More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0736 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0736  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 354 aa  702    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  0.948547 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1895  transcriptional regulator, LacI family  45.51 
 
 		 364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3723  transcriptional regulator, LacI family  36.69 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543452  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5637  LacI family transcription regulator  36.42 
 
 		 338 aa  196  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339737  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3513  LacI family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1119  LacI family transcription regulator  35.61 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140598 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1186  regulatory protein, LacI  36.87 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0909  LacI family transcription regulator  33.86 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2012  transcriptional regulator, LacI family  35.67 
 
 		 342 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0794313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5001  LacI family transcription regulator  34.12 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282758  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1079  LacI family transcription regulator  35.17 
 
 		 347 aa  162  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000248753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3659  transcriptional regulator, LacI family  38.64 
 
 		 343 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1344  transcriptional regulator, LacI family  32.16 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1151  transcriptional regulator, LacI family  39.1 
 
 		 364 aa  149  9e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.274702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2253  transcriptional regulator, LacI family  34.32 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862042 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14780  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 355 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.111834 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5075  transcriptional regulator, LacI family  33.96 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3896  LacI family transcription regulator  32.54 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.19 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4130  transcriptional regulator, LacI family  34.81 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1161  transcriptional regulator, LacI family  32.74 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4608  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 344 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16820  transcriptional regulator  33.78 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0968844  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0036  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.98 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.020454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3330  transcriptional regulator, LacI family  30.3 
 
 		 343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  0.198785 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3611  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.78 
 
 		 345 aa  119  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2169  transcriptional regulator, LacI family  32.73 
 
 		 337 aa  116  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  31.99 
 
 		 361 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  29.82 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0198  LacI family response repressor  26.93 
 
 		 368 aa  114  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.258556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4888  LacI family transcription regulator  31.96 
 
 		 336 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.630665  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  26.22 
 
 		 336 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2720  transcriptional regulator, LacI family  31.79 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.687845  normal  0.476409 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04940  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  25.63 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0848  transcriptional regulator, LacI family  28.02 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  24.46 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.91 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.945809  hitchhiker  0.0011577 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0634  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  32.17 
 
 		 331 aa  109  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  29.81 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  26.73 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0755  LacI family transcription regulator  32.09 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  31.32 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  25.69 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2219  transcriptional regulator, LacI family  28.86 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000733875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6905  transcriptional regulator, LacI family  29.85 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00908765  hitchhiker  0.00367965 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  26.1 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  25.45 
 
 		 338 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0459  LacI family transcription regulator  31.1 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0524  alanine racemase  30.25 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2988  transcriptional regulator, LacI family  30.79 
 
 		 328 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1317  transcriptional regulator, LacI family  32.35 
 
 		 353 aa  106  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  25.96 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1609  LacI family transcription regulator  31.13 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  30.94 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  29.68 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  26.87 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0007  transcriptional regulator, LacI family  29.85 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3847  transcriptional regulator, LacI family  32.33 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3401  LacI family transcription regulator  29.73 
 
 		 367 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  23.38 
 
 		 342 aa  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0292  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  25.46 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  23.53 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5165  LacI family transcription regulator  29.04 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  29.45 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  27.38 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  29 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1069  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  28.57 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.209088 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  27.54 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  30.97 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1914  transcriptional regulator, LacI family  30.52 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.04666  normal  0.595127 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  24.38 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  29.52 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1242  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.87 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5235  LacI family transcription regulator  29.43 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3513  LacI family transcription regulator  27.44 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.98216  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1277  LacI family transcription regulator  29.45 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0780915  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  26.61 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  22.77 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  22.77 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  22.77 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2275  transcriptional regulator, LacI family  32 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3187  LacI family transcription regulator  29.54 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1653  HTH-type transcriptional regulator  31.82 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117705  hitchhiker  0.0000123229 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  22.77 
 
 		 343 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3965  transcriptional regulator AscG  27.7 
 
 		 350 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  23.08 
 
 		 340 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  28.53 
 
 		 379 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  22.77 
 
 		 343 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  22.77 
 
 		 343 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4590  LacI family transcription regulator  28.36 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6588  LacI family transcription regulator  31.01 
 
 		 342 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0385  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.18 
 
 		 354 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  22.77 
 
 		 340 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3350  LacI family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.42 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2555  transcriptional regulator, LacI family  31.27 
 
 		 369 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679604  normal  0.216267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>