More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14780 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14780  transcriptional regulator  100 
 
 		 355 aa  701    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.111834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2012  transcriptional regulator, LacI family  50.73 
 
 		 342 aa  301  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0794313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5001  LacI family transcription regulator  50.44 
 
 		 343 aa  299  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282758  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1344  transcriptional regulator, LacI family  48.08 
 
 		 365 aa  292  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1119  LacI family transcription regulator  48.67 
 
 		 347 aa  285  5.999999999999999e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140598 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1186  regulatory protein, LacI  48.24 
 
 		 339 aa  279  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2253  transcriptional regulator, LacI family  50.3 
 
 		 343 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5637  LacI family transcription regulator  46.61 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339737  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3513  LacI family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 337 aa  263  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3659  transcriptional regulator, LacI family  46.33 
 
 		 343 aa  259  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3723  transcriptional regulator, LacI family  45.06 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543452  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1079  LacI family transcription regulator  47.06 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000248753 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0909  LacI family transcription regulator  44.55 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16820  transcriptional regulator  41.4 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0968844  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3896  LacI family transcription regulator  40.53 
 
 		 339 aa  220  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04940  transcriptional regulator  39.28 
 
 		 363 aa  208  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4130  transcriptional regulator, LacI family  42.15 
 
 		 344 aa  202  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0198  LacI family response repressor  34.66 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.258556  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2275  transcriptional regulator, LacI family  39.68 
 
 		 342 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0036  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.96 
 
 		 284 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.020454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4828  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.02 
 
 		 286 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6179  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.7 
 
 		 284 aa  179  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5075  transcriptional regulator, LacI family  36.16 
 
 		 350 aa  176  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1161  transcriptional regulator, LacI family  38.94 
 
 		 347 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3330  transcriptional regulator, LacI family  34.81 
 
 		 343 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  0.198785 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1755  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.91 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0701785 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1895  transcriptional regulator, LacI family  38.51 
 
 		 364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0736  transcriptional regulator, LacI family  34.48 
 
 		 354 aa  146  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  0.948547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3537  transcriptional regulator, LacI family  29.01 
 
 		 354 aa  145  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.234016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.45 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4608  transcriptional regulator, LacI family  35.43 
 
 		 344 aa  139  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7709  LacI family transcription regulator  35.87 
 
 		 337 aa  136  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  29.48 
 
 		 336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  29.97 
 
 		 336 aa  136  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  29.41 
 
 		 337 aa  135  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  34.3 
 
 		 340 aa  135  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  28.11 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  28.82 
 
 		 340 aa  132  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  28.53 
 
 		 335 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  26.3 
 
 		 341 aa  132  9e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2601  transcriptional regulator, LacI family  28.37 
 
 		 388 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  32.11 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.64 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  27.65 
 
 		 337 aa  129  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  33.52 
 
 		 341 aa  129  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  30.53 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1434  transcriptional regulator, LacI family  33.44 
 
 		 338 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  30.03 
 
 		 348 aa  126  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  31.89 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0197  LacI family transcription regulator  30.84 
 
 		 340 aa  126  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  27.67 
 
 		 341 aa  126  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  29.03 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4888  LacI family transcription regulator  32.56 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.630665  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  29.75 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03674  transcriptional regulator LacI family  30.86 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2939  alanine racemase  31.45 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  28.78 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  32.81 
 
 		 342 aa  123  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0819  transcriptional regulator, LacI family  32.87 
 
 		 348 aa  123  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1984  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.99 
 
 		 346 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.016252  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1755  LacI family transcription regulator  31.34 
 
 		 360 aa  123  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.998653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  27.64 
 
 		 337 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  31.34 
 
 		 382 aa  122  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  28.25 
 
 		 337 aa  122  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  28.74 
 
 		 340 aa  122  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1728  LacI family transcription regulator  32.15 
 
 		 348 aa  122  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531296  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1609  LacI family transcription regulator  31.83 
 
 		 356 aa  122  9e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  27.16 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3623  LacI family transcription regulator  31.07 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.039372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  30.11 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.75 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0274  alanine racemase  30.28 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4008  transcriptional regulator, LacI family  28.13 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000985107  hitchhiker  0.00000124933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  32.29 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1598  LacI family transcription regulator  23.82 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0971431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  32.68 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  30.14 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  27.91 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0524  alanine racemase  29.97 
 
 		 339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  27.43 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  31.31 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  31.73 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4706  transcriptional regulator, LacI family  29.76 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  26.98 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01370  transcriptional regulator  34.63 
 
 		 279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  31.71 
 
 		 333 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1662  LacI family transcription regulator  31.35 
 
 		 337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  30.81 
 
 		 340 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.22 
 
 		 337 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  31.75 
 
 		 347 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  30.86 
 
 		 346 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6389  transcriptional regulator, LacI family  32.48 
 
 		 342 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1069  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  27.88 
 
 		 328 aa  119  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.209088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0459  LacI family transcription regulator  32.19 
 
 		 340 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  28.78 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  31.14 
 
 		 346 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  31.09 
 
 		 346 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0881  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.81 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188257  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  28.13 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>