  32.16 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  0.948547 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  32.07 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  32 
 
 		 353 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  27.98 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  29.15 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.41 
 
 		 341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1653  HTH-type transcriptional regulator  31.85 
 
 		 354 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117705  hitchhiker  0.0000123229 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  30 
 
 		 331 aa  146  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  28.66 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  32.43 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  32.76 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  28.21 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  32.19 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  30.77 
 
 		 353 aa  143  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  29.47 
 
 		 342 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  32.34 
 
 		 339 aa  143  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 		 339 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  29.02 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0081  transcriptional regulator, LacI family  30.1 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  29.06 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  28.8 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  27.49 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  26.95 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  28.87 
 
 		 332 aa  139  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  30.56 
 
 		 339 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  29.94 
 
 		 348 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.43 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  27.62 
 
 		 342 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1662  LacI family transcription regulator  31.87 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2854  LacI family transcription regulator  30.14 
 
 		 391 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  28.57 
 
 		 332 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5490  transcriptional regulator, LacI family  31.79 
 
 		 337 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932078  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0197  LacI family transcription regulator  31.78 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01370  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 279 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  29.76 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  27.43 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  28.53 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  27.51 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  27.51 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  28.53 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  28.53 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  28.53 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  28.53 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  27.43 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.34 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  28.53 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  33.24 
 
 		 347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  27.51 
 
 		 332 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  31.78 
 
 		 355 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  28.21 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  28.16 
 
 		 347 aa  133  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  28.53 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  27.22 
 
 		 332 aa  133  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2445  LacI family transcription regulator  31.41 
 
 		 337 aa  133  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 		 336 aa  132  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  27.22 
 
 		 332 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2939  alanine racemase  30.81 
 
 		 340 aa  133  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7452  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 357 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.390478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  30.38 
 
 		 344 aa  132  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  29.71 
 
 		 368 aa  132  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  26.91 
 
 		 338 aa  132  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  27.22 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  28.25 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.27 
 
 		 330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3918  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>