More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1755 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1755  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  100 
 
 		 295 aa  598  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0701785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6179  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  47.79 
 
 		 284 aa  239  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4828  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  44.49 
 
 		 286 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0036  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.7 
 
 		 284 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.020454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3659  transcriptional regulator, LacI family  40.81 
 
 		 343 aa  202  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1119  LacI family transcription regulator  41.43 
 
 		 347 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140598 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0909  LacI family transcription regulator  38.65 
 
 		 338 aa  186  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5001  LacI family transcription regulator  39.04 
 
 		 343 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282758  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1344  transcriptional regulator, LacI family  37.59 
 
 		 365 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3513  LacI family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 337 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5637  LacI family transcription regulator  38.1 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339737  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1186  regulatory protein, LacI  38.8 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2253  transcriptional regulator, LacI family  38.91 
 
 		 343 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2012  transcriptional regulator, LacI family  36.03 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0794313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1079  LacI family transcription regulator  37.69 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04940  transcriptional regulator  35.86 
 
 		 363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14780  transcriptional regulator  34.91 
 
 		 355 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.111834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2275  transcriptional regulator, LacI family  36.3 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3896  LacI family transcription regulator  34.19 
 
 		 339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3723  transcriptional regulator, LacI family  38.71 
 
 		 346 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543452  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1161  transcriptional regulator, LacI family  36.63 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5075  transcriptional regulator, LacI family  34.53 
 
 		 350 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16820  transcriptional regulator  34.14 
 
 		 385 aa  146  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0968844  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4130  transcriptional regulator, LacI family  37.11 
 
 		 344 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01370  transcriptional regulator  34.47 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  34.78 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0198  LacI family response repressor  32.23 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.258556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3330  transcriptional regulator, LacI family  32.02 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  0.198785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  32.02 
 
 		 361 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  34.25 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 331 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.57 
 
 		 348 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1895  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 		 364 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 339 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  31.42 
 
 		 343 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  33.05 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  31.43 
 
 		 382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  31.1 
 
 		 335 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  31.68 
 
 		 338 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  29.96 
 
 		 340 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  31.09 
 
 		 344 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  32.37 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  33.05 
 
 		 335 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.2 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  31.62 
 
 		 333 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  32.95 
 
 		 348 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  30.3 
 
 		 340 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1434  transcriptional regulator, LacI family  31.68 
 
 		 338 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  30.6 
 
 		 357 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  28.68 
 
 		 338 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4608  transcriptional regulator, LacI family  31.85 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  26.84 
 
 		 338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  27.95 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2175  transcriptional regulator, LacI family  31.48 
 
 		 349 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.408939  normal  0.717598 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  30.54 
 
 		 355 aa  109  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.93 
 
 		 335 aa  109  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3491  transcriptional regulator, LacI family  33.94 
 
 		 349 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.201292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3965  Alanine racemase  33.58 
 
 		 338 aa  109  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.578436 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  28.68 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  31.95 
 
 		 334 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  29.41 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  30.15 
 
 		 473 aa  106  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1528  transcriptional regulator, LacI family  31.71 
 
 		 356 aa  106  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  30.51 
 
 		 329 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  30.8 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  29.77 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3324  LacI family transcription regulator  31.85 
 
 		 347 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370251  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6684  transcriptional regulator, LacI family  33.2 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.594008 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.43 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.3 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  29.69 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  27.67 
 
 		 332 aa  102  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  28.86 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.06 
 
 		 330 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.74 
 
 		 336 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  31.67 
 
 		 355 aa  102  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.06 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  26.06 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.49 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.49 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.06 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.49 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.49 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.49 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.06 
 
 		 343 aa  102  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  26.06 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.06 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.06 
 
 		 343 aa  102  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.06 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1050  transcriptional regulator, LacI family  32.06 
 
 		 335 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  28.68 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  28.29 
 
 		 344 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  31.18 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  29.15 
 
 		 339 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.3 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.3 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5384  transcriptional regulator, LacI family  29.06 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  27.31 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1905  LacI family transcription regulator  31.46 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1878  transcriptional regulator, LacI family  29.03 
 
 		 351 aa  99.8  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0941149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>