More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2012 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2012  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 342 aa  676    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0794313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1186  regulatory protein, LacI  65.67 
 
 		 339 aa  430  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1344  transcriptional regulator, LacI family  64.48 
 
 		 365 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1079  LacI family transcription regulator  67.16 
 
 		 347 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5001  LacI family transcription regulator  64.09 
 
 		 343 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282758  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2253  transcriptional regulator, LacI family  61.88 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862042 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1119  LacI family transcription regulator  53.73 
 
 		 347 aa  341  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5637  LacI family transcription regulator  54.01 
 
 		 338 aa  335  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339737  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3513  LacI family transcriptional regulator  54.03 
 
 		 337 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14780  transcriptional regulator  50.73 
 
 		 355 aa  301  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.111834 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3659  transcriptional regulator, LacI family  50.32 
 
 		 343 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3723  transcriptional regulator, LacI family  48.84 
 
 		 346 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543452  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0909  LacI family transcription regulator  48.56 
 
 		 338 aa  286  4e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16820  transcriptional regulator  44.12 
 
 		 385 aa  230  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0968844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3330  transcriptional regulator, LacI family  39.04 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  0.198785 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3896  LacI family transcription regulator  40 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0036  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  44.36 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.020454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4130  transcriptional regulator, LacI family  42.22 
 
 		 344 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6179  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  44.4 
 
 		 284 aa  209  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0198  LacI family response repressor  35.88 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.258556  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2275  transcriptional regulator, LacI family  39.03 
 
 		 342 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04940  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4828  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.8 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1895  transcriptional regulator, LacI family  40.18 
 
 		 364 aa  188  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1161  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5075  transcriptional regulator, LacI family  36.13 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0736  transcriptional regulator, LacI family  35.67 
 
 		 354 aa  172  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  0.948547 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1755  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.03 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0701785 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.35 
 
 		 336 aa  167  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4608  transcriptional regulator, LacI family  36.89 
 
 		 344 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  30.65 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  27.08 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  31.66 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4888  LacI family transcription regulator  34.3 
 
 		 336 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.630665  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  27.62 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  27.46 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0292  transcriptional regulator, LacI family  35.76 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0032  Alanine racemase  35.31 
 
 		 329 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19154  normal  0.0639211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  29.17 
 
 		 340 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3611  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.39 
 
 		 345 aa  143  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  32.26 
 
 		 339 aa  143  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  31.38 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  28.02 
 
 		 337 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  30.27 
 
 		 340 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  29.45 
 
 		 362 aa  139  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 361 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1598  LacI family transcription regulator  26.41 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0971431  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  30.88 
 
 		 337 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  28.25 
 
 		 332 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  29.12 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  29.97 
 
 		 340 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 343 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  29.97 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  26.35 
 
 		 337 aa  136  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  28.53 
 
 		 336 aa  136  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3350  LacI family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 364 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  31.27 
 
 		 339 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  30.23 
 
 		 335 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  32.56 
 
 		 340 aa  135  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  26.69 
 
 		 335 aa  135  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1984  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.78 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.016252  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  31.98 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6854  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000835434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  27.6 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  28.99 
 
 		 339 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  30.77 
 
 		 336 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  28.4 
 
 		 331 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0197  LacI family transcription regulator  31.38 
 
 		 340 aa  132  7.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0274  alanine racemase  30.27 
 
 		 340 aa  132  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  30.03 
 
 		 340 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  28.23 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1096  LacI family transcription regulator  29.62 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3423  transcriptional regulator, LacI family  31.92 
 
 		 366 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0558625 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  26.84 
 
 		 343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  30.62 
 
 		 359 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  27.16 
 
 		 340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  27.84 
 
 		 336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  26.84 
 
 		 343 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01370  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  26.84 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04322  transcriptional regulator LacI family  31.14 
 
 		 355 aa  129  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  26.84 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  27.16 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  26.84 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  26.84 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  26.95 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1111  LacI family transcription regulator  30.03 
 
 		 339 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  26.84 
 
 		 340 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  28.61 
 
 		 337 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0116  transcriptional regulator, LacI family  32.76 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2498  transcriptional regulator, LacI family  35.78 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  30.56 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1662  LacI family transcription regulator  31.2 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  30.56 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0081  transcriptional regulator, LacI family  26.87 
 
 		 327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  26.65 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  29.94 
 
 		 355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  30.56 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>