More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1161 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1161  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
347 aa  669    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193058  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4130  transcriptional regulator, LacI family  61 
 
 
344 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3330  transcriptional regulator, LacI family  40.06 
 
 
343 aa  225  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  0.198785 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1119  LacI family transcription regulator  43.15 
 
 
347 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140598 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3659  transcriptional regulator, LacI family  42.23 
 
 
343 aa  222  8e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3896  LacI family transcription regulator  42.51 
 
 
339 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5637  LacI family transcription regulator  41.67 
 
 
338 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339737  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0909  LacI family transcription regulator  39.4 
 
 
338 aa  212  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2012  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 
342 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0794313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3513  LacI family transcriptional regulator  41.84 
 
 
337 aa  206  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3723  transcriptional regulator, LacI family  37.57 
 
 
346 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543452  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04940  transcriptional regulator  40.39 
 
 
363 aa  202  7e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1186  regulatory protein, LacI  39.88 
 
 
339 aa  199  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5075  transcriptional regulator, LacI family  40.06 
 
 
350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2275  transcriptional regulator, LacI family  43.85 
 
 
342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1344  transcriptional regulator, LacI family  38.01 
 
 
365 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5001  LacI family transcription regulator  39.71 
 
 
343 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282758  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14780  transcriptional regulator  39.53 
 
 
355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.111834 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1079  LacI family transcription regulator  40.48 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2253  transcriptional regulator, LacI family  40.83 
 
 
343 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862042 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  37.72 
 
 
348 aa  176  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31.15 
 
 
341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  36.52 
 
 
347 aa  172  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.88 
 
 
335 aa  170  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.14 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 
333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  36.31 
 
 
346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  34.42 
 
 
340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16820  transcriptional regulator  37.68 
 
 
385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0968844  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  36.02 
 
 
346 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 
343 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  33.23 
 
 
333 aa  162  9e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0036  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.21 
 
 
284 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.020454  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  37.5 
 
 
342 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.65 
 
 
335 aa  160  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  32.27 
 
 
334 aa  159  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  32.36 
 
 
335 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  34.31 
 
 
343 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  34.31 
 
 
343 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  34.31 
 
 
343 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1755  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.1 
 
 
295 aa  158  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0701785 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  30.79 
 
 
341 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  34.31 
 
 
343 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3970  LacI family transcription regulator  37.32 
 
 
348 aa  156  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  33.43 
 
 
336 aa  156  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.36 
 
 
335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.68 
 
 
336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  34.07 
 
 
346 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  30.99 
 
 
337 aa  155  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  34.28 
 
 
343 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0271  transcriptional regulator, LacI family  36.07 
 
 
342 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  33.82 
 
 
343 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  33.82 
 
 
343 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  34.88 
 
 
382 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 
329 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  34.11 
 
 
343 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13210  transcriptional regulator, LacI family  29.71 
 
 
345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  30.45 
 
 
337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  31.18 
 
 
336 aa  153  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  33.99 
 
 
346 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  35.36 
 
 
340 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  30.43 
 
 
335 aa  152  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  36.63 
 
 
337 aa  152  7e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  35.76 
 
 
340 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  35.65 
 
 
340 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  35 
 
 
338 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  32.1 
 
 
342 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4828  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.34 
 
 
286 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  31.96 
 
 
331 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 
337 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  34.37 
 
 
343 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.68 
 
 
337 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  34.37 
 
 
343 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  34.37 
 
 
343 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  35.48 
 
 
340 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.09 
 
 
337 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  37.28 
 
 
354 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 
332 aa  149  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  30.88 
 
 
334 aa  149  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.27 
 
 
342 aa  149  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0081  transcriptional regulator, LacI family  32.83 
 
 
327 aa  149  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  32.34 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0300  transcriptional regulator, LacI family  36.42 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  30.67 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  34.69 
 
 
353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  34.38 
 
 
338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  35.1 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  33.73 
 
 
368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  34.08 
 
 
343 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  36.76 
 
 
339 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  34.96 
 
 
342 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0198  LacI family response repressor  32.16 
 
 
368 aa  147  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.258556  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  35.19 
 
 
340 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  32.94 
 
 
338 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3025  transcriptional regulator, LacI family  36.93 
 
 
347 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6179  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.77 
 
 
284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  30.17 
 
 
337 aa  146  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  31.98 
 
 
331 aa  146  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  35.5 
 
 
331 aa  146  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>