More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16820 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_16820  transcriptional regulator  100 
 
 		 385 aa  754    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0968844  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0909  LacI family transcription regulator  45.66 
 
 		 338 aa  286  5e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3513  LacI family transcriptional regulator  47.38 
 
 		 337 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1344  transcriptional regulator, LacI family  45.75 
 
 		 365 aa  276  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1119  LacI family transcription regulator  47.86 
 
 		 347 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5637  LacI family transcription regulator  46.8 
 
 		 338 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339737  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5001  LacI family transcription regulator  46.36 
 
 		 343 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282758  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3659  transcriptional regulator, LacI family  44.09 
 
 		 343 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1186  regulatory protein, LacI  44.19 
 
 		 339 aa  259  7e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2012  transcriptional regulator, LacI family  44.15 
 
 		 342 aa  250  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0794313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2253  transcriptional regulator, LacI family  47.84 
 
 		 343 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862042 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14780  transcriptional regulator  41.36 
 
 		 355 aa  245  8e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.111834 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1079  LacI family transcription regulator  43.6 
 
 		 347 aa  242  7.999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3723  transcriptional regulator, LacI family  41.5 
 
 		 346 aa  232  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543452  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3896  LacI family transcription regulator  37.24 
 
 		 339 aa  229  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2275  transcriptional regulator, LacI family  39 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3330  transcriptional regulator, LacI family  40 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  0.198785 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5075  transcriptional regulator, LacI family  39.68 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04940  transcriptional regulator  37.36 
 
 		 363 aa  195  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0198  LacI family response repressor  34.76 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.258556  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0036  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.94 
 
 		 284 aa  186  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.020454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4828  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.02 
 
 		 286 aa  186  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4130  transcriptional regulator, LacI family  38.57 
 
 		 344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6179  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.58 
 
 		 284 aa  182  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1895  transcriptional regulator, LacI family  35.47 
 
 		 364 aa  169  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1161  transcriptional regulator, LacI family  37.83 
 
 		 347 aa  166  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4608  transcriptional regulator, LacI family  36.55 
 
 		 344 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1755  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.14 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0701785 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  32.33 
 
 		 333 aa  156  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  31.7 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  31.86 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  33.44 
 
 		 344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  29.48 
 
 		 340 aa  142  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  26.77 
 
 		 338 aa  142  8e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  31.95 
 
 		 355 aa  142  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  30.5 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0736  transcriptional regulator, LacI family  33.87 
 
 		 354 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  0.948547 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3970  LacI family transcription regulator  32.56 
 
 		 348 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  27.24 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  30.1 
 
 		 337 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  31.25 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  29.91 
 
 		 333 aa  136  7.000000000000001e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  31.88 
 
 		 353 aa  136  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  29.51 
 
 		 332 aa  136  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5761  transcriptional regulator, LacI family  31.9 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.079116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  32.84 
 
 		 334 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.15 
 
 		 336 aa  133  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  31.05 
 
 		 362 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  28.34 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  31.48 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2799  transcriptional regulator, LacI family  30.68 
 
 		 340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  26.1 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  30.67 
 
 		 329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.9 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  26.25 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  28.66 
 
 		 342 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1882  LacI family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.711539 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  29.87 
 
 		 473 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1653  HTH-type transcriptional regulator  32.74 
 
 		 354 aa  126  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117705  hitchhiker  0.0000123229 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  28.28 
 
 		 331 aa  127  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  33.98 
 
 		 336 aa  126  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  30.68 
 
 		 358 aa  126  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  26.37 
 
 		 355 aa  126  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 339 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  30.55 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  26.6 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  26.98 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  27.78 
 
 		 330 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0280  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.923594  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  28.95 
 
 		 343 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  28.36 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  30.64 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0081  transcriptional regulator, LacI family  29.9 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  32.81 
 
 		 348 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3918  LacI family transcription regulator  31.34 
 
 		 351 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3423  transcriptional regulator, LacI family  31.15 
 
 		 366 aa  123  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0558625 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  32.36 
 
 		 343 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.12 
 
 		 348 aa  123  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1687  LacI family transcription regulator  29.49 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.142395 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2545  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.48 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  28.74 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  28.34 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  25.32 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  29.41 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0459  LacI family transcription regulator  28.61 
 
 		 340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03609  transcriptional regulator LacI family  31.41 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.34339  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  27.57 
 
 		 338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3537  transcriptional regulator, LacI family  26.21 
 
 		 354 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.234016 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0049  transcriptional regulator, LacI family  26.86 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.825102  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  29.19 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  26.11 
 
 		 336 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  26.69 
 
 		 333 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  26.45 
 
 		 336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04322  transcriptional regulator LacI family  30.03 
 
 		 355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  29.64 
 
 		 349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3351  LacI family transcription regulator  28.8 
 
 		 354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  decreased coverage  0.0034898 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1528  transcriptional regulator, LacI family  30.42 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  27.99 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>